More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0078 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
302 aa  593  1e-168  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  78.88 
 
 
305 aa  488  1e-137  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0070  ribokinase-like domain-containing protein  80.2 
 
 
305 aa  450  1e-125  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.60231  normal  0.104072 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  73.93 
 
 
304 aa  447  1e-125  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  49.83 
 
 
318 aa  281  1e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  37.76 
 
 
310 aa  169  6e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  30.59 
 
 
308 aa  128  1e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  30.45 
 
 
317 aa  122  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  30.03 
 
 
290 aa  122  5e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0569  PfkB domain protein  33.11 
 
 
295 aa  122  6e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3558  PfkB domain protein  36.46 
 
 
287 aa  122  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  30.48 
 
 
306 aa  121  1e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  7.20941e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  33.77 
 
 
308 aa  120  2e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2764  PfkB domain protein  33.79 
 
 
289 aa  120  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.11778  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  31.96 
 
 
291 aa  120  3e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  6.9064e-07  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  34.34 
 
 
308 aa  119  7e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0987  ribokinase  34.01 
 
 
293 aa  118  1e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.135221  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  31.05 
 
 
311 aa  117  2e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  33.22 
 
 
308 aa  116  4e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0692  carbohydrate kinase  33.66 
 
 
304 aa  115  8e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.19709  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  32.45 
 
 
306 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  33.23 
 
 
304 aa  114  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  26.58 
 
 
298 aa  113  4e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  32.99 
 
 
295 aa  112  8e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  34.02 
 
 
303 aa  112  1e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  34.34 
 
 
302 aa  110  2e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  34.11 
 
 
297 aa  111  2e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  29.97 
 
 
321 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  32.65 
 
 
302 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  33.33 
 
 
344 aa  106  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2014  PfkB domain protein  29.41 
 
 
324 aa  106  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1534  ribokinase-like domain-containing protein  29.73 
 
 
297 aa  106  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.260714 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  32.65 
 
 
302 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  32.69 
 
 
310 aa  106  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  29.33 
 
 
340 aa  105  7e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2878  PfkB  33.22 
 
 
290 aa  105  9e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.662908 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  36.92 
 
 
304 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  29.81 
 
 
313 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  33.33 
 
 
315 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  32.11 
 
 
305 aa  104  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3505  PfkB  27.61 
 
 
298 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  33.99 
 
 
309 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  31.76 
 
 
326 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  33.77 
 
 
308 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  31.97 
 
 
302 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03203  Sugar kinase, ribokinase family protein  27.04 
 
 
327 aa  103  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00908389  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  28.34 
 
 
306 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  32.13 
 
 
308 aa  103  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  28.34 
 
 
306 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  28.34 
 
 
306 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  33.77 
 
 
309 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  28.34 
 
 
306 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  28.34 
 
 
306 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  32.13 
 
 
308 aa  103  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0970  carbohydrate kinase  33.33 
 
 
314 aa  102  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  29.41 
 
 
345 aa  102  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  30.1 
 
 
306 aa  102  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  26.64 
 
 
304 aa  102  8e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  26.64 
 
 
304 aa  102  8e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  28.48 
 
 
309 aa  102  8e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  32.13 
 
 
308 aa  102  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  30.39 
 
 
297 aa  101  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  2.25274e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  30.69 
 
 
306 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  30.87 
 
 
303 aa  100  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  31.51 
 
 
305 aa  101  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  30.42 
 
 
308 aa  100  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  29.37 
 
 
320 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  32.44 
 
 
302 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  32.9 
 
 
312 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  29.13 
 
 
304 aa  100  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  33.7 
 
 
331 aa  99.8  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  31.49 
 
 
295 aa  99.8  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0660  ribokinase family sugar kinase  30.1 
 
 
303 aa  99.8  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0298925  normal  0.606106 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3749  ribokinase  26.54 
 
 
404 aa  99.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3816  ribokinase  26.54 
 
 
404 aa  99.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3738  ribokinase  26.54 
 
 
404 aa  99.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3859  ribokinase  26.54 
 
 
404 aa  99.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1818  ribokinase-like domain-containing protein  26.13 
 
 
308 aa  99.4  7e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.72818  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2812  PfkB  31.88 
 
 
321 aa  99.4  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  29.04 
 
 
320 aa  99.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  31.37 
 
 
309 aa  99  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  31.79 
 
 
305 aa  99  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  30.13 
 
 
302 aa  99  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  31.37 
 
 
309 aa  99  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  31.37 
 
 
309 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  31.37 
 
 
309 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2276  PfkB domain protein  33.87 
 
 
307 aa  98.6  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.303585  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  29.45 
 
 
327 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  33.81 
 
 
335 aa  98.6  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  31.37 
 
 
309 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  31.94 
 
 
322 aa  99  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6906  ribokinase  30.03 
 
 
328 aa  98.6  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135806  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3918  ribokinase  26.54 
 
 
404 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  29.82 
 
 
327 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  29.14 
 
 
307 aa  98.6  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  27.15 
 
 
403 aa  98.2  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  29.49 
 
 
310 aa  98.6  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  31.44 
 
 
330 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  29.57 
 
 
314 aa  97.8  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2270  PfkB domain protein  31.92 
 
 
387 aa  97.8  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0793911 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>