101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0273 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0273  ribonuclease H  100 
 
 		 199 aa  399  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.442052 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0755  ribonuclease H  49.73 
 
 		 187 aa  165  4e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1739  ribonuclease H  48.63 
 
 		 187 aa  164  8e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2246  ribonuclease H  40.74 
 
 		 148 aa  115  3.9999999999999997e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.454266  hitchhiker  0.00558183 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  41.73 
 
 		 391 aa  97.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  41.04 
 
 		 369 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2428  ribonuclease H  37.04 
 
 		 198 aa  91.3  8e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0162  ribonuclease H  39.01 
 
 		 142 aa  89.7  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.765291  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4219  ribonuclease H  35.71 
 
 		 313 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  40 
 
 		 356 aa  89  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  39.17 
 
 		 365 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  39.17 
 
 		 365 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  39.17 
 
 		 365 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0341  ribonuclease H  46.83 
 
 		 142 aa  85.1  7e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  39.17 
 
 		 370 aa  84  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1437  ribonuclease H  40.3 
 
 		 134 aa  83.6  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1173  ribonuclease H  36.23 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  43.2 
 
 		 383 aa  83.6  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12257  bifunctional RNase H/acid phosphatase  37.4 
 
 		 364 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000101677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0764  ribonuclease H  36.84 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00463107  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0723  ribonuclease H  38.76 
 
 		 168 aa  82  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0760  ribonuclease H  38.76 
 
 		 253 aa  81.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0760  ribonuclease H  38.76 
 
 		 253 aa  81.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.641893  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4815  ribonuclease H  40.5 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.084828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1556  ribonuclease H  36.03 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0179  ribonuclease H  40.77 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  39.86 
 
 		 440 aa  78.2  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1384  ribonuclease H  36.36 
 
 		 216 aa  77.8  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000297522  normal  0.0974241 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  38.93 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  34.83 
 
 		 378 aa  76.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 412 aa  75.9  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2587  ribonuclease H  39.1 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  40.77 
 
 		 427 aa  75.5  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1207  ribonuclease H  41.35 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.623117  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3066  ribonuclease H  36.76 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.71 
 
 		 382 aa  72  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  38.24 
 
 		 411 aa  71.2  0.000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  37.4 
 
 		 401 aa  70.9  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.66 
 
 		 378 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09490  ribonuclease HI  36.99 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0088  ribonuclease H  34.87 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  33.82 
 
 		 363 aa  67  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_8015  predicted protein  37.93 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00418489  normal  0.339866 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4711  ribonuclease H  33.33 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.42605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0309  ribonuclease H  39.1 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  36.75 
 
 		 366 aa  63.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0307  ribonuclease H  37.59 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.483531  normal  0.133717 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  35.48 
 
 		 452 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1511  ribonuclease H  32.59 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1507  ribonuclease H  32.59 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1479  ribonuclease H  32.59 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.221091  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1469  ribonuclease H  32.59 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.718462  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1623  ribonuclease H  32.59 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1764  ribonuclease H  32.59 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1659  ribonuclease H  31.85 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3686  ribonuclease H  31.85 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1691  ribonuclease H  32.59 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1714  ribonuclease H  32.59 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461816  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3660  ribonuclease H  35.77 
 
 		 133 aa  60.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270083  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1321  ribonuclease H  30.66 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00120412  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  39.09 
 
 		 402 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4830  ribonuclease H  32.06 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.935261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1351  ribonuclease H  31.78 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1325  hypothetical protein  27.59 
 
 		 417 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1354  Ribonuclease HI-like protein  27.59 
 
 		 417 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.384272  hitchhiker  0.000000713582 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3014  hypothetical protein  36.13 
 
 		 154 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_303  hypothetical protein  33.77 
 
 		 81 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5247  ribonuclease H  34.97 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.021715 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  35.78 
 
 		 412 aa  51.2  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1514  hypothetical protein  31.18 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.988638  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0205  ribonuclease H  35.06 
 
 		 118 aa  49.7  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1261  hypothetical protein  28.15 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000530874  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1510  hypothetical protein  30.11 
 
 		 219 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00387825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1482  hypothetical protein  30.11 
 
 		 219 aa  48.9  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00299732  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1626  hypothetical protein  30.11 
 
 		 219 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2679  hypothetical protein  33.1 
 
 		 149 aa  48.9  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.207946  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1472  hypothetical protein  30.11 
 
 		 219 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0667267  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1717  hypothetical protein  30.11 
 
 		 219 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387323  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1768  hypothetical protein  30.11 
 
 		 219 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1694  hypothetical protein  30.11 
 
 		 219 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1663  hypothetical protein  25.19 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1494  ribonuclease HI-like protein  26.6 
 
 		 133 aa  47  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1523  cell wall enzyme EbsB-like protein  26.6 
 
 		 133 aa  47  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3682  hypothetical protein  30.34 
 
 		 219 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1324  hypothetical protein  31.37 
 
 		 219 aa  46.2  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000515383  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5115  hypothetical protein  28 
 
 		 388 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.503544 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5812  ribonuclease H  34.27 
 
 		 223 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2527  RNase HI  33.72 
 
 		 150 aa  45.4  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1491  putative ribonuclease HI  33.11 
 
 		 251 aa  44.3  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0175251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3175  ribonuclease H  37.8 
 
 		 262 aa  43.5  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.983549  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0483  ribonuclease H  31.94 
 
 		 143 aa  43.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44751  predicted protein  33.01 
 
 		 376 aa  43.5  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155872  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2729  ribonuclease H  37.5 
 
 		 192 aa  43.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0872  ribonuclease H  38.37 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3313  Ribonuclease H  40.74 
 
 		 157 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1682  ribonuclease H  40 
 
 		 254 aa  42.7  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.240069  unclonable  0.00000212508 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1511  ribonuclease H  38.46 
 
 		 302 aa  42.4  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00182171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2143  hypothetical protein  27.41 
 
 		 221 aa  42  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1923  hypothetical protein  30.51 
 
 		 124 aa  41.6  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1800  ribonuclease H  36.78 
 
 		 183 aa  41.6  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>