More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0744 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0633  phosphoglycerate kinase  78.57 
 
 
408 aa  677    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0731  phosphoglycerate kinase  79.66 
 
 
408 aa  691    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0744  phosphoglycerate kinase  100 
 
 
411 aa  827    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.333208 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1711  phosphoglycerate kinase  77.09 
 
 
408 aa  665    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0322554 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1789  phosphoglycerate kinase  45.48 
 
 
412 aa  332  1e-89  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0925666  normal  0.515243 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1614  Phosphoglycerate kinase  45.23 
 
 
415 aa  330  3e-89  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1653  phosphoglycerate kinase  41.15 
 
 
407 aa  294  2e-78  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.973793  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0817  phosphoglycerate kinase  38.75 
 
 
404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0845  phosphoglycerate kinase  39.6 
 
 
414 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37156  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0780  phosphoglycerate kinase  40.49 
 
 
414 aa  281  1e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.281028  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1600  Phosphoglycerate kinase  42.78 
 
 
408 aa  279  5e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1138  phosphoglycerate kinase  40 
 
 
414 aa  277  3e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.927128  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3327  Phosphoglycerate kinase  42.16 
 
 
404 aa  276  4e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0043  phosphoglycerate kinase  39.75 
 
 
414 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.212818  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1808  phosphoglycerate kinase  38.68 
 
 
412 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3562  phosphoglycerate kinase  38.93 
 
 
413 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.300765 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0495  phosphoglycerate kinase  38.61 
 
 
419 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2342  phosphoglycerate kinase  37.93 
 
 
404 aa  267  2e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.480216 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1251  phosphoglycerate kinase  37.88 
 
 
405 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0290  phosphoglycerate kinase  39.85 
 
 
388 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0773  phosphoglycerate kinase  41.33 
 
 
409 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.1233  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1194  phosphoglycerate kinase  38.68 
 
 
408 aa  264  2e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.622987  normal  0.0429324 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2674  phosphoglycerate kinase  38.07 
 
 
407 aa  263  3e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.667783 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1345  phosphoglycerate kinase  35.62 
 
 
413 aa  256  6e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0500  phosphoglycerate kinase  37.53 
 
 
408 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0608  Phosphoglycerate kinase  36.25 
 
 
409 aa  242  1e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3795  Phosphoglycerate kinase  37.66 
 
 
402 aa  237  3e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2372  phosphoglycerate kinase  36.59 
 
 
407 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.504326 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2549  Phosphoglycerate kinase  33.66 
 
 
407 aa  226  8e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0534  Phosphoglycerate kinase  34.77 
 
 
405 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70067  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0923  Phosphoglycerate kinase  33.17 
 
 
396 aa  202  9.999999999999999e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.314525 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  34.01 
 
 
394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1134  phosphoglycerate kinase  33.74 
 
 
389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  35.25 
 
 
655 aa  195  1e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  31.73 
 
 
392 aa  195  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  34.41 
 
 
402 aa  193  6e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1778  Phosphoglycerate kinase  29.83 
 
 
394 aa  192  7e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.991456  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  34.91 
 
 
399 aa  192  8e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  34.66 
 
 
399 aa  192  9e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0303  phosphoglycerate kinase  33.76 
 
 
393 aa  192  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  33.08 
 
 
396 aa  191  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07140  phosphoglycerate kinase  32.15 
 
 
398 aa  191  2e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.954732  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0229  Phosphoglycerate kinase  32.49 
 
 
399 aa  191  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0693093  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  33 
 
 
394 aa  190  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0803  phosphoglycerate kinase  33.5 
 
 
398 aa  190  4e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1307  phosphoglycerate kinase  33.33 
 
 
403 aa  190  4e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2059  Phosphoglycerate kinase  35.57 
 
 
395 aa  189  7e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0612926  normal  0.253988 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  32.07 
 
 
646 aa  189  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  32.75 
 
 
397 aa  189  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10120  phosphoglycerate kinase  33.33 
 
