More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0829 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0829  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 915 aa  1822    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.468511 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.86 
 
 		 926 aa  694    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.477622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  75.33 
 
 		 912 aa  1390    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.20041  normal  0.364429 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0952  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  74.02 
 
 		 916 aa  1457    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.111516 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1058  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  75.82 
 
 		 916 aa  1416    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164302 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.37 
 
 		 932 aa  599  1e-170  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1670  ATP-dependent RNA helicase  38.26 
 
 		 955 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.92 
 
 		 928 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0732  DEAD/DEAH box helicase-like protein  37.04 
 
 		 944 aa  570  1e-161  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.06 
 
 		 927 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.84 
 
 		 937 aa  552  1e-156  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0594  DEAD/DEAH box helicase-like  38.02 
 
 		 898 aa  550  1e-155  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198586  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.72 
 
 		 928 aa  545  1e-153  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2425  DEAD/H associated domain protein  38.11 
 
 		 939 aa  540  9.999999999999999e-153  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0750378  normal  0.0387243 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.34 
 
 		 909 aa  528  1e-148  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.339653  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0511  hypothetical protein  36.85 
 
 		 903 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.51218 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0265  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.05 
 
 		 972 aa  514  1e-144  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5231  DEAD/H associated domain protein  37.38 
 
 		 946 aa  514  1e-144  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1879  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.4 
 
 		 970 aa  515  1e-144  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149039  normal  0.0231063 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1014  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.99 
 
 		 946 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1679  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.62 
 
 		 903 aa  505  1e-141  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2100  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.12 
 
 		 897 aa  498  1e-139  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0549  DEAD/H associated domain protein  35.71 
 
 		 943 aa  493  9.999999999999999e-139  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0909316  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.55 
 
 		 905 aa  491  1e-137  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.68416 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3388  DEAD/H associated domain protein  35.71 
 
 		 954 aa  483  1e-135  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1372  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.73 
 
 		 913 aa  479  1e-133  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.828132  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.01 
 
 		 890 aa  478  1e-133  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.12 
 
 		 913 aa  464  1e-129  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.403606 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  34.1 
 
 		 888 aa  367  1e-100  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  32.92 
 
 		 1688 aa  342  1e-92  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  30.88 
 
 		 873 aa  341  2.9999999999999998e-92  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.706735 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  31.75 
 
 		 875 aa  332  2e-89  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  32.64 
 
 		 870 aa  332  2e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  32.93 
 
 		 872 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.12 
 
 		 1476 aa  323  9.000000000000001e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  29.82 
 
 		 874 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  29.61 
 
 		 874 aa  317  6e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.06 
 
 		 900 aa  312  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0156392  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  29.94 
 
 		 874 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  38.53 
 
 		 1480 aa  311  2.9999999999999997e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3924  DEAD/H associated domain protein  39.38 
 
 		 1535 aa  310  5.9999999999999995e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0463  ATP-dependent helicase  29.87 
 
 		 872 aa  309  2.0000000000000002e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0110872  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1577  DEAD/H associated domain protein  31.24 
 
 		 1495 aa  307  6e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4192  DEAD/H associated domain-containing protein  37.46 
 
 		 1534 aa  305  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0456896 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3527  DEAD/DEAH box helicase-like  37.02 
 
 		 1567 aa  296  1e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.917212  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  30.81 
 
 		 922 aa  295  3e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2240  DEAD/H associated domain protein  35.91 
 
 		 1506 aa  295  3e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.589998 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2329  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.8 
 
 		 1516 aa  294  4e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2613  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.98 
 
 		 1502 aa  293  8e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.670287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  30.63 
 
 		 915 aa  292  2e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1750  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.23 
 
 		 931 aa  290  1e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00374519  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1293  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.99 
 
 		 1523 aa  288  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193705 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1496  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.29 
 
 		 1534 aa  287  5e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.775081 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1240  DEAD/H associated domain protein  35.88 
 
 		 1632 aa  286  1.0000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27850  ATP dependent helicase, Lhr family  35.91 
 
 		 1549 aa  285  3.0000000000000004e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.081171 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1865  putative ATP-dependent helicase Lhr  31.07 
 
