More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1337 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1337  nucleotidyl transferase  100 
 
 
228 aa  456  1e-127  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0683407  normal  0.343314 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1757  nucleotidyl transferase  82.46 
 
 
228 aa  397  9.999999999999999e-111  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0370  nucleotidyl transferase  84.44 
 
 
227 aa  397  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.357076 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1138  nucleotidyl transferase  83.77 
 
 
227 aa  396  1e-109  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1489  nucleotidyl transferase  71.49 
 
 
230 aa  330  8e-90  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.523541  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0492  nucleotidyl transferase  70.59 
 
 
230 aa  317  9e-86  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000162703 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0999  nucleotidyl transferase  59.39 
 
 
237 aa  268  5.9999999999999995e-71  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.335464  normal  0.356487 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0287  Nucleotidyl transferase  45.78 
 
 
234 aa  218  8.999999999999998e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1857  nucleotidyl transferase  50.45 
 
 
220 aa  211  1e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.58805 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0843  nucleotidyl transferase  44.29 
 
 
222 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000793597 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  41.28 
 
 
349 aa  165  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0708  Nucleotidyl transferase  45.11 
 
 
334 aa  162  4.0000000000000004e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.509912  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  38.14 
 
 
361 aa  159  3e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  38.14 
 
 
361 aa  159  3e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  37.29 
 
 
361 aa  156  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  39.46 
 
 
820 aa  154  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  42.42 
 
 
370 aa  154  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3317  Nucleotidyl transferase  40.99 
 
 
243 aa  152  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  41.56 
 
 
370 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  37.95 
 
 
830 aa  148  5e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  36.6 
 
 
841 aa  149  5e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  35.96 
 
 
348 aa  148  9e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  37.72 
 
 
854 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2143  putative guanyltransferase  40 
 
 
240 aa  146  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.187528  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4077  nucleotidyl transferase  38.7 
 
 
238 aa  144  8.000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.957763  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  37.78 
 
 
835 aa  143  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1584  nucleotidyl transferase  39.15 
 
 
238 aa  143  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  42.16 
 
 
366 aa  143  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  36.32 
 
 
816 aa  142  5e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0744  nucleotidyl transferase  40 
 
 
364 aa  141  9e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.196844 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  36.97 
 
 
820 aa  140  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  33.61 
 
 
832 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1624  nucleotidyl transferase  39.56 
 
 
367 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  36.44 
 
 
818 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  37.9 
 
 
810 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1968  nucleotidyltransferase family protein  43.48 
 
 
476 aa  139  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3178  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  35.96 
 
 
836 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.335265 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3175  Nucleotidyl transferase  36.24 
 
 
245 aa  138  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.673633  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  35.93 
 
 
399 aa  138  8.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  38.22 
 
 
818 aa  137  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  39.32 
 
 
392 aa  136  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  33.76 
 
 
832 aa  136  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  34.04 
 
 
833 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  37.16 
 
 
712 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1855  Nucleotidyl transferase  36.44 
 
 
370 aa  136  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0541  nucleotidyl transferase  37.91 
 
 
238 aa  135  5e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  36.36 
 
 
392 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4031  nucleotidyl transferase  35.37 
 
 
245 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  35.29 
 
 
833 aa  134  8e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  37.86 
 
 
835 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  35.47 
 
 
834 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  34.65 
 
 
836 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  35.56 
 
 
830 aa  133  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  32.88 
 
 
784 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  32.88 
 
 
784 aa  132  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  32.88 
 
 
784 aa  132  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  35.45 
 
 
832 aa  133  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  32.88 
 
 
784 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  32.88 
 
 
784 aa  132  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  37.05 
 
 
828 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  36.13 
 
 
347 aa  132  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5131  Nucleotidyl transferase  37.05 
 
 
243 aa  132  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.963114 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  35.94 
 
 
827 aa  132  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  36.16 
 
 
842 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05586  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (EC 2.7.7.13)(GTP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase)(GDP-mannose pyrophosphorylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B1J4]  39.91 
 
 
364 aa  132  6e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  41.09 
 
 
370 aa  132  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  34.2 
 
 
828 aa  132  6e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  34.5 
 
 
821 aa  132  6e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  32.43 
 
 
784 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
784 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  34.17 
 
 
843 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5876  nucleotidyl transferase  38.99 
 
 
357 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.624445  normal  0.732322 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  31.72 
 
 
784 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  32.43 
 
 
784 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  34.65 
 
 
835 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  31.72 
 
 
784 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1374  mannose-1-phosphate guanyltransferase  37.61 
 
 
364 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3557  nucleotidyl transferase  40.44 
 
 
238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  33.33 
 
 
842 aa  129  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  37.81 
 
 
835 aa  129  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  37.76 
 
 
828 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4080  Nucleotidyl transferase  38.71 
 
 
351 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0885  Nucleotidyl transferase  35.93 
 
 
229 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  36.36 
 
 
392 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  34.63 
 
 
836 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1729  nucleotidyl transferase  36.12 
 
 
359 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442987  normal  0.868818 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06180  Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase family protein  38.53 
 
 
359 aa  129  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0622435  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  35.53 
 
 
840 aa  128  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4822  nucleotidyl transferase  36.56 
 
 
326 aa  128  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  35.82 
 
 
842 aa  128  8.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3465  Nucleotidyl transferase  33.77 
 
 
836 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  33.98 
 
 
785 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4734  nucleotidyl transferase  35.68 
 
 
359 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261092  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  33.77 
 
 
841 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  34.21 
 
 
842 aa  126  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  32.33 
 
 
828 aa  126  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  34.98 
 
 
843 aa  126  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1064  Nucleotidyl transferase  36.28 
 
 
363 aa  125  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0598  nucleotidyl transferase  34.04 
 
 
348 aa  125  5e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.534705  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  36 
 
 
776 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>