More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0096 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0096  competence damage-inducible protein A  100 
 
 
265 aa  527  1e-149  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1136  competence damage-inducible protein A  73.58 
 
 
282 aa  412  1e-114  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000100005 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0062  competence damage-inducible protein A  78.97 
 
 
262 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0088  competence damage-inducible protein A  73.21 
 
 
271 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.747767  normal  0.181951 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1376  competence damage-inducible protein A  67.72 
 
 
273 aa  346  2e-94  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.255689  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1209  molybdopterin binding domain-containing protein  52.78 
 
 
257 aa  251  8.000000000000001e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.497342  hitchhiker  0.00709222 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1079  molybdopterin binding domain protein  44.92 
 
 
264 aa  215  7e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2121  competence damage-inducible protein A  42.58 
 
 
272 aa  207  1e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.240966 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3269  molybdopterin binding domain-containing protein  39.75 
 
 
274 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2409  molybdopterin binding domain-containing protein  39.25 
 
 
275 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000922318  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1059  molybdopterin binding domain protein  37.65 
 
 
372 aa  157  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  40.74 
 
 
423 aa  154  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0886  molybdopterin binding domain-containing protein  38.21 
 
 
274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000053068  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1991  molybdopterin binding domain-containing protein  38.36 
 
 
272 aa  152  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1446  molybdopterin binding domain protein  37.5 
 
 
276 aa  149  4e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00634302  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1471  competence/damage-inducible protein CinA  38.27 
 
 
406 aa  148  9e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.127151  normal  0.989632 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  37.86 
 
 
413 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  38.65 
 
 
413 aa  145  7.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  35.56 
 
 
415 aa  144  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  36.86 
 
 
415 aa  144  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  38.55 
 
 
427 aa  143  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  38.62 
 
 
417 aa  142  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  37.05 
 
 
411 aa  142  6e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  36.84 
 
 
411 aa  141  9e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  36 
 
 
412 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  36 
 
 
412 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  40.51 
 
 
420 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2136  competence-damaged protein  36.25 
 
 
406 aa  138  7.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0347  competence/damage-inducible protein CinA  33.07 
 
 
393 aa  135  7.000000000000001e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.85118  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4097  molybdopterin binding domain-containing protein  31.92 
 
 
392 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  33.07 
 
 
419 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2509  competence/damage-inducible protein CinA  34.16 
 
 
395 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  35.86 
 
 
419 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2330  competence/damage-inducible protein CinA  38.14 
 
 
418 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  37.74 
 
 
410 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  32.53 
 
 
411 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  38.66 
 
 
414 aa  132  3.9999999999999996e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0522  competence/damage-inducible protein CinA  40.45 
 
 
415 aa  132  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100645  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1340  molybdopterin binding domain-containing protein  35.71 
 
 
246 aa  132  6.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  33.33 
 
 
416 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  36.97 
 
 
408 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  34.5 
 
 
415 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  35.66 
 
 
414 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0108  competence/damage-inducible protein CinA  33.99 
 
 
391 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1092  molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.5 
 
 
401 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.200518  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  35.53 
 
 
418 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  34.8 
 
 
401 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  34.52 
 
 
415 aa  129  3e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  36.64 
 
 
413 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  37.5 
 
 
433 aa  129  7.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1385  molybdopterin binding domain-containing protein  36.97 
 
 
253 aa  128  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0445129  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1593  molybdopterin binding domain protein  37.44 
 
 
258 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  33.73 
 
 
417 aa  128  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  42.01 
 
 
416 aa  127  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  37.28 
 
 
412 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1344  competence/damage-inducible protein CinA  30.2 
 
 
383 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.827077  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0392  molybdopterin binding domain-containing protein  36.76 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.162299  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  34.16 
 
 
413 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  35 
 
 
415 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1370  competence/damage-inducible protein CinA  30.2 
 
 
383 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0481816  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  38 
 
 
408 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  37.5 
 
 
412 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2606  competence-damage associated protein  36.36 
 
 
260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187764  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  36.92 
 
 
425 aa  126  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  33.73 
 
 
416 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  36.45 
 
 
420 aa  126  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  35.26 
 
 
412 aa  125  5e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  34.77 
 
 
413 aa  125  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  41.54 
 
 
432 aa  125  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0143  competence-damaged protein  39.8 
 
 
423 aa  125  7e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.816371  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0301  hypothetical protein  36.82 
 
 
416 aa  125  7e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.241188 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  37.5 
 
 
408 aa  125  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3879  competence damage-inducible protein A  36.98 
 
 
412 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000712597  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  36.03 
 
 
420 aa  125  9e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_004310  BR1048  cinA-related protein  37.04 
 
 
252 aa  124  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0856  competence/damage-inducible protein CinA  37.61 
 
 
399 aa  124  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0938297  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  39.15 
 
 
438 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  36.98 
 
 
412 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  36.98 
 
 
412 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1417  molybdopterin binding domain  36.49 
 
 
258 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348811  normal  0.21412 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0125  competence/damage-inducible protein CinA  36.41 
 
 
400 aa  124  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0114565  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  39.18 
 
 
414 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  40.7 
 
 
423 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  36.98 
 
 
412 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0259  competence/damage-inducible protein cinA  32.11 
 
 
424 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  36.98 
 
 
412 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  36.98 
 
 
412 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  35.38 
 
 
437 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0851  competence/damage-inducible protein CinA, putative  29.8 
 
 
382 aa  123  3e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  36.98 
 
 
412 aa  123  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  40.57 
 
 
425 aa  123  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  31.68 
 
 
429 aa  122  4e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2541  competence/damage-inducible protein CinA  36.68 
 
 
423 aa  122  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  32.81 
 
 
416 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  40.24 
 
 
418 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  36.46 
 
 
412 aa  122  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3390  competence damage-inducible protein A  31.58 
 
 
400 aa  122  7e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2392  competence damage-inducible protein A  31.58 
 
 
400 aa  122  7e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2403  competence damage-inducible protein A  31.98 
 
 
400 aa  122  7e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2544  competence damage-inducible protein A  31.58 
 
 
400 aa  122  7e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>