More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0781 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0781  methylisocitrate lyase  100 
 
 		 311 aa  623  1e-177  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1702  methylisocitrate lyase  89.37 
 
 		 304 aa  550  1e-155  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0394396 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0624  2,3-dimethylmalate lyase  87.25 
 
 		 306 aa  547  1e-154  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0783  methylisocitrate lyase  58.57 
 
 		 312 aa  342  4e-93  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.649003 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0396  methylisocitrate lyase  56.58 
 
 		 285 aa  330  3e-89  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0696555  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0279  2,3-dimethylmalate lyase  56.51 
 
 		 274 aa  317  2e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.577564  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0101  methylisocitrate lyase  52.7 
 
 		 308 aa  308  5e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.248963  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0800  methylisocitrate lyase  50.88 
 
 		 307 aa  287  1e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0629223  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4791  2,3-dimethylmalate lyase  53.66 
 
 		 307 aa  278  8e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.147274  normal  0.246336 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3008  methylisocitrate lyase  50.18 
 
 		 302 aa  276  4e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.62358 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2378  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  50.18 
 
 		 302 aa  276  5e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.628231  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2369  methylisocitrate lyase  50.18 
 
 		 302 aa  275  6e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2127  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  50.18 
 
 		 302 aa  275  6e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2113  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  50.18 
 
 		 302 aa  275  6e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2452  methylisocitrate lyase  50.18 
 
 		 302 aa  275  6e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.344607  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2317  methylisocitrate lyase  50.18 
 
 		 302 aa  275  8e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2190  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  50.18 
 
 		 302 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2158  methylisocitrate lyase  50.18 
 
 		 302 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081733  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2350  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  50.18 
 
 		 302 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1726  methylisocitrate lyase  47.26 
 
 		 302 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1657  2,3-dimethylmalate lyase  50 
 
 		 306 aa  268  8e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.106264  normal  0.68628 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0622  methylisocitrate lyase  51.89 
 
 		 304 aa  268  1e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3496  methylisocitrate lyase  48.04 
 
 		 314 aa  265  8.999999999999999e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.146967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2320  2,3-dimethylmalate lyase  51.24 
 
 		 306 aa  264  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0895569  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2648  methylisocitrate lyase  50.53 
 
 		 305 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.843725  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4841  2,3-dimethylmalate lyase  47.96 
 
 		 284 aa  259  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0071  2-methylisocitrate lyase  47.7 
 
 		 296 aa  257  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3510  methylisocitrate lyase  51.59 
 
 		 306 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.120815  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0925  2-methylisocitrate lyase  45.1 
 
 		 292 aa  256  4e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1419  2-methylisocitrate lyase  44.96 
 
 		 292 aa  256  4e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1857  2-methylisocitrate lyase  44.29 
 
 		 292 aa  256  4e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03370  2-methylisocitrate lyase  46.62 
 
 		 291 aa  255  6e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2822  2-methylisocitrate lyase  45.32 
 
 		 296 aa  254  1.0000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1820  2-methylisocitrate lyase  45 
 
 		 292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0052  2-methylisocitrate lyase  44.41 
 
 		 297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0650  methylisocitrate lyase  51.59 
 
 		 304 aa  254  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.133389 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4021  2-methylisocitrate lyase  44.68 
 
 		 292 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0054  2-methylisocitrate lyase  45 
 
 		 297 aa  251  1e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4047  2-methylisocitrate lyase  44.68 
 
 		 292 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4140  2-methylisocitrate lyase  44.68 
 
 		 292 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3945  2-methylisocitrate lyase  44.68 
 
 		 292 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1072  2-methylisocitrate lyase  45.74 
 
 		 301 aa  251  1e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.765825  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3644  2-methylisocitrate lyase  44.68 
 
 		 292 aa  251  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1346  methylisocitrate lyase  51.9 
 
 		 304 aa  250  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2499  2-methylisocitrate lyase  43.57 
 
 		 292 aa  250  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.741837  normal  0.047618 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14150  methylisocitrate lyase  45.3 
 
 		 312 aa  249  3e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0345  2-methylisocitrate lyase  44.33 
 
 		 292 aa  249  4e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2322  2-methylisocitrate lyase  41.69 
 
 		 292 aa  249  5e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2605  2-methylisocitrate lyase  45.39 
 
 		 293 aa  249  5e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221019  hitchhiker  0.000512853 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4356  2-methylisocitrate lyase  46.18 
 
 		 303 aa  248  6e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2655  2,3-dimethylmalate lyase  50.53 
 