 
394 aa  187  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000642987 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  35.16 
 
 
395 aa  187  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  33.67 
 
 
395 aa  186  7e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1085  phosphoglycerate kinase  32.07 
 
 
391 aa  186  9e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00353094  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0739  phosphoglycerate kinase  34.6 
 
 
395 aa  185  1.0000000000000001e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000102804  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0876  phosphoglycerate kinase  32.02 
 
 
391 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000236749  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  33.33 
 
 
393 aa  185  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1531  phosphoglycerate kinase  34.17 
 
 
396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1510  phosphoglycerate kinase  32.58 
 
 
397 aa  184  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  32.41 
 
 
393 aa  184  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1300  phosphoglycerate kinase  32.58 
 
 
397 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0754  phosphoglycerate kinase  31.03 
 
 
391 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.729853  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  32.07 
 
 
394 aa  183  6e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  33.17 
 
 
401 aa  182  1e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2336  phosphoglycerate kinase  33.17 
 
 
396 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03158  3-phosphoglycerate kinase  32.11 
 
 
391 aa  181  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2004  phosphoglycerate kinase  31.63 
 
 
392 aa  181  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0798  phosphoglycerate kinase  31.22 
 
 
396 aa  181  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.226782  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0814  phosphoglycerate kinase  31.22 
 
 
396 aa  181  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0778  phosphoglycerate kinase  33.17 
 
 
405 aa  181  2.9999999999999997e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000119701  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  32.57 
 
 
395 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  33.92 
 
 
402 aa  180  4e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0790  phosphoglycerate kinase  31.66 
 
 
391 aa  180  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250302  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2842  phosphoglycerate kinase  31.84 
 
 
392 aa  180  4e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  33.17 
 
 
400 aa  179  9e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  33.17 
 
 
400 aa  179  9e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2424  phosphoglycerate kinase  32.91 
 
 
396 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069746  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0766  Phosphoglycerate kinase  30.4 
 
 
398 aa  179  1e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0161542  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0197  phosphoglycerate kinase  32.85 
 
 
402 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.868475  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3437  phosphoglycerate kinase  31.41 
 
 
398 aa  178  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.743661  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2388  Phosphoglycerate kinase  33.25 
 
 
392 aa  178  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02131  phosphoglycerate kinase  32.85 
 
 
402 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0158378  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1167  phosphoglycerate kinase  30.56 
 
 
398 aa  177  2e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2018  phosphoglycerate kinase  32.49 
 
 
394 aa  178  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  33.42 
 
 
400 aa  178  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0057  phosphoglycerate kinase  30.18 
 
 
393 aa  177  3e-43  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  31.73 
 
 
650 aa  177  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0055  phosphoglycerate kinase  31.32 
 
 
383 aa  177  3e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.186403  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1332  phosphoglycerate kinase  32.16 
 
 
396 aa  177  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000015474  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1252  Phosphoglycerate kinase  31.19 
 
 
400 aa  176  5e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13120  phosphoglycerate kinase  31.06 
 
 
398 aa  176  6e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.459632  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29157  predicted protein  32.5 
 
 
441 aa  176  7e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.122862  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0226  phosphoglycerate kinase  31.02 
 
 
404 aa  176  7e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.846581  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3533  phosphoglycerate kinase  30.35 
 
 
398 aa  176  7e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1979  phosphoglycerate kinase  31.02 
 
 
399 aa  176  7e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.577028  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  32.75 
 
 
401 aa  176  8e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  29.8 
 
 
394 aa  176  9e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2143  phosphoglycerate kinase  33.17 
 
 
401 aa  176  9e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6926  phosphoglycerate kinase  31.9 
 
 
396 aa  175  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.136569 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2324  Phosphoglycerate kinase  31.51 
 
 
400 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.345408  normal  0.262919 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2704  phosphoglycerate kinase  32.17 
 
 
407 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>