More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1283 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  100 
 
 
409 aa  830    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  70.86 
 
 
396 aa  529  1e-149  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0216  periplasmic binding protein  71.77 
 
 
393 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.941778  normal  0.148136 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  65.82 
 
 
689 aa  489  1e-137  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  65.82 
 
 
688 aa  490  1e-137  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1424  periplasmic binding protein  47.86 
 
 
374 aa  329  6e-89  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.813522  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  43.9 
 
 
378 aa  316  4e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  45.98 
 
 
374 aa  316  6e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1466  periplasmic binding protein  45.82 
 
 
369 aa  309  5.9999999999999995e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0440112  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  46.27 
 
 
358 aa  305  9.000000000000001e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  47.02 
 
 
358 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  46.42 
 
 
381 aa  295  1e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0427  periplasmic binding protein  44.35 
 
 
373 aa  280  3e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0410  periplasmic binding protein  44.35 
 
 
373 aa  279  7e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.579049  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1493  periplasmic binding protein  42.3 
 
 
386 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.277986  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  42.26 
 
 
372 aa  271  1e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0251  periplasmic binding protein  42.36 
 
 
369 aa  256  6e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0411  periplasmic binding protein  37.33 
 
 
374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  39.34 
 
 
373 aa  251  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1494  periplasmic binding protein  37.54 
 
 
374 aa  250  3e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00826016  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3056  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  40.96 
 
 
369 aa  249  6e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0424  periplasmic binding protein  38.17 
 
 
373 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.212243  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0425  periplasmic binding protein  38.17 
 
 
365 aa  242  7e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.264248  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1622  iron transport periplasmic binding protein  38.69 
 
 
370 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000308392  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  36.05 
 
 
401 aa  230  4e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  34.97 
 
 
403 aa  229  5e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  35.09 
 
 
401 aa  227  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  38.22 
 
 
375 aa  228  2e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1047  Fe3+-hydroxamate binding protein  39.29 
 
 
370 aa  227  3e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.271921  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2328  periplasmic binding protein  38.18 
 
 
384 aa  226  6e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2329  periplasmic binding protein  37.61 
 
 
384 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  36.42 
 
 
372 aa  218  1e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  38.6 
 
 
390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2147  periplasmic binding protein  37.39 
 
 
387 aa  211  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.985671  normal  0.111935 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  35.6 
 
 
375 aa  208  1e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0998  iron ABC transporter, solute-binding protein  37.57 
 
 
373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  36.49 
 
 
362 aa  200  3e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  33.63 
 
 
370 aa  199  5e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1653  periplasmic binding protein  37.71 
 
 
386 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  34.69 
 
 
375 aa  194  3e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  36.36 
 
 
375 aa  192  7e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0497  periplasmic binding protein  33.98 
 
 
377 aa  180  4e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1823  periplasmic binding protein  34.44 
 
 
366 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.717749  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0816  periplasmic binding protein  34.48 
 
 
344 aa  172  1e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  33.33 
 
 
376 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1091  hypothetical protein  32.24 
 
 
337 aa  167  4e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0327  hypothetical protein  32.39 
 
 
381 aa  159  1e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1174  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  31.61 
 
 
367 aa  157  4e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00124091  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0991  periplasmic binding protein  32.42 
 
 
359 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.960819  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1092  hypothetical protein  31.86 
 
 
378 aa  131  3e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  30.84 
 
 
375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  29.18 
 
 
344 aa  102  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1354  periplasmic binding protein  26.65 
 
 
371 aa  100  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  29.28 
 
 
354 aa  95.5  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1093  Fe3+-hydroxamate binding protein  23.84 
 
 
426 aa  94.4  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000629133  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  29.12 
 
 
315 aa  93.2  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2696  periplasmic binding protein  28.21 
 
 
377 aa  93.2  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.773462  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  29.62 
 
 
315 aa  92  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  28.65 
 
 
360 aa  92  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1708  periplasmic binding protein  22.87 
 
 
392 aa  91.7  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  28.98 
 
 
354 aa  90.5  4e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0745  periplasmic binding protein  28.9 
 
 
407 aa  89.7  9e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.300436 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  28.49 
 
 
427 aa  88.2  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000609348 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  28.72 
 
 
682 aa  87  5e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  27.14 
 
 
363 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  29.38 
 
 
682 aa  85.9  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  29.5 
 
 
354 aa  84.3  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  27.09 
 
 
361 aa  83.2  0.000000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1702  periplasmic binding protein  26.12 
 
 
364 aa  82.8  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  27.39 
 
 
369 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1467  periplasmic binding protein  26.32 
 
 
406 aa  82  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  unclonable  0.0000000012515  normal  0.0723513 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2539  periplasmic binding protein  27.58 
 
 
368 aa  81.3  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4418  periplasmic binding protein  26.46 
 
 
377 aa  81.3  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.468441 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1221  ABC transporter substrate binding protein (iron)  27.3 
 
 
406 aa  80.5  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  29.46 
 
 
354 aa  80.1  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  28.87 
 
 
354 aa  79  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  25 
 
 
333 aa  79.3  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3040  periplasmic binding protein  25.98 
 
 
375 aa  79.3  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1097  periplasmic binding protein  26.5 
 
 
373 aa  78.6  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.508447  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1235  periplasmic binding protein  24.93 
 
 
375 aa  78.2  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  25.52 
 
 
353 aa  78.2  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2758  periplasmic binding protein  27.25 
 
 
373 aa  76.6  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.593995  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2567  periplasmic binding protein  26.59 
 
 
365 aa  76.6  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0204616  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0417  periplasmic binding protein  28.35 
 
 
346 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0407983 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  25.83 
 
 
483 aa  75.5  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0229  periplasmic binding protein  30.05 
 
 
293 aa  74.7  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1995  periplasmic binding protein  23.4 
 
 
360 aa  74.3  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00450  ABC transporter, periplasmic binding protein  28.29 
 
 
342 aa  74.3  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.123713  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  25 
 
 
365 aa  73.9  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1477  periplasmic binding protein  26.33 
 
 
345 aa  74.3  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.47905  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2027  periplasmic binding protein  26.63 
 
 
378 aa  73.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683361  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4771  periplasmic binding protein  28.4 
 
 
370 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0283  periplasmic binding protein  26.29 
 
 
383 aa  72.8  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.996344  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2069  periplasmic binding protein  25.15 
 
 
340 aa  72.4  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1701  periplasmic binding protein  25.28 
 
 
365 aa  72.8  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3702  periplasmic binding protein  27.88 
 
 
348 aa  72.8  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  25 
 
 
384 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2260  hypothetical protein  24.57 
 
 
378 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.032453  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  23.64 
 
 
359 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  25.5 
 
 
375 aa  72  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>