261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1007 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1007  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 278 aa  556  1e-157  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0161  beta-lactamase domain-containing protein  77.24 
 
 		 269 aa  424  1e-117  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1242  beta-lactamase domain-containing protein  70.94 
 
 		 266 aa  383  1e-105  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0123  beta-lactamase domain protein  32.32 
 
 		 272 aa  112  6e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0841  beta-lactamase domain-containing protein  30.37 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0550321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2035  beta-lactamase domain-containing protein  29.32 
 
 		 301 aa  92.4  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1210  metallo-beta-lactamase family protein  31.76 
 
 		 335 aa  91.3  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0422174  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3009  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 301 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.332764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0269  Beta-lactamase-like  28.34 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120465  normal  0.961982 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0329  beta-lactamase domain-containing protein  28.82 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000424657  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09640  beta-lactamase domain protein  25.85 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0311  beta-lactamase domain-containing protein  31.21 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000202771  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0164  beta-lactamase domain-containing protein  24.51 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2191  beta-lactamase domain protein  25.83 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.602262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1391  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.354164  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1595  Beta-lactamase-like  26.85 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2116  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.79 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2530  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.41 
 
 		 257 aa  62  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.785477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002770  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.78 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18088  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1572  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.99 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3305  beta-lactamase domain protein  30.32 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0149024  normal  0.0144108 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1374  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.09884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5606  beta-lactamase domain protein  29.95 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3208  beta-lactamase domain protein  30.33 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.229767  normal  0.168477 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1364  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.19 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1481  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.38 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00263805  normal  0.131466 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2493  beta-lactamase-like  33.78 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1299  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.19 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.744991  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  28.32 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3716  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.44 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0697  beta-lactamase domain-containing protein  45.95 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0317435 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0212  beta-lactamase domain-containing protein  45.33 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1884  hydroxyacylglutathione hydrolase  24.52 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000396006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0591  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.74 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4749  beta-lactamase domain protein  31.46 
 
 		 288 aa  55.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  31.79 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4897  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.76 
 
 		 257 aa  54.7  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  28.9 
 
 		 206 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  31.82 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  31.94 
 
 		 313 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2384  beta-lactamase domain protein  33.54 
 
 		 230 aa  53.9  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  30.6 
 
 		 206 aa  53.9  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2161  hydroxyacylglutathione hydrolase  25.39 
 
 		 295 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000853605  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2207  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.12 
 
 		 259 aa  53.5  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.181464  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2369  beta-lactamase domain-containing protein  24.05 
 
 		 267 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000987439  normal  0.0208559 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  27.63 
 
 		 309 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2238  hydroxyacylglutathione hydrolase  25.39 
 
 		 295 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000229962  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03213  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.25 
 
 		 252 aa  53.5  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1776  hydroxyacylglutathione hydrolase  25 
 
 		 267 aa  53.1  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000249519  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1996  hydroxyacylglutathione hydrolase  24.1 
 
 		 263 aa  53.1  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0422138  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  24 
 
 		 310 aa  52.8  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4144  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.23 
 
 		 259 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1721  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.23 
 
 		 259 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1665  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.57 
 
 		 256 aa  52  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  33.16 
 
 		 214 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2879  beta-lactamase domain protein  26.8 
 
 		 216 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2011  hydroxyacylglutathione hydrolase  23.74 
 
 		 263 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000146784  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2327  hydroxyacylglutathione hydrolase  23.74 
 
 		 263 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000811011  hitchhiker  0.0000970016 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  32.12 
 
 		 213 aa  51.6  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  32.39 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2327  beta-lactamase domain protein  28.38 
 
 		 319 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  31.61 
 
 		 307 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1828  putative hydroxyacylglutathione hydrolase GloB  25.82 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2563  metallo-beta-lactamase family protein  28.8 
 
 		 267 aa  51.2  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  31.61 
 
 		 307 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1975  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.19 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3813  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.64 
 
 		 248 aa  51.6  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0934  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.5 
 
 		 259 aa  51.2  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.421322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1494  beta-lactamase domain-containing protein  29.27 
 
 		 307 aa  51.2  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.321503  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0422  metallo-beta-lactamase family protein  24.67 
 
 		 257 aa  50.4  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0543677  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1765  hydroxyacylglutathione hydrolase  24.67 
 
 		 257 aa  50.4  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2114  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.78 
 
 		 260 aa  50.4  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000176506  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  31.82 
 
 		 215 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  31.82 
 
 		 215 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0203  beta-lactamase domain-containing protein  30.62 
 
 		 263 aa  50.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0208476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  31.82 
 
 		 215 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  28.86 
 
 		 211 aa  50.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12323  hypothetical protein  31.91 
 
 		 310 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3933  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 276 aa  49.7  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.997989  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  31.82 
 
 		 215 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0746  hydroxyacylglutathione hydrolase  24.11 
 
 		 251 aa  49.7  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.965541  normal  0.966571 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  31.82 
 
 		 215 aa  49.7  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  31.82 
 
 		 215 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  31.82 
 
 		 215 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1972  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.92 
 
 		 245 aa  49.3  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.293472 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1621  hydroxyacylglutathione hydrolase  24.55 
 
 		 264 aa  49.7  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0531  beta-lactamase-like protein  42.7 
 
 		 242 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235067  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0543  beta-lactamase domain-containing protein  42.7 
 
 		 242 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  31.82 
 
 		 215 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0521  beta-lactamase domain-containing protein  42.7 
 
 		 242 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 210 aa  49.3  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2059  hydroxyacylglutathione hydrolase  25.18 
 
 		 263 aa  49.3  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000134001  decreased coverage  0.000104727 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1743  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.73 
 
 		 259 aa  49.3  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0994564 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1932  beta-lactamase domain-containing protein  30.57 
 
 		 403 aa  49.3  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.516166  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  27.39 
 
 		 310 aa  48.9  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  32.11 
 
 		 214 aa  48.9  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1949  beta-lactamase domain protein  26.6 
 
 		 208 aa  48.9  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2528  beta-lactamase domain-containing protein  31.22 
 
 		 260 aa  48.9  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00565773  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3469  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.09 
 
 		 259 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  32.11 
 
 		 214 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>