20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0094 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0094  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  360  5.0000000000000005e-99  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1133  hypothetical protein  67.42 
 
 
178 aa  251  4.0000000000000004e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000676168 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0085  hypothetical protein  62.57 
 
 
179 aa  226  2e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.273973  normal  0.252446 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0059  AAA ATPase  55.56 
 
 
180 aa  217  6e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1480  AAA type ATPase  33.03 
 
 
318 aa  46.2  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4051  AAA ATPase, central region  34.29 
 
 
304 aa  45.4  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.16821  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3749  AAA ATPase, central region  34.29 
 
 
304 aa  45.4  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225379  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07246  conserved hypothetical protein  37.66 
 
 
2310 aa  44.7  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2927  CbbX like protein  33.33 
 
 
304 aa  43.9  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.79109 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1916  CbxX/CfqX monofunctional  37.8 
 
 
317 aa  43.9  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.931527 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2939  ATPase central domain-containing protein  34.41 
 
 
309 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.949786  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0684  AAA ATPase, central region  32.26 
 
 
320 aa  43.9  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2710  ATPase central domain-containing protein  34.41 
 
 
309 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.947167 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3926  CbxX/CfqX monofunctional  33.7 
 
 
311 aa  43.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1280  CbbX protein  34.41 
 
 
341 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0325141  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0453  CbbX-like protein  35.37 
 
 
334 aa  42.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.127977 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1701  ATPase central domain-containing protein  36.59 
 
 
308 aa  42.4  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164899  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6395  CbbX-like protein  31.19 
 
 
310 aa  42  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.132342  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3253  phosphoribulokinase/uridine kinase  31.71 
 
 
312 aa  42  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.346779  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0763  ATPase  31.18 
 
 
301 aa  41.6  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0658959 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>