More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1257 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 201 aa  411  1e-114  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  88 
 
 		 201 aa  373  1e-102  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  84.08 
 
 		 201 aa  350  8.999999999999999e-96  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  84.58 
 
 		 201 aa  328  3e-89  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  58 
 
 		 204 aa  240  9e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  59.38 
 
 		 199 aa  238  5e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  56.63 
 
 		 196 aa  226  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  52.31 
 
 		 203 aa  220  9.999999999999999e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  51.78 
 
 		 214 aa  206  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  43.32 
 
 		 193 aa  155  4e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  42.7 
 
 		 192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  44.19 
 
 		 190 aa  145  3e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  43.32 
 
 		 190 aa  144  6e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  42.94 
 
 		 192 aa  144  1e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  39.66 
 
 		 188 aa  125  5e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  38.18 
 
 		 174 aa  124  7e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  35.47 
 
 		 172 aa  122  3e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  40.83 
 
 		 213 aa  117  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0073  isochorismatase hydrolase  37.79 
 
 		 176 aa  117  9e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  35.06 
 
 		 193 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  35.26 
 
 		 180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  35.5 
 
 		 231 aa  105  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  35.5 
 
 		 231 aa  105  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  35.5 
 
 		 230 aa  105  5e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  35.5 
 
 		 230 aa  105  5e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  35 
 
 		 231 aa  104  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  35.5 
 
 		 231 aa  104  8e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  35.07 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  35 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  34.78 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  35 
 
 		 231 aa  102  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  33 
 
 		 248 aa  99.8  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  31.41 
 
 		 227 aa  97.4  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5297  isochorismatase family protein  27.57 
 
 		 179 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000537015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  33.01 
 
 		 244 aa  96.7  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 		 213 aa  96.7  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  34.15 
 
 		 174 aa  96.3  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  34.21 
 
 		 240 aa  96.3  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  34.05 
 
 		 201 aa  96.3  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2831  isochorismatase hydrolase  30.41 
 
 		 176 aa  94.7  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  33.52 
 
 		 205 aa  94.7  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  32.78 
 
 		 212 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0021  isochorismatase family protein  28.11 
 
 		 179 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00499035  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  32.93 
 
 		 174 aa  94  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  32.28 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  31.84 
 
 		 227 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  32.57 
 
 		 213 aa  92.4  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  34.83 
 
 		 230 aa  92  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5987  putative isochorismatase family protein  35.68 
 
 		 204 aa  91.3  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.104192 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  34.46 
 
 		 329 aa  91.3  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  30.69 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0016  isochorismatase hydrolase  28.11 
 
 		 179 aa  90.5  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392436  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  26.9 
 
 		 209 aa  90.1  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1936  isochorismatase hydrolase  35.75 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  30.65 
 
 		 217 aa  90.1  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  31.43 
 
 		 264 aa  89.7  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  34.46 
 
 		 230 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  30.69 
 
 		 230 aa  89.4  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0023  isochorismatase family protein  27.03 
 
 		 179 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000151833  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 189 aa  89  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4541  isochorismatase hydrolase  27.72 
 
 		 179 aa  88.6  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.366879  normal  0.78546 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  32.62 
 
 		 233 aa  88.6  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1859  isochorismatase hydrolase  32.58 
 
 		 179 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0019  isochorismatase family protein  25.95 
 
 		 179 aa  87.8  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0016  isochorismatase family protein  25.95 
 
 		 179 aa  87.8  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191123  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  25.95 
 
 		 179 aa  87.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  26.49 
 
 		 179 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.382444  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0021  isochorismatase family protein  25.95 
 
 		 179 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  32.04 
 
 		 228 aa  87.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  37.66 
 
 		 204 aa  87.4  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0017  isochorismatase family protein  27.03 
 
 		 179 aa  87  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0209161  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0248  isochorismatase hydrolase  34.3 
 
 		 185 aa  86.7  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22170  nicotinamidase-like amidase  30.51 
 
 		 197 aa  87  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000776565  normal  0.0158237 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  32.11 
 
 		 204 aa  86.3  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  32.8 
 
 		 239 aa  87  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  34.09 
 
 		 274 aa  86.3  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1614  isochorismatase hydrolase  29.67 
 
 		 187 aa  86.3  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  34.31 
 
 		 248 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1659  isochorismatase hydrolase  32.32 
 
 		 180 aa  85.9  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.262359  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  31.89 
 
 		 228 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  32.09 
 
 		 239 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  33.72 
 
 		 389 aa  85.1  6e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  31.72 
 
 		 228 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  33.18 
 
 		 246 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  34.01 
 
 		 245 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1454  isochorismatase family protein  29.07 
 
 		 184 aa  84.7  8e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0526786  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3072  isochorismatase family protein  32.1 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132185  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0016  isochorismatase hydrolase  27.81 
 
 		 185 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3315  isochorismatase family protein  32.1 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  34.24 
 
 		 189 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3293  isochorismatase family protein  32.1 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3544  isochorismatase hydrolase  32.93 
 
 		 179 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  32.22 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3617  isochorismatase hydrolase  32.93 
 
 		 179 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.644685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  31.02 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3549  isochorismatase hydrolase  32.93 
 
 		 179 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1846  isochorismatase hydrolase  32.24 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0666128  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1893  isochorismatase hydrolase  32.24 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1827  isochorismatase hydrolase  32.24 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>