More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0080 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0080  nucleotidyl transferase  100 
 
 
225 aa  456  1e-127  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1119  nucleotidyl transferase  71.56 
 
 
225 aa  338  5e-92  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0230664 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0072  nucleotidyl transferase  71.11 
 
 
225 aa  331  5e-90  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.155346 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0043  nucleotidyl transferase  63.72 
 
 
227 aa  287  8e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1341  nucleotidyl transferase  36.77 
 
 
230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000168829  normal  0.809045 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1518  nucleotidyltransferase family protein  33.18 
 
 
341 aa  119  4.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.973367  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0380  nucleotidyltransferase family protein  33.18 
 
 
341 aa  118  7e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0885  Nucleotidyl transferase  35.87 
 
 
229 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  36.22 
 
 
818 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  36.14 
 
 
820 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  35.2 
 
 
776 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4857  nucleotidyl transferase  34.26 
 
 
351 aa  113  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  0.292001 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
348 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  34.41 
 
 
816 aa  108  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  33.88 
 
 
349 aa  108  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  34.59 
 
 
712 aa  107  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  35.64 
 
 
821 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  29.57 
 
 
820 aa  106  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1624  nucleotidyl transferase  35.87 
 
 
367 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1231  flagellin modification protein PtmE, putative sugar-phosphate nucleotide transferase  31.05 
 
 
345 aa  107  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000208573  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  30.97 
 
 
784 aa  105  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  30.97 
 
 
784 aa  105  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  33.91 
 
 
827 aa  105  5e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  30.97 
 
 
784 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  30.97 
 
 
784 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  30.97 
 
 
784 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  30.97 
 
 
784 aa  105  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  30.97 
 
 
784 aa  105  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  30.97 
 
 
784 aa  104  9e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  30.97 
 
 
784 aa  104  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3557  nucleotidyl transferase  30.32 
 
 
238 aa  104  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  31.72 
 
 
828 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1968  nucleotidyltransferase family protein  31.67 
 
 
476 aa  103  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1584  nucleotidyl transferase  32.29 
 
 
238 aa  103  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1489  nucleotidyl transferase  34.08 
 
 
230 aa  103  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.523541  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0541  nucleotidyl transferase  28.12 
 
 
238 aa  103  3e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  30.13 
 
 
784 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  29.69 
 
 
830 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  30.57 
 
 
842 aa  102  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  32.03 
 
 
835 aa  101  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0492  nucleotidyl transferase  34.53 
 
 
230 aa  102  7e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000162703 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  29.13 
 
 
832 aa  101  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0529  Nucleotidyl transferase  31.82 
 
 
352 aa  100  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  31.72 
 
 
785 aa  100  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  32.31 
 
 
843 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  32.07 
 
 
810 aa  99.8  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  34.54 
 
 
854 aa  99.4  4e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  31.17 
 
 
833 aa  99.4  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  34.81 
 
 
370 aa  99  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  27.07 
 
 
832 aa  99  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  34.25 
 
 
818 aa  99  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  30 
 
 
830 aa  99  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  33 
 
 
841 aa  98.2  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  31.47 
 
 
833 aa  98.2  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  32.13 
 
 
347 aa  97.8  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4603  Nucleotidyl transferase  30.18 
 
 
329 aa  97.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.726116  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0598  nucleotidyl transferase  28.7 
 
 
348 aa  97.1  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.534705  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  30.6 
 
 
841 aa  97.1  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  34.25 
 
 
370 aa  96.3  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  31.56 
 
 
366 aa  96.3  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  32.61 
 
 
832 aa  95.9  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4077  nucleotidyl transferase  31.39 
 
 
238 aa  96.3  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.957763  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  31.42 
 
 
842 aa  95.5  6e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4088  nucleotidyl transferase  30.14 
 
 
351 aa  95.5  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  29.78 
 
 
361 aa  94.4  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  33.78 
 
 
842 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0498  mannose-1-phosphate guanyltransferase  32.68 
 
 
837 aa  94.7  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  30.53 
 
 
827 aa  94.4  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2808  nucleotidyl transferase  29.82 
 
 
346 aa  94.4  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  28.83 
 
 
361 aa  94.4  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0843  nucleotidyl transferase  32.83 
 
 
222 aa  94.7  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000793597 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01171  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  31.05 
 
 
320 aa  94.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  30.97 
 
 
840 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  30.39 
 
 
828 aa  93.6  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  31.44 
 
 
842 aa  93.6  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0409  Nucleotidyl transferase  31.49 
 
 
237 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149684  normal  0.359368 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4321  Nucleotidyl transferase  28.06 
 
 
238 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0757  nucleotidyl transferase  27.44 
 
 
354 aa  92.8  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.550626 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4822  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
326 aa  92.8  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14051  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  31.18 
 
 
356 aa  92.4  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3932  Nucleotidyl transferase  31.69 
 
 
381 aa  92.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  30 
 
 
843 aa  92  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  27.63 
 
 
836 aa  92  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12391  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  31.72 
 
 
353 aa  91.7  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0812001  normal  0.0145083 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1143  nucleotidyl transferase  30.86 
 
 
388 aa  90.9  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149781 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2137  mannose-1-phosphate guanyltransferase  29.52 
 
 
343 aa  91.3  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.908001  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2982  nucleotidyl transferase  26.48 
 
 
350 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0566081  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2394  nucleotidyl transferase  30.28 
 
 
346 aa  90.1  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01681  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  30.08 
 
 
392 aa  90.1  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  34.55 
 
 
384 aa  90.1  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  28.11 
 
 
835 aa  90.1  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3126  nucleotidyl transferase  26.48 
 
 
350 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0234  Nucleotidyl transferase  27.8 
 
 
319 aa  90.1  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2301  nucleotidyl transferase  30.27 
 
 
348 aa  89.7  3e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  31.47 
 
 
834 aa  89.4  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1456  nucleotidyl transferase  29.84 
 
 
361 aa  89.4  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3979  Nucleotidyl transferase  30.59 
 
 
360 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3178  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  27.63 
 
 
836 aa  89  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.335265 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  28.18 
 
 
835 aa  89  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2585  nucleotidyl transferase  28.34 
 
 
367 aa  88.6  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000196984 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>