132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1209 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1209  SirA family protein  100 
 
 
82 aa  164  4e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1466  SirA family protein  78.26 
 
 
81 aa  114  3e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1475  SirA family protein  54.05 
 
 
82 aa  86.7  9e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1758  SirA family protein  44.93 
 
 
79 aa  65.1  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708198  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1812  SirA family protein  44.93 
 
 
79 aa  65.1  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000207986  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0858  SirA family protein  38.67 
 
 
94 aa  63.2  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0497  hypothetical protein  40.74 
 
 
79 aa  62  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0510  SirA family protein  40 
 
 
78 aa  61.2  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000586624  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0950  SirA family protein  41.18 
 
 
77 aa  60.8  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000954852  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0584  SirA family protein  41.43 
 
 
85 aa  60.1  0.000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.255131  hitchhiker  0.00753187 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0109  hypothetical protein  42.86 
 
 
77 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0112  hypothetical protein  42.86 
 
 
77 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0110  hypothetical protein  42.86 
 
 
77 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0105  hypothetical protein  42.86 
 
 
77 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0110  hypothetical protein  42.86 
 
 
77 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0108  hypothetical protein  42.86 
 
 
77 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0113  hypothetical protein  42.86 
 
 
77 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3809  hypothetical protein  44.29 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0642  hypothetical protein  44.29 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0393171 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3897  hypothetical protein  44.29 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0064  SirA family protein  35.06 
 
 
83 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0446  hypothetical protein  45.76 
 
 
78 aa  57  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1716  SirA family protein  41.18 
 
 
77 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.762252  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0828  hypothetical protein  35.8 
 
 
81 aa  55.8  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2030  hypothetical protein  41.18 
 
 
77 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2165  hypothetical protein  41.18 
 
 
77 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1709  hypothetical protein  41.18 
 
 
77 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0828513 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1251  hypothetical protein  41.18 
 
 
77 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.525922  normal  0.40175 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2128  hypothetical protein  41.18 
 
 
77 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.845963  hitchhiker  0.00000520309 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2181  hypothetical protein  41.18 
 
 
77 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.325504  normal  0.0531342 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2123  hypothetical protein  41.18 
 
 
77 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.574865  normal  0.265989 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1154  hypothetical protein  41.18 
 
 
77 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00380389  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1277  hypothetical protein  41.18 
 
 
77 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203301  normal  0.625411 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2705  hypothetical protein  41.18 
 
 
77 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.280893 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0365  hypothetical protein  38.71 
 
 
75 aa  54.3  0.0000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2271  hypothetical protein  38.57 
 
 
77 aa  54.7  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0112419 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1060  hypothetical protein  39.71 
 
 
77 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000235779  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0598  SirA family protein  34.78 
 
 
75 aa  53.1  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1293  SirA family protein  35.29 
 
 
80 aa  52  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17350  hypothetical protein  36.23 
 
 
82 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1451  SirA family protein  36.76 
 
 
75 aa  51.6  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19740  hypothetical protein  41.82 
 
 
88 aa  51.2  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0337318  normal  0.0110123 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1507  hypothetical protein  36.23 
 
 
82 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1763  SirA family protein  37.68 
 
 
181 aa  51.2  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144222  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1849  hypothetical protein  35.21 
 
 
75 aa  51.2  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1817  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
184 aa  51.2  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0130872  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0831  SirA family protein  39.29 
 
 
93 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378872  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4046  SirA-like  34.78 
 
 
84 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3436  SirA family protein  32.35 
 
 
81 aa  50.1  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000543679  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1210  SirA family protein  36.23 
 
 
75 aa  50.4  0.000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0588  hypothetical protein  36.62 
 
 
78 aa  50.1  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.456844  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1674  hypothetical protein  38.1 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1982  hypothetical protein  36.23 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.948606  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1493  hypothetical protein  38.1 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00560  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  31.94 
 
 
76 aa  49.3  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1366  SirA family protein  38.24 
 
 
70 aa  48.9  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  34.78 
 
 
80 aa  48.9  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0855  SirA family protein  38.24 
 
 
70 aa  49.3  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.412959  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1262  SirA family protein  35.06 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0643  SirA family protein  38.24 
 
 
70 aa  48.9  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0166  SirA family protein  30.88 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.766434  normal  0.899413 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  40.58 
 
 
75 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2600  hypothetical protein  27.54 
 
 
76 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3117  hypothetical protein  27.54 
 
 
76 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2228  SirA family protein  27.54 
 
 
76 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2715  SirA family protein  27.54 
 
 
76 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000196179 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4189  SirA family protein  33.33 
 
 
84 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.388351  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4162  SirA family protein  33.33 
 
 
84 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  36.23 
 
 
201 aa  47.4  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1310  SirA family protein  36.76 
 
 
70 aa  47.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  33.33 
 
 
80 aa  47.4  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  33.33 
 
 
80 aa  47.4  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4184  SirA family protein  41.07 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.842151  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0863  SirA family protein  39.73 
 
 
88 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252783  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2100  hypothetical protein  30.3 
 
 
73 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0903  SirA family protein  38.27 
 
 
94 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0179319  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  39.13 
 
 
75 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0062  SirA family protein  35.94 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  40.58 
 
 
189 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0894  SirA family protein  36.21 
 
 
89 aa  45.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0330  SirA family protein  33.33 
 
 
75 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  28.77 
 
 
75 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0775  SirA family protein  35.14 
 
 
80 aa  46.2  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0090  SirA family protein  37.68 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719339  normal  0.137098 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  37.68 
 
 
76 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04730  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  29.17 
 
 
76 aa  44.7  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  37.93 
 
 
76 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  39.13 
 
 
189 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2937  SirA-like  42.31 
 
 
97 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0383  SirA family protein  33.33 
 
 
78 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.472232  normal  0.0141536 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  36.23 
 
 
75 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0046  SirA family protein  37.14 
 
 
75 aa  44.3  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  32.39 
 
 
77 aa  43.9  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2054  selenium metabolism protein YedF  45.1 
 
 
196 aa  43.9  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0975  SirA-like protein  42.31 
 
 
101 aa  43.5  0.0009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.369067  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2653  SirA-like protein  33.33 
 
 
78 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00012248  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0718  SirA family protein  31.94 
 
 
76 aa  43.5  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  36.23 
 
 
76 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  36.21 
 
 
77 aa  43.5  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2018  SirA protein, putative  34.55 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0674453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>