More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0061 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0061  30S ribosomal protein S2  100 
 
 		 208 aa  427  1e-119  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.924609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0058  30S ribosomal protein S2  92.75 
 
 		 206 aa  401  1e-111  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0190126 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0027  30S ribosomal protein S2  91.35 
 
 		 208 aa  400  1e-111  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1104  30S ribosomal protein S2  91.3 
 
 		 207 aa  398  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_2002  30S ribosomal protein S2  67.32 
 
 		 215 aa  302  3.0000000000000004e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0274  30S ribosomal protein S2  54.41 
 
 		 214 aa  248  3e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2140  30S ribosomal protein S2  55 
 
 		 225 aa  239  2e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000050996  hitchhiker  0.0000667505 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1047  ribosomal protein S2  56 
 
 		 226 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.269348  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0478  30S ribosomal protein S2  49.73 
 
 		 206 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1302  ribosomal protein S2  46.73 
 
 		 199 aa  189  2.9999999999999997e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.29354  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2544  ribosomal protein S2  47.85 
 
 		 269 aa  184  8e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2514  30S ribosomal protein S2  46.2 
 
 		 267 aa  182  2.0000000000000003e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0430  ribosomal protein S2  46.77 
 
 		 263 aa  182  3e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.748529  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2378  30S ribosomal protein S2  45.74 
 
 		 202 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00361654  normal  0.260163 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2393  30S ribosomal protein S2  43.69 
 
 		 214 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000018478  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1237  30S ribosomal protein S2  48.04 
 
 		 202 aa  181  6e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.161578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1810  30S ribosomal protein S2  45.27 
 
 		 205 aa  181  6e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1826  30S ribosomal protein S2  46.89 
 
 		 268 aa  181  7e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2599  30S ribosomal protein S2  45.86 
 
 		 259 aa  181  8.000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.11317 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1423  30S ribosomal protein S2  45.4 
 
 		 247 aa  177  9e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.017125 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0907  30S ribosomal protein S2  40.8 
 
 		 220 aa  176  2e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0316  30S ribosomal protein S2  42.02 
 
 		 207 aa  176  3e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0219  30S ribosomal protein S2  39.8 
 
 		 221 aa  174  7e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.664063  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1693  30S ribosomal protein S2  39.8 
 
 		 221 aa  174  8e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0759  30S ribosomal protein S2  40.1 
 
 		 220 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.817066  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2215  30S ribosomal protein S2  43.41 
 
 		 203 aa  172  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2892  30S ribosomal protein S2  43 
 
 		 202 aa  170  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00129354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1524  30S ribosomal protein S2  40.32 
 
 		 221 aa  169  4e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.524219  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13682  predicted protein  43.55 
 
 		 220 aa  163  1.0000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76999  ribosomal protein S0A  41.81 
 
 		 261 aa  155  4e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.937942  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03172  40S ribosomal protein S0 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B8F8]  41.81 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.51633 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04340  40S ribosomal protein S0, putative  38.73 
 
 		 292 aa  137  1e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.220661  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12355  Ribosomal protein Sa, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  38.51 
 
 		 290 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.30496  normal  0.113443 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0026  30S ribosomal protein S2  39.36 
 
 		 351 aa  69.3  0.00000000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1398  SSU ribosomal protein S2P  24.6 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000184086  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1203  30S ribosomal protein S2  23.87 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159372  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1510  30S ribosomal protein S2  24.09 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.0221668 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2860  30S ribosomal protein S2  24.09 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1433  30S ribosomal protein S2  24.09 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0086997 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  24.58 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2733  ribosomal protein S2  38.54 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36757e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1049  30S ribosomal protein S2  39.53 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0905437  normal  0.331293 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0957  ribosomal protein S2  27.23 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0164  30S ribosomal protein S2  23.66 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_321  ribosomal protein S2  24.89 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000206427  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  24.37 
 
 		 238 aa  62  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  24.58 
 
 		 235 aa  62  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0166  30S ribosomal protein S2  23.66 
 
 		 260 aa  62  0.000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000940316  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  23.77 
 
 		 262 aa  61.6  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0377  30S ribosomal protein S2  24.44 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000247942  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  25.56 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0606  ribosomal protein S2  27.46 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185332  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1966  ribosomal protein S2  44.12 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4743  ribosomal protein S2  39.29 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000226587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  24.22 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000315088  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  24.22 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000466794  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2019  30S ribosomal protein S2  25.82 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418742 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0359  30S ribosomal protein S2  24 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000354346  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1210  30S ribosomal protein S2  43.75 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0648  ribosomal protein S2  24.37 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.154128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1780  30S ribosomal protein S2  44.12 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000158872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0801  30S ribosomal protein S2  39.02 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000778728  hitchhiker  8.51058e-18 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1199  30S ribosomal protein S2  25.22 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0195465  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1816  30S ribosomal protein S2  34.12 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541904  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1832  30S ribosomal protein S2  35.79 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000152831  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0284  30S ribosomal protein S2  24.89 
 
 		 314 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0295  30S ribosomal protein S2  25 
 
 		 343 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0422466  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf061  30S ribosomal protein S2  24.39 
 
 		 307 aa  58.5  0.00000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.838903  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1548  30S ribosomal protein S2  25.11 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.403357 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1153  30S ribosomal protein S2  33.02 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1848  ribosomal protein S2  23.98 
 
 		 288 aa  58.5  0.00000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0363359  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1648  30S ribosomal protein S2  34.31 
 
 		 251 aa  58.5  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  35.37 
 
 		 262 aa  58.5  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2010  30S ribosomal protein S2  34 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.281351  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0975  SSU ribosomal protein S2P  23.11 
 
 		 260 aa  58.2  0.00000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0684  30S ribosomal protein S2  24.66 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000550841  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1238  30S ribosomal protein S2  23.66 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000341164  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0273  30S ribosomal protein S2  25.23 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2306  30S ribosomal protein S2  23.53 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9516  30S ribosomal protein S2  32.94 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2455  30S ribosomal protein S2  34.12 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0051  30S ribosomal protein S2  39.08 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0293672  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0007  ribosomal protein S2  24.5 
 
 		 276 aa  57  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3213  ribosomal protein S2  25.79 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321925  unclonable  0.000000000222969 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  23.53 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000006523  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3925  30S ribosomal protein S2  24.88 
 
 		 263 aa  57  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  25.11 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151826  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0926  30S ribosomal protein S2  22.17 
 
 		 257 aa  57  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148572  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  23.64 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000116198  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3726  30S ribosomal protein S2  40.62 
 
 		 261 aa  57  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1278  30S ribosomal protein S2  43.28 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.235139  normal  0.160579 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1404  30S ribosomal protein S2  43.28 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1534  ribosomal protein S2  34.21 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1343  30S ribosomal protein S2  34.21 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0442  30S ribosomal protein S2  25.22 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000051714  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1342  30S ribosomal protein S2  43.28 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298701  normal  0.417524 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  24.55 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0295  30S ribosomal protein S2  24.22 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0657172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0105  30S ribosomal protein S2  33 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000131996  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2108  30S ribosomal protein S2  22.73 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>