More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0447 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0447  inner-membrane translocator  100 
 
 		 290 aa  544  1e-154  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0847  inner-membrane translocator  72.51 
 
 		 291 aa  391  1e-108  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.658608 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1523  inner-membrane translocator  73.88 
 
 		 291 aa  390  1e-107  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00164732  normal  0.617596 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0548  inner-membrane translocator  72.85 
 
 		 291 aa  365  1e-100  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.081498  hitchhiker  0.0000417079 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1563  inner-membrane translocator  35.79 
 
 		 283 aa  144  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1707  inner-membrane translocator  34.71 
 
 		 294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.666506  normal  0.0117709 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1619  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 290 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.755467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0793  inner-membrane translocator  34.49 
 
 		 290 aa  136  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1905  inner-membrane translocator  34.03 
 
 		 290 aa  133  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.419507 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  37.93 
 
 		 287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3646  inner-membrane translocator  34.27 
 
 		 287 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.362219  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0005  inner-membrane translocator  36.73 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.901395  hitchhiker  0.00000431174 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  31.25 
 
 		 308 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  30.77 
 
 		 292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1438  inner-membrane translocator  36.29 
 
 		 288 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2425  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  35.89 
 
 		 288 aa  125  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.674149  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1533  inner-membrane translocator  35.89 
 
 		 288 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575934  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3980  ABC transporter permease  35.99 
 
 		 287 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0118656 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1099  inner-membrane translocator  33.1 
 
 		 292 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110891  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1130  inner-membrane translocator  34.13 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1928  inner-membrane translocator  34.04 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.45272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2141  inner-membrane translocator  34.51 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.694846 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2127  inner-membrane translocator  33.56 
 
 		 292 aa  122  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172623  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1253  inner-membrane translocator  33.68 
 
 		 308 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27605 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  29.76 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1444  urea ABC transporter, permease protein UrtB  33.68 
 
 		 308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  34.38 
 
 		 287 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0862  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.12 
 
 		 288 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0185519  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0400  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.76 
 
 		 298 aa  119  3.9999999999999996e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0655  branched chain amino acid ABC transporter permease  33.68 
 
 		 308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.481905 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3863  inner-membrane translocator  32.99 
 
 		 308 aa  118  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.343461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1581  inner-membrane translocator  31.67 
 
 		 308 aa  118  9e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.53 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5994  branched chain amino acid ABC transporter permease  31.12 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0717664 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3749  inner-membrane translocator  33.55 
 
 		 295 aa  116  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0896  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 295 aa  117  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1721  inner-membrane translocator  31.6 
 
 		 290 aa  116  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.021923  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0142  inner-membrane translocator  33.59 
 
 		 288 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5511  urea ABC transporter, permease protein UrtB  33.11 
 
 		 308 aa  115  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.707108  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1194  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.23 
 
 		 287 aa  115  7.999999999999999e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1096  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.23 
 
 		 287 aa  115  7.999999999999999e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0327  inner-membrane translocator  33.78 
 
 		 293 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0975712  normal  0.166918 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3239  urea ABC transporter, permease protein UrtB  33.56 
 
 		 292 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00145341  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0594  urea ABC transporter, permease protein UrtB  32.89 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1501  inner-membrane translocator  30.66 
 
 		 291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14327  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2006  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.95 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.766894  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  32.53 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1091  inner-membrane translocator  32.51 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2885  putative ABC transporter permiase component  31.45 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257829 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3571  urea ABC transporter, permease protein UrtB  31.4 
 
 		 308 aa  114  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.410168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5975  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 285 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.599678  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  33.56 
 
 		 297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3689  urea ABC transporter, permease protein UrtB  31.4 
 
 		 308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1949  inner-membrane translocator  31.39 
 
 		 292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.926324  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0220  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.2 
 
 		 290 aa  113  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1664  inner-membrane translocator  32.6 
 
 		 292 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.43 
 
 		 294 aa  112  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3380  urea ABC transporter, permease protein UrtB  31.4 
 
 		 308 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0513  inner-membrane translocator  31.64 
 
 		 309 aa  112  8.000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0503611  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0977  urea ABC transporter, permease protein UrtB  31.74 
 
 		 308 aa  112  9e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.21 
 
 		 293 aa  112  9e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0229  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  30.39 
 
 		 308 aa  112  9e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.689889 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3394  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.53 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0336  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.43 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3619  inner-membrane translocator  31.75 
 
 		 305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2006  inner-membrane translocator  33.07 
 
 		 301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  29.01 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  32.31 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0534  inner-membrane translocator  33.06 
 
 		 290 aa  109  4.0000000000000004e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000179103 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0245  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  30.13 
 
 		 308 aa  109  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3973  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  30.13 
 
 		 308 aa  109  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1848  inner-membrane translocator  31.75 
 
 		 292 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623579  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3667  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  30.13 
 
 		 308 aa  109  5e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.344938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7434  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  29.25 
 
 		 287 aa  108  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2366  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.04 
 
 		 299 aa  108  9.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00045769  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3837  inner-membrane translocator  32 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622329  normal  0.114435 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3934  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  30.23 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0785  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.77 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3832  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  30.23 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.377986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3875  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  30.23 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.1 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2500  inner-membrane translocator  31.69 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3765  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  30.23 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3754  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  30.23 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3104  inner-membrane translocator  30.56 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.60376 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.1 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  30.1 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0949  inner-membrane translocator  34.16 
 
 		 540 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3399  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0293629 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4018  inner-membrane translocator  32.87 
 
 		 639 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1838  inner-membrane translocator  32.56 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3866  inner-membrane translocator  31.58 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1161  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.79 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0521  inner-membrane translocator  30.87 
 
 		 304 aa  106  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0983  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.1 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156629  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2166  inner-membrane translocator  32.62 
 
 		 286 aa  107  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1036  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.79 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.203386  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0313  inner-membrane translocator  29.51 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.477934 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3860  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  29.9 
 
 		 308 aa  106  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0932593 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2987  ABC transporter inner-membrane translocator  31.08 
 
 		 547 aa  106  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.334441 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>