37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1339 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1339  hypothetical protein  100 
 
 
335 aa  682    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00496321  normal  0.353078 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1755  hypothetical protein  70.61 
 
 
330 aa  490  1e-137  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.387816  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0372  hypothetical protein  65.65 
 
 
333 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.153205 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1136  hypothetical protein  66.46 
 
 
329 aa  466  9.999999999999999e-131  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.345385 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1090  hypothetical protein  44.21 
 
 
350 aa  265  7e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.399019  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0867  hypothetical protein  36.83 
 
 
353 aa  164  3e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.530638  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1550  hypothetical protein  26.84 
 
 
337 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.590415  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1667  hypothetical protein  25.63 
 
 
337 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.251893  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0246  hypothetical protein  25.87 
 
 
337 aa  116  5e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0961  hypothetical protein  25.55 
 
 
337 aa  116  6e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2214  protein of unknown function DUF354  26.57 
 
 
354 aa  107  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0844  hypothetical protein  25.81 
 
 
338 aa  106  5e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.504464  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1618  hypothetical protein  26.79 
 
 
356 aa  100  3e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.783063  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0093  hypothetical protein  25.23 
 
 
350 aa  95.1  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0978162 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1596  protein of unknown function DUF354  27.02 
 
 
358 aa  92.8  7e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1392  hypothetical protein  34.06 
 
 
860 aa  92.4  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0185  hypothetical protein  25.5 
 
 
350 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1064  protein of unknown function DUF354  27.54 
 
 
353 aa  83.2  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1073  protein of unknown function DUF354  28.34 
 
 
349 aa  79  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.266744  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3188  protein of unknown function DUF354  26.88 
 
 
349 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2863  hypothetical protein  29.33 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0085  protein of unknown function DUF354  27.73 
 
 
342 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0053  hypothetical protein  22.89 
 
 
363 aa  72  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0959  hypothetical protein  25.54 
 
 
368 aa  67.4  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.107791  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2021  hypothetical protein  22.74 
 
 
347 aa  67  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0255  hypothetical protein  27.97 
 
 
340 aa  63.2  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0834  protein of unknown function DUF354  23.81 
 
 
361 aa  61.6  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0488411  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2590  hypothetical protein  30.65 
 
 
341 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1117  hypothetical protein  23.51 
 
 
357 aa  57.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5262  protein of unknown function DUF354  26.58 
 
 
369 aa  56.2  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101581  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2023  protein of unknown function DUF354  26.61 
 
 
379 aa  55.1  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0244531  normal  0.923484 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0197  hypothetical protein  23.61 
 
 
374 aa  53.5  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00000153043  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0720  hypothetical protein  23.1 
 
 
344 aa  48.9  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0102669  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1140  protein of unknown function DUF354  24.69 
 
 
369 aa  46.6  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0489  protein of unknown function DUF354  22.71 
 
 
355 aa  45.4  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3286  protein of unknown function DUF354  26.14 
 
 
355 aa  43.5  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.401712  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2496  protein of unknown function DUF354  26.49 
 
 
381 aa  42.7  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>