126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0458 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0458  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  377  1e-104  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0836  hypothetical protein  83.98 
 
 
189 aa  327  7e-89  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1438  3-hydroxybutyryl-CoA epimerase  82.02 
 
 
576 aa  323  6e-88  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.410853  normal  0.0151032 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0397  hypothetical protein  50.29 
 
 
177 aa  182  3e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  45.76 
 
 
178 aa  175  3e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0436  protein of unknown function DUF35  44.66 
 
 
128 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.686015  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0387  hypothetical protein  39.81 
 
 
129 aa  100  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.448785  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1310  hypothetical protein  39.13 
 
 
151 aa  88.2  6e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120998 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  33.04 
 
 
138 aa  75.9  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  31.96 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  30.91 
 
 
130 aa  67  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  30.91 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1357  hypothetical protein  33.04 
 
 
132 aa  66.6  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0155  hypothetical protein  32.71 
 
 
130 aa  65.1  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1392  hypothetical protein  33.04 
 
 
152 aa  63.9  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  32.18 
 
 
130 aa  62.8  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0023  hypothetical protein  30.97 
 
 
130 aa  62  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5554  hypothetical protein  34.94 
 
 
157 aa  62  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1934  hypothetical protein  31 
 
 
133 aa  61.2  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0108502  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0794  hypothetical protein  31.3 
 
 
133 aa  61.2  0.000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0812  hypothetical protein  31.3 
 
 
134 aa  60.5  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.553396  hitchhiker  0.000113363 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0598  protein of unknown function DUF35  29.66 
 
 
127 aa  59.7  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0549  hypothetical protein  29.9 
 
 
132 aa  59.7  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  32.94 
 
 
132 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2508  protein of unknown function DUF35  33.33 
 
 
132 aa  60.1  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.347955  normal  0.395372 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1083  hypothetical protein  35.63 
 
 
134 aa  58.9  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  29.89 
 
 
129 aa  58.9  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  29.59 
 
 
134 aa  58.5  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  33.98 
 
 
141 aa  57.4  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  29.41 
 
 
143 aa  57  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5281  hypothetical protein  34.94 
 
 
146 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  29.91 
 
 
130 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0317  protein of unknown function DUF35  32.94 
 
 
124 aa  55.8  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2363  hypothetical protein  27.83 
 
 
130 aa  56.2  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  24.79 
 
 
135 aa  55.5  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  28.33 
 
 
143 aa  55.5  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  30 
 
 
135 aa  55.5  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2840  protein of unknown function DUF35  28 
 
 
132 aa  55.5  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00189293  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  24.76 
 
 
139 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3659  hypothetical protein  31.45 
 
 
137 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.17734  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3732  hypothetical protein  31.45 
 
 
137 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.315586 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1625  hypothetical protein  27.03 
 
 
130 aa  55.1  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  28.71 
 
 
129 aa  55.1  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  29.7 
 
 
130 aa  54.7  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3090  protein of unknown function DUF35  32.48 
 
 
335 aa  54.7  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  28.97 
 
 
130 aa  54.3  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3388  hypothetical protein  30.58 
 
 
138 aa  54.3  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.809106  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  28.16 
 
 
133 aa  54.3  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3672  hypothetical protein  30.89 
 
 
141 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.108807  normal  0.573153 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0149  hypothetical protein  29.13 
 
 
129 aa  53.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  27.12 
 
 
137 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5775  protein of unknown function DUF35  24.77 
 
 
129 aa  53.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0423668  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  28.04 
 
 
137 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5112  hypothetical protein  29.17 
 
 
132 aa  52.8  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000923569  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  24.58 
 
 
144 aa  52  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  28.1 
 
 
141 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  27.05 
 
 
140 aa  52.4  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  30.89 
 
 
143 aa  52  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4138  hypothetical protein  29.41 
 
 
146 aa  51.2  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67568  normal  0.342554 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3932  protein of unknown function DUF35  29.79 
 
 
144 aa  51.6  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  30 
 
 
137 aa  51.6  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  26.23 
 
 
319 aa  51.2  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0854  protein of unknown function DUF35  28.92 
 
 
116 aa  50.8  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0219431  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  28.21 
 
 
137 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  26.67 
 
 
144 aa  50.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2520  hypothetical protein  27.73 
 
 
146 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167569  normal  0.666068 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  28.57 
 
 
137 aa  50.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  29.13 
 
 
148 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1609  protein of unknown function DUF35  30.63 
 
 
133 aa  49.7  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.71 
 
 
418 aa  50.1  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  25.64 
 
 
136 aa  49.7  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0128  hypothetical protein  25.44 
 
 
127 aa  49.3  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0146  protein of unknown function DUF35  25.44 
 
 
127 aa  49.3  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3587  hypothetical protein  30.3 
 
 
133 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645775  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1009  hypothetical protein  30.12 
 
 
97 aa  48.9  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3906  hypothetical protein  26.45 
 
 
143 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0256992  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1485  hypothetical protein  36.25 
 
 
134 aa  48.5  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208143  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0032  hypothetical protein  30.33 
 
 
138 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662095  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  27.73 
 
 
135 aa  48.5  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  25.42 
 
 
137 aa  48.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0902  hypothetical protein  28.46 
 
 
140 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2476  protein of unknown function DUF35  27.45 
 
 
134 aa  47.8  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.73466  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  21.05 
 
 
133 aa  47.8  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0268  hypothetical protein  32.29 
 
 
141 aa  47.8  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00125281  normal  0.120379 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  27.35 
 
 
130 aa  47.8  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  28.72 
 
 
149 aa  47.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  31 
 
 
143 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  30.69 
 
 
132 aa  47.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0042  hypothetical protein  30.33 
 
 
138 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0051  hypothetical protein  30.33 
 
 
138 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0173713  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1972  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon-like protein  27.71 
 
 
150 aa  47.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  26.67 
 
 
311 aa  47  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2366  hypothetical protein  28.92 
 
 
152 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.206302  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  30.1 
 
 
132 aa  46.6  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000585754  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1497  protein of unknown function DUF35  28.26 
 
 
417 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2662  hypothetical protein  26.73 
 
 
136 aa  46.2  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4132  hypothetical protein  29.31 
 
 
149 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.479777  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0178  hypothetical protein  24.56 
 
 
134 aa  46.6  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82614  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  26.8 
 
 
120 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  28.46 
 
 
140 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.450465 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>