 		 292 aa  249  6e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.147366  normal  0.299253 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0952  2-methylisocitrate lyase  43.8 
 
 		 298 aa  248  6e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0315  2-methylisocitrate lyase  44.68 
 
 		 292 aa  248  7e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3825  2-methylisocitrate lyase  44.68 
 
 		 292 aa  248  7e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2209  2-methylisocitrate lyase  48.09 
 
 		 294 aa  248  8e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.629465  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3294  2-methylisocitrate lyase  45.42 
 
 		 294 aa  247  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.203078 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2154  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  45.32 
 
 		 289 aa  247  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.908949 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2111  2-methylisocitrate lyase  43.57 
 
 		 292 aa  247  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.12913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1664  2-methylisocitrate lyase  43.57 
 
 		 292 aa  247  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2479  methylisocitrate lyase  45.74 
 
 		 304 aa  247  2e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0974909  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00286  2-methylisocitrate lyase  44.13 
 
 		 296 aa  246  3e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0397  2-methylisocitrate lyase  44.29 
 
 		 296 aa  246  3e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3293  2-methylisocitrate lyase  44.13 
 
 		 296 aa  246  3e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00290  hypothetical protein  44.13 
 
 		 296 aa  246  3e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3629  2-methylisocitrate lyase  44.33 
 
 		 292 aa  246  3e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0356  2-methylisocitrate lyase  44.29 
 
 		 296 aa  246  4e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0363  2-methylisocitrate lyase  44.29 
 
 		 296 aa  246  4e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0403  2-methylisocitrate lyase  44.29 
 
 		 296 aa  246  4e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1666  2-methylisocitrate lyase  44.6 
 
 		 295 aa  246  4e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0108  methylisocitrate lyase  44.48 
 
 		 302 aa  245  8e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0279515  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12030  methylisocitrate lyase  44.52 
 
 		 312 aa  245  9e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.55917  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1869  2-methylisocitrate lyase  43.12 
 
 		 292 aa  244  9.999999999999999e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02397  2-methylisocitrate lyase  43.48 
 
 		 298 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0689  methylisocitrate lyase  48.26 
 
 		 292 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2400  2-methylisocitrate lyase  46.24 
 
 		 311 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.951557  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0568  methylisocitrate lyase  46.58 
 
 		 298 aa  243  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3275  methylisocitrate lyase  43.77 
 
 		 296 aa  243  3e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4755  2-methylisocitrate lyase  46.18 
 
 		 297 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.730915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3287  2-methylisocitrate lyase  45.42 
 
 		 297 aa  241  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179718  normal  0.0341449 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1524  methylisocitrate lyase  45.08 
 
 		 301 aa  241  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000427671 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5344  2-methylisocitrate lyase  46.18 
 
 		 297 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0562563  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5517  2-methylisocitrate lyase  46.18 
 
 		 297 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003388  methylisocitrate lyase  42.75 
 
 		 298 aa  240  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1197  2-methylisocitrate lyase  44.27 
 
 		 297 aa  239  2.9999999999999997e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2334  2-methylisocitrate lyase  45.25 
 
 		 296 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474392  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0408  2-methylisocitrate lyase  43.01 
 
 		 295 aa  238  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000002587 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0420  2-methylisocitrate lyase  43.01 
 
 		 295 aa  238  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0232158 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0865  2-methylisocitrate lyase  45.8 
 
 		 299 aa  238  8e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.698029  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4025  isocitrate lyase family protein  40.36 
 
 		 284 aa  238  9e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1775  2-methylisocitrate lyase  45.25 
 
 		 296 aa  238  9e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.367112  hitchhiker  0.000175442 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0141  2-methylisocitrate lyase  45.42 
 
 		 297 aa  238  9e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.758126  normal  0.590891 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0122  2-methylisocitrate lyase  44.1 
 
 		 298 aa  238  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.528863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3975  2-methylisocitrate lyase  43.06 
 
 		 298 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.583072 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0402  2-methylisocitrate lyase  43.01 
 
 		 295 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3861  2-methylisocitrate lyase  43.06 
 
 		 298 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0400  2-methylisocitrate lyase  43.01 
 
 		 295 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0664462  hitchhiker  0.000000000169441 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3436  2-methylisocitrate lyase  45.25 
 
 		 296 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00574123  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1311  2-methylisocitrate lyase  43.89 
 
 		 296 aa  237  1e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0110415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4051  isocitrate lyase family protein  40.36 
 
 		 287 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4144  isocitrate lyase family protein  40.36 
 
 		 284 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>