198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0544 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0544  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
127 aa  263  5.999999999999999e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.478802  normal  0.402117 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2198  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  47.11 
 
 
134 aa  119  9.999999999999999e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0363167  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2541  benzene/toluene monooxygenase ferredoxin subunit  44.58 
 
 
111 aa  77.8  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3818  Rieske (2Fe-2S) region  45 
 
 
111 aa  71.2  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0794094  normal  0.0599225 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1314  Rieske (2Fe-2S) region  35.42 
 
 
111 aa  71.2  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0871721 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4634  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.54 
 
 
111 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3558  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.54 
 
 
111 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0816  benzene/toluene monooxygenase ferredoxin subunit  41.25 
 
 
111 aa  68.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4859  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.65 
 
 
122 aa  67.4  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0807982  normal  0.0317192 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4027  hypothetical protein  32.29 
 
 
110 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0930  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.96 
 
 
112 aa  63.9  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00957645 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5677  Rieske (2Fe-2S) region  40 
 
 
116 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1596  toluene-4-monooxygenase system protein C  35.29 
 
 
117 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3342  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.36 
 
 
131 aa  62  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.139334  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1765  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.06 
 
 
112 aa  60.1  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.538609  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0586  Rieske 2Fe-2S family protein  33.33 
 
 
104 aa  57  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2045  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.65 
 
 
103 aa  57  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5508  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  33.33 
 
 
104 aa  56.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.358971 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1393  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  35.71 
 
 
117 aa  56.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.982143  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2847  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.93 
 
 
120 aa  54.3  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.15292  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0250  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.39 
 
 
96 aa  54.3  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.172356  normal  0.341461 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2166  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.44 
 
 
123 aa  54.3  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112377 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0922  methanesulfonate monooxygenase component; iron sulfur protein  38.67 
 
 
242 aa  53.9  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.738029  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4301  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.84 
 
 
111 aa  53.9  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.828362  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0213  Rieske (2Fe-2S) protein  27 
 
 
126 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.225427 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2594  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  31.63 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.101505 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3052  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  34.83 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.279296  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3120  pyruvate oxidase  30 
 
 
656 aa  52  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.777401  normal  0.194873 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0914  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.9 
 
 
518 aa  52  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0653376  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1616  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32 
 
 
101 aa  51.2  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1935  hypothetical protein  32.08 
 
 
120 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455363  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6713  putative ferredoxin  37.7 
 
 
96 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491449  normal  0.188584 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1586  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27.27 
 
 
107 aa  50.1  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0591  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  22.77 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0965  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.3 
 
 
100 aa  49.7  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00646524 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0434  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  32.98 
 
 
105 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0329756 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5941  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 
526 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2106  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  26.92 
 
 
127 aa  49.7  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298831  normal  0.595074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4263  hypothetical protein  27.43 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.603078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2261  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.91 
 
 
451 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.501728 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0526  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.43 
 
 
321 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814974 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0225  Rieske 2Fe-2S family protein  30.3 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0375984  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1502  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.77 
 
 
105 aa  48.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.165892 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1482  Rieske (2Fe-2S) region  27.27 
 
 
110 aa  47.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2967  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirD  27 
 
 
114 aa  47.8  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.476557  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0895  hypothetical protein  30.39 
 
 
315 aa  47.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0773726  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2461  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.63 
 
 
104 aa  47.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.601158  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3969  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.1 
 
 
105 aa  47.4  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2239  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.83 
 
 
350 aa  47  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1739  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.71 
 
 
101 aa  47  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2821  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25 
 
 
106 aa  47  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.541392  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1197  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  30.48 
 
 
112 aa  47  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.430122  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0621  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.1 
 
 
118 aa  47  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.503697  normal  0.0996208 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2315  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.89 
 
 
546 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333875  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0817  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  22.77 
 
 
103 aa  46.2  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3278  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  22.32 
 
 
128 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2741  cytochrome P450  24.21 
 
 
599 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25917  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2329  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  26.21 
 
 
129 aa  46.2  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2840  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  26.21 
 
 
129 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.41626 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0308  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.34 
 
 
102 aa  46.2  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.359094 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0987  Rieske 2Fe-2S family protein  30.3 
 
 
106 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2675  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.85 
 
 
506 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148641  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6009  Rieske (2Fe-2S) protein  27 
 
 
102 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322393  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1307  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.67 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1335  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.67 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000656447 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1694  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.58 
 
 
105 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2486  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.32 
 
 
112 aa  45.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.812063  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2796  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  31.65 
 
 
108 aa  45.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.654028  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1985  putative dioxygenase  33.33 
 
 
110 aa  45.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1989  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  34.33 
 
 
104 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1194  biphenyl 2,3-dioxygenase ferredoxin subunit (BphA3)  30.61 
 
 
109 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0889683  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2673  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  28.71 
 
 
270 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1143  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  25.51 
 
 
103 aa  45.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2821  Rieske (2Fe-2S) region  27 
 
 
102 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1381  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.71 
 
 
123 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2095  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  20.72 
 
 
108 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0602377  normal  0.0657417 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7180  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.93 
 
 
114 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.602112 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1229  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.21 
 
 
545 aa  45.1  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.610948  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0130  Rieske (2Fe-2S) protein  29.27 
 
 
106 aa  44.7  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2955  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  28.87 
 
 
115 aa  45.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4335  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  26.96 
 
 
118 aa  44.7  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4812  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.16 
 
 
304 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2708  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.51 
 
 
107 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2246  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.48 
 
 
109 aa  45.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00879762  normal  0.228447 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2710  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27 
 
 
102 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.332301  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2070  MocE Rieske (2Fe-2S)  27 
 
 
102 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.143591  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2681  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27 
 
 
102 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1349  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.08 
 
 
95 aa  44.7  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.203828 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2308  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  22 
 
 
110 aa  44.3  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.619497  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4288  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.71 
 
 
105 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4115  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  40.38 
 
 
127 aa  44.3  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.063358  normal  0.0248701 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4283  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.51 
 
 
108 aa  44.3  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0344911  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3163  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  32.35 
 
 
105 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.33632  normal  0.290875 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3462  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30 
 
 
116 aa  43.9  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1969  nitrite reductase (NAD(P)H)  33.33 
 
 
105 aa  43.9  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.595397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1948  nitrite reductase  33.33 
 
 
105 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2176  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  33.33 
 
 
105 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2734  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27 
 
 
102 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5347  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.03 
 
 
105 aa  43.9  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210101  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2151  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  33.33 
 
 
105 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.981833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>