More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0608 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0608  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 444 aa  874    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0055  amino acid permease-associated region  64.86 
 
 		 428 aa  534  1e-150  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.195903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1335  amino acid permease-associated region  61.88 
 
 		 430 aa  486  1e-136  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.654483 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0974  amino acid permease-associated region  63.64 
 
 		 438 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.11694 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0779  amino acid permease-associated region  50 
 
 		 427 aa  420  1e-116  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.047573  normal  0.0991739 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1492  amino acid permease-associated region  30.63 
 
 		 431 aa  154  2e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.993916  normal  0.460323 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  26.34 
 
 		 455 aa  126  7e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2910  UspA domain protein  25.54 
 
 		 649 aa  94.7  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.12405  normal  0.0785631 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1345  amino acid permease-associated region  26.35 
 
 		 521 aa  90.1  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000295081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2908  UspA domain protein  25.19 
 
 		 636 aa  90.1  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.1088  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  22.95 
 
 		 467 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  22.95 
 
 		 467 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  22.95 
 
 		 467 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  22.72 
 
 		 467 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  22.72 
 
 		 467 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  22.72 
 
 		 467 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  22.14 
 
 		 460 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1274  amino acid permease-associated region  24.63 
 
 		 458 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  23.21 
 
 		 495 aa  82  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  23.7 
 
 		 467 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1907  amino acid permease-associated region  24.32 
 
 		 486 aa  80.5  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1252  amino acid permease-associated region  25.05 
 
 		 481 aa  79.7  0.00000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  22.96 
 
 		 467 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  26.72 
 
 		 456 aa  79.3  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2628  amino acid permease-associated region  27.22 
 
 		 453 aa  79.3  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0615557  normal  0.778378 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  25.83 
 
 		 473 aa  79.3  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  26.72 
 
 		 459 aa  79  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0923  amino acid permease  26.74 
 
 		 495 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  25.55 
 
 		 471 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  25.55 
 
 		 471 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  22.78 
 
 		 467 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  24.63 
 
 		 456 aa  77  0.0000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  26.15 
 
 		 455 aa  77  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01917  predicted amino-acid transporter  26.97 
 
 		 452 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1643  amino acid permease-associated region  26.97 
 
 		 452 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.121061  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2305  amino acid permease  26.97 
 
 		 452 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2293  amino acid permease  26.97 
 
 		 452 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.05629 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01903  hypothetical protein  26.97 
 
 		 452 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2295  amino acid permease  26.97 
 
 		 452 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0751676 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2405  amino acid permease  26.97 
 
 		 452 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0506799 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1218  amino acid permease  26.97 
 
 		 452 aa  75.9  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2947  amino acid permease  26.97 
 
 		 452 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.685998  hitchhiker  0.000000000177755 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2246  amino acid permease  26.97 
 
 		 452 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.282071 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  23.54 
 
 		 482 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1626  amino acid permease-associated region  26.97 
 
 		 452 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.287278 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1045  amino acid permease  26.97 
 
 		 452 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0835245 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2192  amino acid permease  26.97 
 
 		 452 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.298897  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2152  amino acid permease  26.97 
 
 		 452 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2587  amino acid permease-associated region  27.54 
 
 		 440 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250393 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  22.7 
 
 		 440 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  22.72 
 
 		 467 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0305  amino acid permease-associated region  23.86 
 
 		 468 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  25.06 
 
 		 471 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  25.18 
 
 		 466 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  25.06 
 
 		 471 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0006  ethanolamine transproter  23.04 
 
 		 467 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56424  hitchhiker  0.00761028 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  22.15 
 
 		 490 aa  75.1  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0020  ethanolamine transproter  23.19 
 
 		 467 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  25.18 
 
 		 466 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0142  ethanolamine transproter  23.31 
 
 		 470 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  27.9 
 
 		 506 aa  73.6  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  24.68 
 
 		 466 aa  73.2  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  24.69 
 
 		 466 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  28.52 
 
 		 447 aa  72.4  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2927  ethanolamine permease  23.19 
 
 		 470 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2212  amino acid permease-associated region  26.15 
 
 		 453 aa  73.2  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0128  ethanolamine transproter  23.19 
 
 		 470 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  25.48 
 
 		 422 aa  72.4  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4821  ethanolamine transproter  24.04 
 
 		 445 aa  72.4  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  24.74 
 
 		 468 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4179  amino acid permease-associated region  26.55 
 
 		 517 aa  72.4  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  24.23 
 
 		 450 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  25.18 
 
 		 467 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  24.34 
 
 		 450 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  23.47 
 
 		 454 aa  71.6  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  25.18 
 
 		 467 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  25.18 
 
 		 467 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1838  amino acid permease-associated region  24.75 
 
 		 517 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  25.61 
 
 		 436 aa  71.2  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  24.64 
 
 		 450 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  25.18 
 
 		 467 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  24.23 
 
 		 450 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4445  ethanolamine transporter, EAT family, APC superfamily  22.48 
 
 		 467 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.697181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  23.71 
 
 		 468 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  26.68 
 
 		 462 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  26.44 
 
 		 495 aa  71.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  26.68 
 
 		 462 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  23.71 
 
 		 468 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  26.68 
 
 		 462 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3470  amino acid permease-associated region  28.25 
 
 		 561 aa  70.9  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0308593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3527  amino acid permease-associated region  26.03 
 
 		 555 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238018  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2029  amino acid permease family protein  26.67 
 
 		 442 aa  70.5  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  26.64 
 
 		 501 aa  70.5  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1930  amino acid permease-associated region  26.18 
 
 		 463 aa  70.5  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372004  hitchhiker  0.00366235 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  24.21 
 
 		 468 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3528  amino acid permease-associated region  26.67 
 
 		 446 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.802107 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0130  amino acid permease-associated region  25.6 
 
 		 515 aa  70.1  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0126  ethanolamine transproter  23.45 
 
 		 461 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.921777 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4371  amino acid permease-associated region  26.62 
 
 		 446 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670873  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3995  amino acid permease-associated region  26.62 
 
 		 446 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140691  normal  0.543798 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>