 		 1538 aa  285  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0115691  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1267  DEAD/H associated  36.5 
 
 		 1523 aa  285  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.5 
 
 		 1523 aa  285  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.148383 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1489  DEAD/H associated domain protein  37.3 
 
 		 1584 aa  285  3.0000000000000004e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.369551 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2365  putative ATP-dependent helicase Lhr  30.84 
 
 		 1538 aa  284  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.812889  normal  0.664089 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1802  DEAD/H associated domain protein  36.06 
 
 		 1544 aa  284  5.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0257988  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1545  putative ATP-dependent helicase Lhr  30.99 
 
 		 1538 aa  283  7.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.91893  normal  0.4804 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1987  DEAD/H associated domain protein  30.99 
 
 		 1538 aa  283  1e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01623  predicted ATP-dependent helicase  30.99 
 
 		 1538 aa  283  2e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1976  putative ATP-dependent helicase Lhr  30.99 
 
 		 1538 aa  282  2e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.987163  hitchhiker  0.00398653 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.66 
 
 		 1514 aa  282  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0582362  normal  0.286828 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01613  hypothetical protein  30.99 
 
 		 1538 aa  283  2e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.54 
 
 		 1561 aa  282  3e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.338069  hitchhiker  0.000946056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2211  putative ATP-dependent helicase Lhr  35.74 
 
 		 1620 aa  281  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.961951 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1943  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.75 
 
 		 933 aa  281  4e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.546728  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19580  ATP dependent helicase, Lhr family  35.82 
 
 		 1601 aa  281  4e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.512724  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.97 
 
 		 1412 aa  280  1e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.02 
 
 		 1539 aa  280  1e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.35203 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1730  putative ATP-dependent helicase Lhr  31.04 
 
 		 1525 aa  279  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23220  ATP dependent helicase, Lhr family  34.22 
 
 		 1649 aa  279  2e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.408844  normal  0.0469013 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1253  ATP-dependent helicase  31.59 
 
 		 941 aa  279  2e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.34 
 
 		 1517 aa  279  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0712014 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2116  ATP-dependent helicase  34.91 
 
 		 914 aa  279  2e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200911  normal  0.796736 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0664  DEAD/H associated domain protein  36.63 
 
 		 1509 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.240887 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1014  DEAD/H associated domain protein  35.58 
 
 		 1493 aa  275  4.0000000000000004e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1724  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.46 
 
 		 1553 aa  274  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0413876  normal  0.423713 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1113  DEAD/H associated domain-containing protein  35.14 
 
 		 1644 aa  272  2.9999999999999997e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.79527  normal  0.12197 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5281  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.04 
 
 		 1497 aa  271  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13325  ATP-dependent helicase lhr  37.09 
 
 		 1513 aa  270  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1413  DEAD/H associated domain protein  36.59 
 
 		 1606 aa  270  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0176402  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1786  DEAD/H associated domain protein  36.16 
 
 		 1536 aa  270  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1217  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.38 
 
 		 1613 aa  269  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0938904 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1865  DEAD/H associated domain protein  36.16 
 
 		 1536 aa  269  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.03 
 
 		 828 aa  269  2e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2092  DEAD/DEAH box helicase-like  36.01 
 
 		 1536 aa  268  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1454  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.49 
 
 		 824 aa  266  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0579695 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3770  DEAD/DEAH box helicase-like  29.44 
 
 		 1435 aa  265  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0816  DEAD/H associated domain protein  35.92 
 
 		 1572 aa  265  4e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.77 
 
 		 828 aa  264  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1541  DEAD/H associated domain protein  34.77 
 
 		 1694 aa  264  6.999999999999999e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00672173  normal  0.215224 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6550  DEAD/H associated domain protein  29.98 
 
 		 1573 aa  263  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851379  normal  0.30774 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3312  DEAD/DEAH box helicase-like  32.52 
 
 		 804 aa  262  2e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.170551  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3982  DEAD/H associated domain protein  31.01 
 
 		 1388 aa  261  3e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.347513  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0384  DEAD/DEAH box helicase-like  33.5 
 
 		 1531 aa  260  7e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.224382 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.88 
 
 		 1475 aa  260  7e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.354786  normal  0.0258746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>