More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0985 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 702 aa  1371    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  62.68 
 
 		 702 aa  860    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  66.52 
 
 		 702 aa  856    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  62.68 
 
 		 700 aa  805    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  30.79 
 
 		 804 aa  259  8e-68  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  26.77 
 
 		 858 aa  150  9e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  25.51 
 
 		 693 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  24.34 
 
 		 864 aa  101  5e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  22.44 
 
 		 926 aa  94.4  7e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0855  SMC domain protein  21.72 
 
 		 802 aa  94.4  7e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.128097  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  29.43 
 
 		 891 aa  94  8e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  26.02 
 
 		 935 aa  92.8  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  26.81 
 
 		 1061 aa  90.5  9e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  28.77 
 
 		 902 aa  88.2  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  23.43 
 
 		 891 aa  85.1  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  26.19 
 
 		 924 aa  84.7  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  28.07 
 
 		 895 aa  84.7  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1811  SMC domain-containing protein  26.42 
 
 		 794 aa  84.3  0.000000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.305534 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0884  SMC domain-containing protein  27.39 
 
 		 790 aa  83.6  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.922995  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  24.71 
 
 		 993 aa  80.1  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  21.82 
 
 		 1019 aa  79.7  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  25.29 
 
 		 993 aa  79.7  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  21.03 
 
 		 994 aa  78.6  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  26.17 
 
 		 993 aa  79  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1444  SMC domain-containing protein  26.46 
 
 		 795 aa  77.4  0.0000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.353031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  28.33 
 
 		 1008 aa  73.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  30.43 
 
 		 1074 aa  73.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1637  SMC domain-containing protein  29.7 
 
 		 795 aa  72.8  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  29.2 
 
 		 888 aa  72.4  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  24.8 
 
 		 1016 aa  71.6  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  31.52 
 
 		 953 aa  71.6  0.00000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  27.97 
 
 		 890 aa  70.9  0.00000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  25.24 
 
 		 789 aa  70.1  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0527  SMC domain-containing protein  23.7 
 
 		 784 aa  68.9  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03960  DNA repair-related protein, putative  22.8 
 
 		 1125 aa  68.2  0.0000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  26.63 
 
 		 978 aa  67.8  0.0000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  29.94 
 
 		 812 aa  67.4  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1882  SMC domain-containing protein  26.69 
 
 		 805 aa  65.5  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0300452  normal  0.0368515 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  22.82 
 
 		 1039 aa  65.1  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  26.57 
 
 		 1019 aa  65.5  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  26.77 
 
 		 1003 aa  65.1  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1422  nuclease SbcCD, C subunit, putative  25.46 
 
 		 724 aa  64.3  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  22.89 
 
 		 1191 aa  64.3  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0944  SMC protein-like protein  23.92 
 
 		 483 aa  64.3  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.665094  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  32 
 
 		 1038 aa  63.9  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1725  nuclease SbcCD, C subunit, putative  26.44 
 
 		 813 aa  63.9  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.536729  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  24.94 
 
 		 1170 aa  63.5  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2009  hypothetical protein  63.04 
 
 		 922 aa  63.5  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10415  DNA repair protein Rad18, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05440)  28.57 
 
 		 1146 aa  62  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0107863  hitchhiker  0.00000500177 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  25.22 
 
 		 987 aa  60.1  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  26.27 
 
 		 1057 aa  60.5  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  24.01 
 
 		 1108 aa  60.1  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1155  SMC domain-containing protein  38.46 
 
 		 852 aa  59.3  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  38.46 
 
 		 852 aa  59.3  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1375  DNA repair ATPase  34.94 
 
 		 814 aa  59.3  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000366162  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  23.64 
 
 		 1188 aa  58.9  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  23.64 
 
 		 1188 aa  58.9  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  24.33 
 
 		 1021 aa  58.5  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  25.09 
 
 		 961 aa  58.5  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1922  SMC domain protein  35.48 
 
 		 987 aa  58.2  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.664102 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1627  ABC transporter related  40.58 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0889533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1620  ABC transporter related  44.29 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.479618  normal  0.235921 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  25 
 
 		 857 aa  58.2  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0696  exonuclease SbcC  28.37 
 
 		 1007 aa  57.8  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2570  SMC domain-containing protein  26.94 
 
 		 984 aa  57.8  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4561  exonuclease SbcC  24.88 
 
 		 1007 aa  57.4  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  40.58 
 
 		 302 aa  57.4  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  35.78 
 
 		 1196 aa  57  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1552  ABC transporter related  44.29 
 
 		 302 aa  57  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  27.65 
 
 		 1147 aa  57.4  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  28.86 
 
 		 1020 aa  56.2  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1390  ABC transporter related  42.31 
 
 		 238 aa  55.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1788  ABC transporter related protein  41.18 
 
 		 238 aa  56.6  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2484  ABC transporter related  36.23 
 
 		 301 aa  56.2  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.013646  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1642  ABC transporter related  36.23 
 
 		 308 aa  55.8  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00844741  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0947  SMC domain protein  25.76 
 
 		 1082 aa  55.8  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.823623  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3009  exonuclease SbcC  22.37 
 
 		 1008 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.291694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  25.43 
 
 		 1018 aa  55.8  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3111  exonuclease SbcC  22.37 
 
 		 1008 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31021  Protein involved in recombination repair  29.67 
 
 		 1063 aa  55.5  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.109982 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29255  predicted protein  29.91 
 
 		 1076 aa  55.8  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.170598  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  24.49 
 
 		 1170 aa  55.1  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  26.63 
 
 		 1174 aa  55.5  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2613  ABC transporter-related protein  39.13 
 
 		 299 aa  55.1  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0139514 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  25.43 
 
 		 1018 aa  55.5  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2343  SMC domain protein  28.89 
 
 		 912 aa  55.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32662  predicted protein  24.79 
 
 		 1060 aa  55.1  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.429677 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  41.03 
 
 		 225 aa  54.7  0.000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  26.61 
 
 		 1190 aa  54.7  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  26.96 
 
 		 1198 aa  54.3  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18310  cysteine export CydDC family ABC transporter permease subunit/ATP-binding protein CydD  41.33 
 
 		 584 aa  54.3  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.120639  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1694  ABC transporter related  34.78 
 
 		 299 aa  54.3  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1800  ABC transporter related  38.57 
 
 		 303 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.503709  normal  0.72569 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2522  ABC transporter related  38.57 
 
 		 303 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.575143  normal  0.64922 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1756  ABC transporter related  38.57 
 
 		 303 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.55189  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  24.54 
 
 		 1049 aa  53.5  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2246  ABC transporter related  39.74 
 
 		 237 aa  53.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.730478  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1983  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  43.21 
 
 		 579 aa  52.8  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2136  ABC transporter ATP-binding protein  39.74 
 
 		 237 aa  53.1  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2136  ABC transporter, ATP-binding protein  39.74 
 
 		 237 aa  52.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>