More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0582 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0582  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 206 aa  420  1e-117  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1948  electron transport protein SCO1/SenC  67.66 
 
 		 248 aa  288  4e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1843  electron transport protein SCO1/SenC  30 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.607401 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  37.25 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  31.34 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  35.59 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0171  electron transport protein SCO1/SenC  30.2 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.474246  normal  0.536403 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1519  PrrC  30.2 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.509925  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1393  electron transport protein SCO1/SenC  31.06 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210991  normal  0.211501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  32.4 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  35.06 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  30.82 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  30.82 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  30.82 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  30.82 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  30.82 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  30.82 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  32.58 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  33.12 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0169  electron transport protein SCO1/SenC  29.34 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  30.24 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  29.76 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  33.77 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  39.66 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  31.4 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  31.45 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  33.12 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  32.19 
 
 		 283 aa  68.2  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009438  Sputcn32_3790  electron transport protein SCO1/SenC  29.86 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2958  electron transport protein SCO1/SenC  34.48 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0515097 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  30.61 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  33.74 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0865  electron transport protein SCO1/SenC  27.45 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4320  electron transport protein SCO1/SenC  30.43 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0146  electron transport protein SCO1/SenC  30.43 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4121  electron transport protein SCO1/SenC  30.43 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  35.19 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4189  electron transport protein SCO1/SenC  30.43 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
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NC_008740  Maqu_0071  electron transport protein SCO1/SenC  30.52 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.420398  n/a   
 
 
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NC_008686  Pden_2780  electron transport protein SCO1/SenC  34.95 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.668811  normal  1 
 
 
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NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  31.85 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
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NC_013173  Dbac_1542  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC  32.45 
 
 		 342 aa  66.2  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
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NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  31.72 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53156 
 
 
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NC_010172  Mext_3935  electron transport protein SCO1/SenC  31.41 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.7944  normal  0.089928 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3431  regulatory protein SenC  33.06 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007912  Sde_0045  GGDEF  39.13 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.986314 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  32.94 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
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NC_008576  Mmc1_1066  electron transport protein SCO1/SenC  30.67 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262024  normal  0.435541 
 
 
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NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  29.75 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1815  electron transport protein SCO1/SenC  32.92 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3999  electron transport protein SCO1/SenC  31.1 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  36.13 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0177907 
 
 
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NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  32 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  30.46 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1973  electron transport protein SCO1/SenC  32.82 
 
 		 239 aa  64.7  0.0000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00159059  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  28.83 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  30.43 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  29.87 
 
 		 199 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4303  electron transport protein SCO1/SenC  30.77 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.82674  normal  0.0643257 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4131  electron transport protein SCO1/SenC  28.03 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.229515  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0189  electron transport protein SCO1/SenC  31.61 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  30.08 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5259  Sco1/SenC family protein  24.76 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  32.41 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.768061 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  28.57 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3800  electron transport protein SCO1/SenC  31.21 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3873  electron transport protein SCO1/SenC  31.21 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  30.71 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4059  electron transport protein SCO1/SenC  31.36 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  37.84 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4615  SCO1/SenC family protein  28.48 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1986  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  29.75 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  30.63 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637304 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3279  electron transport protein SCO1/SenC  37.96 
 
 		 211 aa  62  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508145  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  30.52 
 
 		 209 aa  62  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  29.75 
 
 		 217 aa  62  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  29.75 
 
 		 217 aa  62  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  32.03 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4268  electron transport protein SCO1/SenC  30 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  39.62 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  33.63 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  29.03 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  36.75 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  31.01 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  41.18 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4007  electron transport protein SCO1/SenC  31.16 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612084  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  29.87 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2979  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565267  normal  0.0354023 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1235  hypothetical protein  28.4 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.392676  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  32.59 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  32.59 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
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NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  29.75 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2737  electron transport protein SCO1/SenC  35.51 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.032026  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_5769  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.45 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.68385 
 
 
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NC_008044  TM1040_2839  electron transport protein SCO1/SenC  28.57 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.819932 
 
 
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NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  30.26 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal  1 
 
 
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NC_002978  WD0109  SCO1/SenC family protein  23.97 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.614112  n/a   
 
 
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