More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0774 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0774  30S ribosomal protein S19P  100 
 
 		 159 aa  326  1.0000000000000001e-88  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0724  30S ribosomal protein S19P  95.54 
 
 		 158 aa  309  7.999999999999999e-84  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.888673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0627  30S ribosomal protein S19P  94.27 
 
 		 158 aa  306  5.9999999999999995e-83  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1705  30S ribosomal protein S19P  93.04 
 
 		 160 aa  305  1.0000000000000001e-82  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0143251 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0515  30S ribosomal protein S19P  78.23 
 
 		 187 aa  229  8.000000000000001e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.319488  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1774  ribosomal protein S19  61.59 
 
 		 140 aa  177  4.999999999999999e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0095  30S ribosomal protein S19P  62.5 
 
 		 140 aa  176  1e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000607429  unclonable  0.000000387819 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0225  30S ribosomal protein S19P  64.29 
 
 		 141 aa  174  4e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.386417  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0803  30S ribosomal protein S19P  49.64 
 
 		 162 aa  148  4e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1123  30S ribosomal protein S19P  48.2 
 
 		 161 aa  145  3e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.325514  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0029  30S ribosomal protein S19P  46.76 
 
 		 161 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0917309  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0795  30S ribosomal protein S19P  46.76 
 
 		 161 aa  142  1e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0933963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0861  30S ribosomal protein S19P  48.91 
 
 		 160 aa  140  6e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.222615  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2445  30S ribosomal protein S19P  51.85 
 
 		 141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1832  30S ribosomal protein S19P  51.52 
 
 		 140 aa  131  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2296  30S ribosomal protein S19P  53.23 
 
 		 141 aa  127  5.0000000000000004e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1517  ribosomal protein S19  51.54 
 
 		 151 aa  123  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  8.41136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1724  30S ribosomal protein S19P  50 
 
 		 136 aa  123  1e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00713726  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2222  ribosomal protein S19  52.31 
 
 		 140 aa  122  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0806  30S ribosomal protein S19P  50 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.345007 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0214  ribosomal protein S19  50 
 
 		 141 aa  119  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0106  30S ribosomal protein S19P  42.65 
 
 		 136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.346057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0568  30S ribosomal protein S19P  44.85 
 
 		 137 aa  118  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00394395  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0536  30S ribosomal protein S19P  44.85 
 
 		 139 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.336176  normal  0.495782 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26849  predicted protein  46.21 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.624783  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05997  40S ribosomal protein S15 (Broad)  42.22 
 
 		 182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.945808  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03840  40s ribosomal protein s15, putative  48.72 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0005  30S ribosomal protein S19P  38.24 
 
 		 137 aa  111  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  1.96004e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66616  predicted protein  44.53 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.428527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0446  30S ribosomal protein S19P  43.08 
 
 		 137 aa  107  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0104609  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2249  30S ribosomal protein S19P  42.65 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000080677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39331  predicted protein  45.6 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0085  30S ribosomal protein S19P  39.71 
 
 		 136 aa  98.2  4e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.316285 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1296  30S ribosomal protein S19  54.02 
 
 		 95 aa  77  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1390  30S ribosomal protein S19  54.02 
 
 		 95 aa  77  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000262881  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01210  ribosomal protein S19  52.33 
 
 		 94 aa  75.5  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.441353  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0985  30S ribosomal protein S19  50.53 
 
 		 94 aa  73.6  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0957  30S ribosomal protein S19  48.31 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000875114  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1520  30S ribosomal protein S19  47.31 
 
 		 94 aa  72  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.914288  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0786  30S ribosomal protein S19  47.42 
 
 		 97 aa  71.6  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.314347  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0493  30S ribosomal protein S19  49.38 
 
 		 92 aa  70.9  0.000000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3707  30S ribosomal protein S19  46.32 
 
 		 92 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1189  30S ribosomal protein S19  44.21 
 
 		 93 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0653663 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2903  ribosomal protein S19  45.16 
 
 		 94 aa  69.7  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1134  30S ribosomal protein S19  48.28 
 
 		 95 aa  69.7  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000887938  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1180  ribosomal protein S19  50.59 
 
