63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0657 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0657  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 346 aa  691    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0527  saccharopine dehydrogenase  73.56 
 
 		 347 aa  540  9.999999999999999e-153  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1622  saccharopine dehydrogenase  70.98 
 
 		 348 aa  528  1e-149  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.871276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0647  saccharopine dehydrogenase  70.98 
 
 		 348 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1035  saccharopine dehydrogenase  34.52 
 
 		 369 aa  139  8.999999999999999e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.002622 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1791  saccharopine dehydrogenase  32.76 
 
 		 392 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  33.15 
 
 		 385 aa  122  8e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0384  Saccharopine dehydrogenase  31.58 
 
 		 384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0854083  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  27.25 
 
 		 413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5033  Saccharopine dehydrogenase  29.75 
 
 		 354 aa  106  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3712  saccharopine dehydrogenase  32 
 
 		 367 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0633  hypothetical protein  31.6 
 
 		 367 aa  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.419888  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1254  hypothetical protein  29.8 
 
 		 376 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal  0.0375347 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5587  Saccharopine dehydrogenase  30.2 
 
 		 376 aa  103  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0890714  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4331  saccharopine dehydrogenase  30.08 
 
 		 379 aa  102  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1645  saccharopine dehydrogenase  27.72 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.733408 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1243  saccharopine dehydrogenase  30.65 
 
 		 365 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1645  saccharopine dehydrogenase  27.72 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1723  saccharopine dehydrogenase  27.84 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1737  saccharopine dehydrogenase  27.84 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6355  saccharopine dehydrogenase  27.84 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1536  saccharopine dehydrogenase  28.05 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.938044 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5016  saccharopine dehydrogenase  27.56 
 
 		 366 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.288707  normal  0.105633 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2269  saccharopine dehydrogenase  32.26 
 
 		 366 aa  99.4  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.044171  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2080  saccharopine dehydrogenase  32.26 
 
 		 366 aa  99.4  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.599315  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1992  putative saccharopine dehydrogenase, NAD-binding  29.62 
 
 		 365 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.899138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2136  saccharopine dehydrogenase  31.85 
 
 		 366 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112826  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0976  hypothetical protein  31.85 
 
 		 366 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175424  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2308  hypothetical protein  31.85 
 
 		 366 aa  97.4  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2268  Saccharopine dehydrogenase  30.04 
 
 		 365 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.87049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2420  Saccharopine dehydrogenase  29.71 
 
 		 354 aa  95.9  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.870969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0566  saccharopine dehydrogenase  27.6 
 
 		 385 aa  94  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.411174 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2656  saccharopine dehydrogenase  29.29 
 
 		 373 aa  93.2  6e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2920  saccharopine dehydrogenase  29.32 
 
 		 367 aa  91.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1846  Saccharopine dehydrogenase  29.91 
 
 		 389 aa  90.5  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1304  hypothetical protein  29.38 
 
 		 362 aa  89.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1303  hypothetical protein  29.38 
 
 		 362 aa  89.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3251  dehydrogenase  28.8 
 
 		 373 aa  89  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2037  saccharopine dehydrogenase  29.91 
 
 		 389 aa  88.2  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0002  Saccharopine dehydrogenase  28.38 
 
 		 360 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.717423  hitchhiker  0.0043893 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3051  TrkA-N:saccharopine dehydrogenase  31.58 
 
 		 393 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.995368  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0002  Saccharopine dehydrogenase  28.38 
 
 		 360 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0292492 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1936  saccharopine dehydrogenase  30.24 
 
 		 392 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3208  saccharopine dehydrogenase  30.77 
 
 		 397 aa  82.8  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2810  saccharopine dehydrogenase  26.99 
 
 		 380 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111095  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0269  saccharopine dehydrogenase  30.45 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.901872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2155  saccharopine dehydrogenase  29.34 
 
 		 367 aa  75.9  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3947  Saccharopine dehydrogenase  27.71 
 
 		 379 aa  75.9  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05601  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming) (Eurofung)  26.32 
 
 		 450 aa  71.6  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.404414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70210  seventh step in lysine biosynthesis pathway  25.76 
 
 		 444 aa  70.9  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  24.53 
 
 		 748 aa  69.7  0.00000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0106  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate forming)  28.19 
 
 		 380 aa  68.2  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0572  saccharopine dehydrogenase  24.15 
 
 		 388 aa  67  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1836  Saccharopine dehydrogenase  27.71 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.973025 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5447  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  26.07 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  29.5 
 
 		 398 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1202  saccharopine dehydrogenase  23.26 
 
 		 403 aa  51.6  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01665  saccharopine dehydrogenase, putative  22.02 
 
 		 456 aa  48.9  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.000853832  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  21.25 
 
 		 378 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_54394  saccharopine dehydrogenase  29.33 
 
 		 682 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1950  hypothetical protein  27.07 
 
 		 408 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2539  saccharopine dehydrogenase  22.91 
 
 		 398 aa  43.5  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1364  saccharopine dehydrogenase (NADP(+), L-lysine-forming)  22.73 
 
 		 454 aa  43.1  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>