More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1571 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1571  malate dehydrogenase  100 
 
 		 309 aa  613  9.999999999999999e-175  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  unclonable  0.0000000000000156495 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0612  malate dehydrogenase  89.94 
 
 		 309 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000000109591 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1509  malate dehydrogenase  86.69 
 
 		 308 aa  550  1e-156  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.195418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1699  malate dehydrogenase  84.09 
 
 		 309 aa  543  1e-153  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000446484 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1675  malate dehydrogenase  61.69 
 
 		 309 aa  423  1e-117  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0291374  normal  0.817536 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0338  malate dehydrogenase  45.54 
 
 		 304 aa  279  5e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0912  malate dehydrogenase, NAD-dependent  44.04 
 
 		 312 aa  263  2e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0881394  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1748  malate dehydrogenase  44.88 
 
 		 307 aa  260  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.747056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2178  malate dehydrogenase, NAD-dependent  44.63 
 
 		 326 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00838959 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1029  malate dehydrogenase  41.91 
 
 		 310 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758057  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0451  malate dehydrogenase  40.26 
 
 		 307 aa  253  3e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0428  malate dehydrogenase  40.92 
 
 		 307 aa  253  3e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4496  malate dehydrogenase, NAD-dependent  42.33 
 
 		 313 aa  252  5.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.794515 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_393  malate dehydrogenase, NAD-dependent  39.93 
 
 		 308 aa  252  5.000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.871516  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1121  malate dehydrogenase  39.6 
 
 		 309 aa  250  3e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0022  malate dehydrogenase  42.17 
 
 		 321 aa  249  4e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4459  malate dehydrogenase, NAD-dependent  39.8 
 
 		 309 aa  247  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.688925 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0864  malate dehydrogenase, NAD-dependent  39 
 
 		 312 aa  247  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343298 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2677  malate dehydrogenase  41.64 
 
 		 312 aa  246  3e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0862  malate dehydrogenase  41.28 
 
 		 310 aa  246  3e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0390301  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0522  malate dehydrogenase, NAD-dependent  42.95 
 
 		 320 aa  246  4e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0539  malate dehydrogenase, NAD-dependent  42.95 
 
 		 320 aa  246  4e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1450  malate dehydrogenase, NAD-dependent  40.26 
 
 		 333 aa  245  6.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0930  malate dehydrogenase  41.23 
 
 		 320 aa  244  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0187  malate dehydrogenase  41.23 
 
 		 322 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433088  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2185  malate dehydrogenase  41.58 
 
 		 312 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1121  malate dehydrogenase  38.64 
 
 		 316 aa  244  1.9999999999999999e-63  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0783  malate dehydrogenase  40.98 
 
 		 312 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1856  malate dehydrogenase  40.91 
 
 		 320 aa  243  3e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3276  malate dehydrogenase  40.98 
 
 		 312 aa  243  3e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1587  malate dehydrogenase, NAD-dependent  42.21 
 
 		 320 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.295644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2374  malate dehydrogenase, NAD-dependent  40.59 
 
 		 311 aa  242  6e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1273  malate dehydrogenase  41 
 
 		 324 aa  241  9e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.570878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1689  Lactate/malate dehydrogenase  38.16 
 
 		 310 aa  241  1e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.444612  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2255  malate dehydrogenase  35.86 
 
 		 311 aa  241  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0535  malate dehydrogenase  41.88 
 
 		 322 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1927  malate dehydrogenase  40.58 
 
 		 320 aa  240  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0281  malate dehydrogenase  41.56 
 
 		 322 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1626  malate dehydrogenase  42.57 
 
 		 312 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2193  malate dehydrogenase  41.21 
 
 		 318 aa  239  4e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000748395  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1510  malate dehydrogenase  39.27 
 
 		 310 aa  239  4e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0354026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1088  malate dehydrogenase, NAD-dependent  37.13 
 
 		 316 aa  239  4e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00100592  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0153  malate dehydrogenase  40.91 
 
 		 321 aa  239  5.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1466  malate dehydrogenase  41.03 
 
 		 317 aa  238  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0862702  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1140  malate dehydrogenase, NAD-dependent  38.49 
 
 		 307 aa  237  1e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.208998  normal  0.907929 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0545  malate dehydrogenase  41.23 
 
 		 322 aa  238  1e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.557349  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3395  malate dehydrogenase  39.61 
 
