34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1226 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1226  DsrE family protein  100 
 
 
116 aa  239  1e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.306048  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1443  DsrE family protein  90.52 
 
 
116 aa  223  5.0000000000000005e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1322  hypothetical protein  36.28 
 
 
118 aa  84.3  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.070069  normal  0.542385 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0966  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.88 
 
 
138 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.498786  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0963  DsrE family protein  25.21 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.153749  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2900  DsrE family protein  28.28 
 
 
129 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2096  DsrE family protein  30.17 
 
 
133 aa  50.4  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2643  DsrE family protein  24.81 
 
 
131 aa  49.7  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0166482  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0555  DsrE family protein  27.55 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0210711  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0814  hypothetical protein  27.06 
 
 
196 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0856  DsrE family protein  23.01 
 
 
114 aa  47.8  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.249123  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0501  DsrE family protein  25.42 
 
 
272 aa  47.4  0.00006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1185  hypothetical protein  28.24 
 
 
192 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.491301  normal  0.832453 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1311  DsrE family protein  28.97 
 
 
114 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1840  hypothetical protein  25.61 
 
 
170 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.381099  normal  0.11418 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0827  conserved hypothetical protein  29.59 
 
 
120 aa  44.3  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0037  hypothetical protein  25.61 
 
 
170 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.151182  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3745  hypothetical protein  27.13 
 
 
156 aa  43.9  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0481362  hitchhiker  0.0000104136 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1671  DsrE family protein  24.17 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620887  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0059  hypothetical protein  25 
 
 
170 aa  43.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0642  DsrE family protein  27.1 
 
 
114 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1961  hypothetical protein  29.58 
 
 
169 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000557384  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1150  hypothetical protein  27.48 
 
 
191 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000124979  decreased coverage  0.000000301947 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1550  DsrE family protein  26.96 
 
 
133 aa  42  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4616  hypothetical protein  27.96 
 
 
170 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.379533 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02400  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.24 
 
 
831 aa  41.6  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1612  hypothetical protein  27.96 
 
 
170 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0031  DsrE family protein  24.37 
 
 
121 aa  40.8  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0065  peroxiredoxin-like protein  25.62 
 
 
193 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2186  hypothetical protein  30.88 
 
 
156 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0361535  hitchhiker  0.0000000354849 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2556  hypothetical protein  30.88 
 
 
156 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0177725  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0437  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  30.99 
 
 
158 aa  40.8  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0031  hypothetical protein  29.58 
 
 
169 aa  40.4  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000221456  normal  0.0655494 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1365  DsrE family protein  26.17 
 
 
114 aa  40  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>