246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1077 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  100 
 
 
210 aa  428  1e-119  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  71.43 
 
 
210 aa  331  5e-90  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  66.67 
 
 
208 aa  304  6e-82  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  55.83 
 
 
220 aa  225  4e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2609  cyclase family protein  36.65 
 
 
222 aa  142  4e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  37.79 
 
 
210 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  37.79 
 
 
210 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  37.79 
 
 
210 aa  129  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  37.79 
 
 
210 aa  129  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  36.87 
 
 
210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  37.79 
 
 
210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  36.87 
 
 
210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  36.41 
 
 
210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  36.41 
 
 
210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  36.19 
 
 
212 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  35.38 
 
 
213 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  36.41 
 
 
210 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  33.49 
 
 
216 aa  123  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  34.43 
 
 
215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  34.12 
 
 
201 aa  119  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  34.6 
 
 
219 aa  119  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  34.74 
 
 
214 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  33.64 
 
 
213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  34.42 
 
 
217 aa  115  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  35.91 
 
 
214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1868  cyclase family protein  33.81 
 
 
215 aa  112  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00308105  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0103  cyclase family protein  35.05 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  35.75 
 
 
216 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1354  cyclase family protein  33.94 
 
 
229 aa  107  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0623  cyclase family protein  32.69 
 
 
220 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1012  cyclase family protein  32.02 
 
 
224 aa  106  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  35.68 
 
 
207 aa  105  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0130  cyclase family protein  32.09 
 
 
216 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3771  cyclase family protein  29.02 
 
 
233 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3370  cyclase family protein  29.02 
 
 
233 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.380631  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  32.73 
 
 
377 aa  98.6  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4064  cyclase family protein  29.46 
 
 
231 aa  97.8  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3853  cyclase family protein  35.32 
 
 
193 aa  97.4  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00415586  normal  0.0437489 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  33.65 
 
 
217 aa  97.1  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  33.8 
 
 
221 aa  95.9  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  29.58 
 
 
214 aa  95.1  7e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  31.75 
 
 
217 aa  92.4  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  30.66 
 
 
213 aa  90.9  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  33.33 
 
 
280 aa  90.5  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  27.52 
 
 
223 aa  89.7  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  33.18 
 
 
215 aa  89.4  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  32.23 
 
 
216 aa  86.7  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2245  putative cyclase  35.29 
 
 
262 aa  86.7  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1514  cyclase family protein  28.64 
 
 
205 aa  86.3  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0047  cyclase family protein  30.7 
 
 
213 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0049  cyclase family protein  30.7 
 
 
213 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2262  cyclase family protein  28.96 
 
 
236 aa  85.1  6e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  33.16 
 
 
249 aa  85.5  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5044  cyclase family protein  30.63 
 
 
219 aa  84.3  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250627  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1133  cyclase family protein  32.31 
 
 
204 aa  84  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0317  cyclase family protein  31.4 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.555056  normal  0.951673 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1127  cyclase family protein  32.47 
 
 
189 aa  82  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  28.9 
 
 
219 aa  81.3  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  28.89 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1211  cyclase family protein  29.78 
 
 
275 aa  79.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2558  cyclase family protein  31.16 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178632  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0669  hypothetical protein  28.43 
 
 
176 aa  79  0.00000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1029  cyclase family protein  29.72 
 
 
277 aa  79  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121896  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2527  arylformamidase  30.66 
 
 
209 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001519 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2765  arylformamidase  30.66 
 
 
209 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0174  cyclase family protein  29.25 
 
 
237 aa  78.2  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2786  hypothetical protein  31.31 
 
 
209 aa  78.2  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00465023  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  31.13 
 
 
209 aa  78.2  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3588  putative cyclase  34.58 
 
 
221 aa  78.2  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  30 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2487  metal-dependent hydrolase  31.31 
 
 
209 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  29.86 
 
 
210 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2226  cyclase family protein  28.5 
 
 
204 aa  77.4  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0812  cyclase family protein  24.35 
 
 
243 aa  76.6  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2522  metal-dependent hydrolase  30.23 
 
 
209 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.220374  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0520  cyclase family protein  27.09 
 
 
268 aa  77  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669822  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2566  hypothetical protein  30.23 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185533  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0275  hypothetical protein  28.51 
 
 
238 aa  76.6  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.228886 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2752  hypothetical protein  30.23 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0257  cyclase family protein  28.37 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2760  arylformamidase  30.23 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607358 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2300  cyclase family protein  30.85 
 
 
253 aa  76.3  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.408163 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1418  cyclase family protein  27.05 
 
 
205 aa  75.5  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0662308  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1550  cyclase family protein  28.87 
 
 
189 aa  75.5  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.477846  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  28.77 
 
 
226 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  27.49 
 
 
226 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1259  cyclase family protein  28.31 
 
 
215 aa  74.7  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.240385  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1971  cyclase family protein  27.93 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2272  putative cyclase  31.95 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  30.33 
 
 
226 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2646  putative cyclase  34.57 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1541  cyclase family protein  30.35 
 
 
253 aa  73.6  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.711446  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0383  cyclase family protein  29.13 
 
 
205 aa  73.6  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.777945  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2807  arylformamidase  30.23 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.227395  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0824  cyclase family protein  28.93 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.924773  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2301  putative cyclase  27.88 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.285068  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  25.22 
 
 
261 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1902  cyclase family protein  29.38 
 
 
209 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258214  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2549  cyclase family protein  30.32 
 
 
216 aa  72.8  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.564227 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1555  putative cyclase  26.96 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.168649 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>