More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1359 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1735  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  74.25 
 
 		 604 aa  942    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.718005  hitchhiker  0.000823973 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1359  DNA topoisomerase  100 
 
 		 602 aa  1231    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.013738 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1115  DNA topoisomerase  74.83 
 
 		 596 aa  912    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0392  DNA topoisomerase  74.58 
 
 		 604 aa  951    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.225119  normal  0.175863 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0109  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  50.08 
 
 		 610 aa  568  1e-160  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000681889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0885  DNA topoisomerase  46.68 
 
 		 631 aa  527  1e-148  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0843416  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2128  DNA topoisomerase, type I  35.55 
 
 		 855 aa  348  2e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.572238 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0705  DNA topoisomerase  34.26 
 
 		 780 aa  330  4e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0595  DNA topoisomerase I  33.67 
 
 		 744 aa  310  4e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1964  DNA topoisomerase I  34.8 
 
 		 702 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1139  DNA topoisomerase type IA central domain protein  32.6 
 
 		 849 aa  300  7e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.395203 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23450  topoisomerase IA  32.15 
 
 		 837 aa  298  2e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000217154  decreased coverage  0.0000000285044 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1011  DNA topoisomerase  33.39 
 
 		 931 aa  287  4e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0783808  normal  0.0479859 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0335  DNA topoisomerase I  32.73 
 
 		 747 aa  285  2.0000000000000002e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2410  DNA topoisomerase I  30.69 
 
 		 771 aa  282  2e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.11035 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0095  DNA topoisomerase I  30.76 
 
 		 743 aa  277  3e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000317173  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0859  DNA topoisomerase  33.78 
 
 		 942 aa  277  4e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.293507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2461  DNA topoisomerase  30.59 
 
 		 843 aa  277  4e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1458  DNA topoisomerase I  31.81 
 
 		 827 aa  276  8e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1093  DNA topoisomerase type IA central domain protein  30.12 
 
 		 837 aa  275  2.0000000000000002e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47417  predicted protein  32.99 
 
 		 1009 aa  273  5.000000000000001e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143888  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3010  DNA topoisomerase I  30.83 
 
 		 863 aa  271  2e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1139  hypothetical protein  31.54 
 
 		 935 aa  271  2e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2731  DNA topoisomerase I  30.68 
 
 		 844 aa  271  2.9999999999999997e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186723  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0770  DNA topoisomerase  33.45 
 
 		 931 aa  270  4e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0112956  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1299  DNA topoisomerase type IA central domain protein  34.4 
 
 		 938 aa  270  8e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.596273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0259  DNA topoisomerase type IA central domain protein  30.75 
 
 		 864 aa  263  8.999999999999999e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09220  topoisomerase IA  31.4 
 
 		 834 aa  263  1e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.143894  normal  0.0154062 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8810  DNA topoisomerase  32.88 
 
 		 868 aa  260  5.0000000000000005e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.917921  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34564  DNA topoisomerase  30.56 
 
 		 616 aa  258  2e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.496706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32265  predicted protein  33.22 
 
 		 863 aa  257  5e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142978  normal  0.982566 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00400  DNA topoisomerase type I, putative  30.44 
 
 		 828 aa  256  9e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.772015  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04555  DNA topoisomerase III (Eurofung)  29.86 
 
 		 629 aa  256  1.0000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.755081  normal  0.215917 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33842  predicted protein  32.5 
 
 		 641 aa  255  2.0000000000000002e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0781  DNA topoisomerase I  27.51 
 
 		 812 aa  217  5.9999999999999996e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.935548  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0158  DNA topoisomerase I  26.84 
 
 		 817 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.087887  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1699  DNA topoisomerase I  26.55 
 
 		 814 aa  213  1e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0026  DNA topoisomerase I  25.57 
 
 		 853 aa  208  2e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0203  DNA topoisomerase I  26.54 
 
 		 814 aa  208  2e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.698596 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1889  DNA topoisomerase I  26.87 
 
 		 668 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.806156  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1901  DNA topoisomerase I  28.28 
 
 		 896 aa  174  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164413  normal  0.306298 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1660  DNA topoisomerase I  28.49 
 
 		 892 aa  173  7.999999999999999e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000915276  normal  0.794129 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1335  DNA topoisomerase I  24.18 
 
 		 691 aa  172  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.419976  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1310  DNA topoisomerase I  24.18 
 
 		 691 aa  172  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0393  DNA topoisomerase I  27.83 
 
 		 884 aa  172  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000925228  unclonable  0.0000000013775 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1655  DNA topoisomerase I  27.72 
 
 		 869 aa  169  9e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.967668  normal  0.788315 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  25.93 
 
