More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0971 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0281  argininosuccinate lyase  73.54 
 
 
429 aa  644    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.456736  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0971  argininosuccinate lyase  100 
 
 
429 aa  860    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0231153  unclonable  0.000000000000187264 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1832  argininosuccinate lyase  75.41 
 
 
429 aa  614  1e-175  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.784813  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0368  argininosuccinate lyase  71.1 
 
 
429 aa  607  1e-173  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0766  argininosuccinate lyase  43.9 
 
 
450 aa  335  5.999999999999999e-91  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0160567  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1988  argininosuccinate lyase  41.57 
 
 
448 aa  292  8e-78  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.415578  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1701  argininosuccinate lyase  40.98 
 
 
444 aa  281  2e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.273814  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0263  argininosuccinate lyase  33.24 
 
 
485 aa  211  2e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0999182 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  35.17 
 
 
468 aa  206  6e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  32.56 
 
 
481 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0576  argininosuccinate lyase  32.16 
 
 
492 aa  199  5e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000000512851  decreased coverage  0.000219195 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1827  argininosuccinate lyase  34.59 
 
 
462 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.986813  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  34.29 
 
 
467 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0004  argininosuccinate lyase  32.49 
 
 
491 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  33.33 
 
 
491 aa  194  3e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  33.51 
 
 
462 aa  193  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  33.24 
 
 
462 aa  192  7e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  33.24 
 
 
463 aa  192  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  33.24 
 
 
462 aa  192  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  33.24 
 
 
462 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  33.24 
 
 
463 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1078  argininosuccinate lyase  32.83 
 
 
494 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.181884 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  32.98 
 
 
462 aa  190  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  32.98 
 
 
462 aa  190  4e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0533  argininosuccinate lyase  31.49 
 
 
411 aa  190  5e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  32.98 
 
 
462 aa  190  5e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0492  argininosuccinate lyase  34.32 
 
 
487 aa  190  5e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421765  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0330  argininosuccinate lyase  34.79 
 
 
554 aa  189  5.999999999999999e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  32.32 
 
 
475 aa  189  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  32.44 
 
 
462 aa  189  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  32.47 
 
 
478 aa  188  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  32.8 
 
 
467 aa  188  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2328  argininosuccinate lyase  33.5 
 
 
476 aa  188  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306722  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0084  argininosuccinate lyase  31.22 
 
 
493 aa  187  3e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.491917 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0557  argininosuccinate lyase  30.83 
 
 
411 aa  185  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1763  argininosuccinate lyase  33.94 
 
 
501 aa  186  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0739  argininosuccinate lyase  31.14 
 
 
474 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730139  normal  0.199189 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0123  argininosuccinate lyase  33.07 
 
 
459 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.001821  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  31.99 
 
 
469 aa  183  5.0000000000000004e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0770  argininosuccinate lyase  34.9 
 
 
497 aa  183  5.0000000000000004e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.687371 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  31.99 
 
 
466 aa  183  6e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  31.08 
 
 
459 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0732  argininosuccinate lyase  30.3 
 
 
461 aa  182  1e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0166776  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0852  argininosuccinate lyase  31.14 
 
 
492 aa  182  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00169507  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  31.75 
 
 
465 aa  181  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  31.78 
 
 
464 aa  181  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  30.11 
 
 
469 aa  181  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3544  argininosuccinate lyase  33.85 
 
 
452 aa  181  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.441008  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  31.67 
 
 
458 aa  180  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0936  argininosuccinate lyase  29.55 
 
 
481 aa  180  4e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  31.99 
 
 
468 aa  180  4.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1671  argininosuccinate lyase  28.54 
 
 
481 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4778  argininosuccinate lyase  32.65 
 
 
457 aa  179  7e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00418415 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  30.14 
 
 
457 aa  179  8e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00040  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  30.84 
 
 
624 aa  179  8e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1010  argininosuccinate lyase  28.76 
 
 
481 aa  179  9e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2677  argininosuccinate lyase  32.07 
 
 
469 aa  179  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1433  argininosuccinate lyase  32.32 
 
 
485 aa  179  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857857  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1208  argininosuccinate lyase  30.34 
 
 
481 aa  178  2e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  32.38 
 
 
467 aa  178  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2751  argininosuccinate lyase  31.84 
 
 
469 aa  178  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2618  argininosuccinate lyase  36.39 
 
 
502 aa  178  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.744012  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0695  argininosuccinate lyase  31.69 
 
 
470 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712566  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1009  argininosuccinate lyase  28.57 
 
 
460 aa  177  4e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0621733  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  30.56 
 
 
464 aa  177  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2183  argininosuccinate lyase  31.76 
 
 
468 aa  177  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.013453 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2173  argininosuccinate lyase  31.32 
 
 
471 aa  176  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  31.17 
 
 
458 aa  176  6e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  31.72 
 
 
457 aa  176  7e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0664  argininosuccinate lyase  30.61 
 
 
441 aa  176  7e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  31.1 
 
 
462 aa  176  7e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  32.92 
 
 
467 aa  176  7e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  33.07 
 
 
478 aa  176  8e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  32.28 
 
 
463 aa  176  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2476  argininosuccinate lyase  32.29 
 
 
490 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2577  argininosuccinate lyase  31.32 
 
 
471 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.400333 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3681  argininosuccinate lyase  30.3 
 
 
462 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  30.03 
 
 
461 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4504  argininosuccinate lyase  33.09 
 
 
459 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961173  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0110  argininosuccinate lyase  30.11 
 
 
462 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0048  argininosuccinate lyase  30.39 
 
 
460 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  30.56 
 
 
468 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  31.35 
 
 
464 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  30.56 
 
 
464 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1781  argininosuccinate lyase  29.35 
 
 
479 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1025  argininosuccinate lyase  31.52 
 
 
491 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.414548  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  30.56 
 
 
499 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2342  argininosuccinate lyase  32.03 
 
 
469 aa  173  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146568  normal  0.209916 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  30.56 
 
 
464 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  28.98 
 
 
464 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  30.53 
 
 
458 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  30.81 
 
 
464 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  30.81 
 
 
464 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0197  argininosuccinate lyase  35.12 
 
 
457 aa  172  7.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.274279  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1229  argininosuccinate lyase  32.02 
 
 
459 aa  172  7.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3917  argininosuccinate lyase  33.67 
 
 
457 aa  172  7.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.705842  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1065  argininosuccinate lyase  31.77 
 
 
468 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002315  argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  29.86 
 
 
624 aa  172  7.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.784515  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1295  argininosuccinate lyase  28.68 
 
 
504 aa  172  7.999999999999999e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.220763  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1248  argininosuccinate lyase  31.3 
 
 
462 aa  172  9e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000860987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>