 		 321 aa  237  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0194  malate dehydrogenase  40.58 
 
 		 322 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2322  malate dehydrogenase  42.24 
 
 		 312 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0749738  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2327  malate dehydrogenase  39.74 
 
 		 317 aa  236  3e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000213554  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2234  malate dehydrogenase  42.24 
 
 		 312 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4206  malate dehydrogenase  38.94 
 
 		 314 aa  236  5.0000000000000005e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1360  malate dehydrogenase  41.03 
 
 		 317 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000756192  hitchhiker  0.0000000000000730576 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1867  malate dehydrogenase  39.6 
 
 		 308 aa  235  6e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00765461  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4422  malate dehydrogenase  39.67 
 
 		 312 aa  235  8e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4702  malate dehydrogenase  39.34 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4723  malate dehydrogenase  39.34 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4718  malate dehydrogenase  39.34 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4486  malate dehydrogenase  39.34 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4321  malate dehydrogenase  39.34 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4837  malate dehydrogenase  39.34 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0536  malate dehydrogenase  39.34 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00988703 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4707  malate dehydrogenase  39.34 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000597561 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0347  malate dehydrogenase  39.02 
 
 		 313 aa  234  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.536254  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4333  malate dehydrogenase  39.34 
 
 		 312 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0419  malate dehydrogenase  40.91 
 
 		 322 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.425489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4129  malate dehydrogenase  40.58 
 
 		 320 aa  233  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1037  malate dehydrogenase  40.89 
 
 		 318 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.217027  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0392  malate dehydrogenase  40.26 
 
 		 322 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293299  normal  0.208989 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1325  malate dehydrogenase  40.71 
 
 		 317 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000410815 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1951  malate dehydrogenase (NAD)  38 
 
 		 308 aa  231  9e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.800681 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0253  malate dehydrogenase  38.94 
 
 		 309 aa  231  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.041825  normal  0.0135962 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1900  malate dehydrogenase  39.93 
 
 		 310 aa  230  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5970  malate dehydrogenase, NAD-dependent  41.75 
 
 		 310 aa  230  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0284223  normal  0.475687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1925  malate dehydrogenase, NAD-dependent  40.58 
 
 		 320 aa  230  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.282591  normal  0.451174 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1643  malate dehydrogenase, NAD-dependent  40.58 
 
 		 320 aa  230  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160131  normal  0.329919 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0283  malate dehydrogenase  38.94 
 
 		 309 aa  229  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5004  malate dehydrogenase  40.58 
 
 		 320 aa  229  5e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2900  malate dehydrogenase  40.71 
 
 		 317 aa  228  7e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000048511  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0832  malate dehydrogenase  37.95 
 
 		 310 aa  228  8e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1589  malate dehydrogenase  38.91 
 
 		 316 aa  228  8e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0268739 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0956  malate dehydrogenase, NAD-dependent  38.24 
 
 		 315 aa  227  1e-58  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1722  malate dehydrogenase  39.55 
 
 		 316 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2226  malate dehydrogenase  39.55 
 
 		 316 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.773058  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3685  malate dehydrogenase  40.58 
 
 		 320 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3974  malate dehydrogenase  40.58 
 
 		 320 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.342256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1649  malate dehydrogenase  39.55 
 
 		 316 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1713  malate dehydrogenase  39.6 
 
 		 310 aa  226  3e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.905202  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0398  malate dehydrogenase  37.99 
 
 		 313 aa  226  3e-58  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08746  malate dehydrogenase  35.86 
 
 		 308 aa  226  3e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1210  malate dehydrogenase  40.39 
 
 		 318 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.771205  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2290  malate dehydrogenase  39.93 
 
 		 309 aa  225  7e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.974079 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1603  malate dehydrogenase  39.93 
 
 		 310 aa  225  8e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1182  malate dehydrogenase  38.31 
 
 		 320 aa  225  8e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.333007  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1300  malate dehydrogenase  37.38 
 
 		 320 aa  225  9e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1625  malate dehydrogenase  39.87 
 
 		 321 aa  225  9e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000635356  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2802  malate dehydrogenase, NAD-dependent  36.93 
 
 		 311 aa  224  1e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3020  malate dehydrogenase (NAD)  37.29 
 
 		 312 aa  224  1e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2944  malate dehydrogenase  40.26 
 
 		 320 aa  224  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.533999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0605  malate dehydrogenase  40.06 
 
 		 332 aa  223  3e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>