 		 751 aa  169  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1583  DNA topoisomerase I  28.79 
 
 		 868 aa  168  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.590699 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  26.48 
 
 		 689 aa  167  4e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1679  DNA topoisomerase I  27.55 
 
 		 869 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229175 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2139  DNA topoisomerase I  27.55 
 
 		 869 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.124713 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3603  DNA topoisomerase I  27.55 
 
 		 869 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0171104  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2148  DNA topoisomerase I  27.78 
 
 		 868 aa  164  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25110  DNA topoisomerase I  27.78 
 
 		 868 aa  163  9e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3876  DNA topoisomerase I  28.68 
 
 		 876 aa  160  8e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198302  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2463  DNA topoisomerase I  26.21 
 
 		 804 aa  159  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0916  DNA topoisomerase I  26.54 
 
 		 693 aa  159  1e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000916095  hitchhiker  0.000814664 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0011  DNA topoisomerase I  25.08 
 
 		 760 aa  159  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1678  DNA topoisomerase I  25.23 
 
 		 700 aa  158  3e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0109  DNA topoisomerase I  27.36 
 
 		 799 aa  157  7e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1854  DNA topoisomerase I  24.96 
 
 		 700 aa  156  1e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  27.36 
 
 		 696 aa  155  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2741  DNA topoisomerase I  25.65 
 
 		 746 aa  155  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.123661  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0914  DNA topoisomerase I  26.97 
 
 		 868 aa  155  2.9999999999999998e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02352  DNA topoisomerase I  28.07 
 
 		 886 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.346512  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14470  DNA topoisomerase I  27.43 
 
 		 868 aa  154  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2445  DNA topoisomerase I  25.97 
 
 		 758 aa  154  5.9999999999999996e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000450772  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2296  DNA topoisomerase I  25.38 
 
 		 704 aa  154  5.9999999999999996e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1021  DNA topoisomerase I  25.18 
 
 		 669 aa  153  8e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0905515  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3437  DNA topoisomerase I  25.94 
 
 		 872 aa  153  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.500167 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0161  DNA topoisomerase I  24.45 
 
 		 695 aa  152  1e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1803  DNA topoisomerase I  26.58 
 
 		 859 aa  152  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.120095  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2224  DNA topoisomerase I  27.22 
 
 		 898 aa  153  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.648811  hitchhiker  0.00821912 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2230  DNA topoisomerase I  25.18 
 
 		 694 aa  153  1e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0460  DNA topoisomerase I  25 
 
 		 702 aa  153  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.159815  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2058  DNA topoisomerase I  24.61 
 
 		 700 aa  153  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2520  DNA topoisomerase III  26.04 
 
 		 697 aa  152  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1526  DNA topoisomerase I  25.2 
 
 		 696 aa  152  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000864041  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  24.8 
 
 		 691 aa  152  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2842  DNA topoisomerase I  25.97 
 
 		 798 aa  151  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2015  DNA topoisomerase I  26.35 
 
 		 866 aa  152  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00844458  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2069  DNA topoisomerase I  24.48 
 
 		 758 aa  151  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3514  DNA topoisomerase I  27.52 
 
 		 869 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2316  DNA topoisomerase I  26.15 
 
 		 866 aa  151  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.105291  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0779  DNA topoisomerase I  24.02 
 
 		 706 aa  151  4e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000394767  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2356  DNA topoisomerase I  25.69 
 
 		 879 aa  150  6e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0613436  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2100  DNA topoisomerase I  24.91 
 
 		 765 aa  150  6e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000378679  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3287  DNA topoisomerase I  27.59 
 
 		 870 aa  150  7e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0816  DNA topoisomerase I  23.78 
 
 		 689 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.996687  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9223  DNA topoisomerase  25.82 
 
 		 883 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1956  DNA topoisomerase I  24.04 
 
 		 700 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1322  DNA topoisomerase I  27.88 
 
 		 872 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.425671  normal  0.143441 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1535  DNA topoisomerase I  26.97 
 
 		 896 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.351865  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1585  DNA topoisomerase I  27.29 
 
 		 894 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.328544  normal  0.0409432 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1972  DNA topoisomerase I  26.96 
 
 		 898 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2073  DNA topoisomerase I  25.71 
 
 		 802 aa  148  3e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1474  DNA topoisomerase I  26.33 
 
 		 865 aa  148  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00320061  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1729  DNA topoisomerase I  27.18 
 
 		 894 aa  148  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0724746 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0528  DNA topoisomerase I  23.88 
 
 		 776 aa  148  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000697651  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1146  DNA topoisomerase I  27.49 
 
 		 879 aa  147  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368466  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>