 		 93 aa  69.7  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000119264  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2615  30S ribosomal protein S19  49.37 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00302204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0342  30S ribosomal protein S19  51.9 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0483388  decreased coverage  0.000267992 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1268  30S ribosomal protein S19  50.63 
 
 		 91 aa  68.2  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000477876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2174  ribosomal protein S19  47.06 
 
 		 91 aa  67.8  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.765738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2228  30S ribosomal protein S19  45.35 
 
 		 91 aa  68.2  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.749299  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0245  30S ribosomal protein S19  46.81 
 
 		 92 aa  68.2  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.948054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0248  30S ribosomal protein S19  46.81 
 
 		 92 aa  68.2  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0760  30S ribosomal protein S19  46.51 
 
 		 89 aa  68.2  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000341891  normal  0.0171843 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1850  30S ribosomal protein S19  43.53 
 
 		 95 aa  67.8  0.00000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000178079  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0341  30S ribosomal protein S19  43.53 
 
 		 95 aa  67.8  0.00000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  6.9817e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0277  30S ribosomal protein S19  49.37 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000202257  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0282  30S ribosomal protein S19  49.37 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.135228  hitchhiker  0.00000000656503 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0695  30S ribosomal protein S19  48.42 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04517  30S ribosomal protein S19  46.51 
 
 		 89 aa  67.4  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000490547  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0395  30S ribosomal protein S19  48.24 
 
 		 91 aa  67  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00895016  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2563  30S ribosomal protein S19  46.32 
 
 		 92 aa  67  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.61073  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3008  30S ribosomal protein S19  47.73 
 
 		 91 aa  67  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0207995  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0846  ribosomal protein S19  48.84 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1840  ribosomal protein S19  50 
 
 		 89 aa  66.2  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000159969  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0111  30S ribosomal protein S19  46.32 
 
 		 92 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0299  30S ribosomal protein S19  46.84 
 
 		 90 aa  66.6  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00139488  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0290  30S ribosomal protein S19  44.19 
 
 		 91 aa  67  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00351648  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1741  30S ribosomal protein S19  46.32 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745132  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1296  30S ribosomal protein S19  44.09 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00413729  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0771  30S ribosomal protein S19  45.98 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0231426  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3791  30S ribosomal protein S19  45.57 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.498806  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0260  30S ribosomal protein S19  46.84 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0199256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3995  30S ribosomal protein S19  48.24 
 
 		 91 aa  66.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000322685 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0207  30S ribosomal protein S19  46.84 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62728  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4909  30S ribosomal protein S19  45.57 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00546448  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3439  30S ribosomal protein S19  49.37 
 
 		 91 aa  65.5  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00121291  normal  0.122841 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2907  30S ribosomal protein S19  44.21 
 
 		 94 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.761008  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1674  SSU ribosomal protein S19P  49.28 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1559  ribosomal protein S19  47.06 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.917547  normal  0.993871 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0719  ribosomal protein S19  40.62 
 
 		 94 aa  65.1  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2770  ribosomal protein S19  46.51 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000879656  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2061  ribosomal protein S19  43.68 
 
 		 90 aa  65.1  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000159778  normal  0.210432 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0269  30S ribosomal protein S19  40.24 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000031867  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0331  30S ribosomal protein S19  47.13 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000218247  normal  0.0337389 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3482  30S ribosomal protein S19  47.13 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000804319  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1928  30S ribosomal protein S19  47.13 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000295141  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2628  30S ribosomal protein S19  47.13 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00158971  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0253  30S ribosomal protein S19  47.13 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000113028  normal  0.0178687 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3772  30S ribosomal protein S19  47.13 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000265315  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3451  30S ribosomal protein S19  47.13 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000490482  decreased coverage  0.00387887 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0280  30S ribosomal protein S19  47.13 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442981  normal  0.0699946 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3064  30S ribosomal protein S19  47.13 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000207611  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0318  30S ribosomal protein S19  47.13 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000548079  decreased coverage  0.00231518 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3800  30S ribosomal protein S19  47.13 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238183  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2755  30S ribosomal protein S19  47.13 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000407777  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3640  30S ribosomal protein S19  47.13 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000927803  hitchhiker  0.0000000000150693 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0271  30S ribosomal protein S19  47.13 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00149939  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3165  30S ribosomal protein S19  47.13 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403295  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0352  30S ribosomal protein S19  47.13 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000694495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>