More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0985 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  66.52 
 
 
702 aa  856  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  100 
 
 
702 aa  1371  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  4.97741e-05 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  62.68 
 
 
700 aa  805  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  62.68 
 
 
702 aa  860  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  30.79 
 
 
804 aa  259  8e-68  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  26.77 
 
 
858 aa  150  9e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  25.51 
 
 
693 aa  132  2e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  24.34 
 
 
864 aa  101  5e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0855  SMC domain protein  21.72 
 
 
802 aa  94.4  7e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.128097  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  22.44 
 
 
926 aa  94.4  7e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  29.43 
 
 
891 aa  94  8e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  26.02 
 
 
935 aa  92.8  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  26.81 
 
 
1061 aa  90.5  9e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  28.77 
 
 
902 aa  88.2  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  23.43 
 
 
891 aa  85.1  4e-15  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  3.56641e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  26.19 
 
 
924 aa  84.7  5e-15  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  28.07 
 
 
895 aa  84.7  6e-15  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1811  SMC domain-containing protein  26.42 
 
 
794 aa  84.3  7e-15  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.305534 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0884  SMC domain-containing protein  27.39 
 
 
790 aa  83.6  1e-14  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.922995  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  24.71 
 
 
993 aa  80.1  1e-13  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  25.29 
 
 
993 aa  79.7  2e-13  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  21.82 
 
 
1019 aa  79.7  2e-13  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  26.17 
 
 
993 aa  79  3e-13  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  21.03 
 
 
994 aa  78.6  3e-13  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1444  SMC domain-containing protein  26.46 
 
 
795 aa  77.4  9e-13  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.353031  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  28.33 
 
 
1008 aa  73.6  1e-11  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1637  SMC domain-containing protein  29.7 
 
 
795 aa  72.8  2e-11  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  30.43 
 
 
1074 aa  73.2  2e-11  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  29.2 
 
 
888 aa  72.4  3e-11  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  24.8 
 
 
1016 aa  71.6  4e-11  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  31.52 
 
 
953 aa  71.6  5e-11  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  27.97 
 
 
890 aa  70.9  9e-11  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  25.24 
 
 
789 aa  70.1  1e-10  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0527  SMC domain-containing protein  23.7 
 
 
784 aa  68.9  3e-10  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03960  DNA repair-related protein, putative  22.8 
 
 
1125 aa  68.2  5e-10  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  26.63 
 
 
978 aa  67.8  7e-10  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  29.94 
 
 
812 aa  67.4  1e-09  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1882  SMC domain-containing protein  26.69 
 
 
805 aa  65.5  3e-09  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0300452  normal  0.0368515 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  26.57 
 
 
1019 aa  65.5  4e-09  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  26.77 
 
 
1003 aa  65.1  4e-09  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  22.82 
 
 
1039 aa  65.1  4e-09  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  22.89 
 
 
1191 aa  64.3  7e-09  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1422  nuclease SbcCD, C subunit, putative  25.46 
 
 
724 aa  64.3  7e-09  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0944  SMC protein-like protein  23.92 
 
 
483 aa  64.3  8e-09  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.665094  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  32 
 
 
1038 aa  63.9  9e-09  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1725  nuclease SbcCD, C subunit, putative  26.44 
 
 
813 aa  63.9  1e-08  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.536729  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  24.94 
 
 
1170 aa  63.5  1e-08  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2009  hypothetical protein  63.04 
 
 
922 aa  63.5  1e-08  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10415  DNA repair protein Rad18, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05440)  28.57 
 
 
1146 aa  62  3e-08  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0107863  hitchhiker  5.00177e-06 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  25.22 
 
 
987 aa  60.1  1e-07  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  24.01 
 
 
1108 aa  60.1  1e-07  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  26.27 
 
 
1057 aa  60.5  1e-07  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  38.46 
 
 
852 aa  59.3  2e-07  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1155  SMC domain-containing protein  38.46 
 
 
852 aa  59.3  2e-07  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  23.64 
 
 
1188 aa  58.9  3e-07  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1375  DNA repair ATPase  34.94 
 
 
814 aa  59.3  3e-07  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.66162e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  23.64 
 
 
1188 aa  58.9  3e-07  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  25.09 
 
 
961 aa  58.5  4e-07  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  24.33 
 
 
1021 aa  58.5  4e-07  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1627  ABC transporter related  40.58 
 
 
302 aa  58.2  5e-07  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0889533 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1922  SMC domain protein  35.48 
 
 
987 aa  58.2  5e-07  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.664102 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1620  ABC transporter related  44.29 
 
 
302 aa  58.2  5e-07  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.479618  normal  0.235921 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  25 
 
 
857 aa  58.2  6e-07  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0696  exonuclease SbcC  28.37 
 
 
1007 aa  57.8  6e-07  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2570  SMC domain-containing protein  26.94 
 
 
984 aa  57.8  7e-07  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4561  exonuclease SbcC  24.88 
 
 
1007 aa  57.4  8e-07  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1552  ABC transporter related  44.29 
 
 
302 aa  57  1e-06  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  35.78 
 
 
1196 aa  57  1e-06  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  40.58 
 
 
302 aa  57.4  1e-06  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  27.65 
 
 
1147 aa  57.4  1e-06  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2484  ABC transporter related  36.23 
 
 
301 aa  56.2  2e-06  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.013646  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  28.86 
 
 
1020 aa  56.2  2e-06  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1788  ABC transporter related protein  41.18 
 
 
238 aa  56.6  2e-06  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1390  ABC transporter related  42.31 
 
 
238 aa  55.8  2e-06  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29255  predicted protein  29.91 
 
 
1076 aa  55.8  3e-06  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.170598  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0947  SMC domain protein  25.76 
 
 
1082 aa  55.8  3e-06  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.823623  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31021  Protein involved in recombination repair  29.67 
 
 
1063 aa  55.5  3e-06  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.109982 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  25.43 
 
 
1018 aa  55.8  3e-06  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  3.95857e-05 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1642  ABC transporter related  36.23 
 
 
308 aa  55.8  3e-06  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00844741  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3111  exonuclease SbcC  22.37 
 
 
1008 aa  55.5  3e-06  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3009  exonuclease SbcC  22.37 
 
 
1008 aa  55.5  3e-06  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.291694  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  24.49 
 
 
1170 aa  55.1  4e-06  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  26.63 
 
 
1174 aa  55.5  4e-06  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  1.82837e-06 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2613  ABC transporter-related protein  39.13 
 
 
299 aa  55.1  4e-06  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0139514 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  25.43 
 
 
1018 aa  55.5  4e-06  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  7.99023e-11 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32662  predicted protein  24.79 
 
 
1060 aa  55.1  5e-06  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.429677 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2343  SMC domain protein  28.89 
 
 
912 aa  55.1  5e-06  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  26.61 
 
 
1190 aa  54.7  6e-06  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  41.03 
 
 
225 aa  54.7  6e-06  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18310  cysteine export CydDC family ABC transporter permease subunit/ATP-binding protein CydD  41.33 
 
 
584 aa  54.3  7e-06  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.120639  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  26.96 
 
 
1198 aa  54.3  7e-06  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1694  ABC transporter related  34.78 
 
 
299 aa  54.3  8e-06  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1800  ABC transporter related  38.57 
 
 
303 aa  53.5  1e-05  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.503709  normal  0.72569 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  24.54 
 
 
1049 aa  53.5  1e-05  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1756  ABC transporter related  38.57 
 
 
303 aa  53.5  1e-05  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.55189  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2522  ABC transporter related  38.57 
 
 
303 aa  53.5  1e-05  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.575143  normal  0.64922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  29.71 
 
 
1018 aa  52.8  2e-05  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  1.00584e-08 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1983  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  43.21 
 
 
579 aa  52.8  2e-05  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5894  DNA repair ATPase-like protein  23.62 
 
 
1029 aa  53.1  2e-05  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0510725  hitchhiker  0.00862936 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  27.66 
 
 
1146 aa  52.8  2e-05  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>