More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0052 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0052  50S ribosomal protein L2P  100 
 
 		 246 aa  493  9.999999999999999e-139  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.946037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1094  50S ribosomal protein L2P  87.76 
 
 		 246 aa  437  9.999999999999999e-123  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0018  50S ribosomal protein L2P  85.77 
 
 		 244 aa  429  1e-119  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0049  50S ribosomal protein L2P  83.74 
 
 		 245 aa  420  1e-116  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1278  50S ribosomal protein L2P  66.94 
 
 		 255 aa  307  8e-83  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000789854 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0227  50S ribosomal protein L2P  57.08 
 
 		 248 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1775  ribosomal protein L2  51.9 
 
 		 238 aa  225  5.0000000000000005e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0094  50S ribosomal protein L2P  49.37 
 
 		 238 aa  219  3e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000127555  unclonable  0.000000429528 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0107  50S ribosomal protein L2P  48.1 
 
 		 238 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0213  ribosomal protein L2  48.95 
 
 		 240 aa  207  2e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0030  50S ribosomal protein L2P  49.38 
 
 		 240 aa  206  3e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.291148  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1124  50S ribosomal protein L2P  49.79 
 
 		 240 aa  206  3e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0860  50S ribosomal protein L2P  48.96 
 
 		 240 aa  206  3e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.480475  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0794  50S ribosomal protein L2P  49.38 
 
 		 240 aa  205  6e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.097706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1518  ribosomal protein L2  49.13 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  6.90355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0004  50S ribosomal protein L2P  45.8 
 
 		 237 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000454303  n/a   
 
 
 
NC_009635  Maeo_0804  50S ribosomal protein L2P  44.4 
 
 		 240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.712432  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2295  50S ribosomal protein L2P  47.11 
 
 		 242 aa  188  7e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0535  50S ribosomal protein L2P  42.62 
 
 		 238 aa  187  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.393685  normal  0.694231 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1725  50S ribosomal protein L2P  42.62 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0310662  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2221  ribosomal protein L2  46.22 
 
 		 240 aa  186  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03960  conserved hypothetical protein  45.12 
 
 		 255 aa  186  4e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.139278  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0567  50S ribosomal protein L2P  43.04 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0425344  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2446  50S ribosomal protein L2P  45.74 
 
 		 240 aa  182  6e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0102  50S ribosomal protein L2P  42.45 
 
 		 244 aa  181  1e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00140338 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28234  predicted protein  42.68 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.638688  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2250  50S ribosomal protein L2P  40.51 
 
 		 236 aa  176  4e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000353713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1831  50S ribosomal protein L2P  43.56 
 
 		 240 aa  175  6e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.548496 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02275  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L2 (Broad)  42.51 
 
 		 254 aa  172  5.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0084  50S ribosomal protein L2P  41.42 
 
 		 240 aa  170  2e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.33391 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28309  60S large subunit ribosomal protein L2A  43.32 
 
 		 254 aa  165  5e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86991  60S large subunit ribosomal protein L2B  43.32 
 
 		 254 aa  165  5e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.32837 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0445  50S ribosomal protein L2P  41.18 
 
 		 239 aa  161  7e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0154826  normal  0.478034 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31116  Ribosomal protein L8, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  39.02 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.155376  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0598  50S ribosomal protein L2  40.22 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000263643  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0454  50S ribosomal protein L2  37.16 
 
 		 274 aa  105  5e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000232989  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_420  ribosomal protein L2  37.16 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00663414  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0477  50S ribosomal protein L2  36.24 
 
 		 274 aa  102  5e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0481332  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2315  50S ribosomal protein L2  38.55 
 
 		 277 aa  102  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000290927  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2274  50S ribosomal protein L2  38.55 
 
 		 277 aa  102  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000299614  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1828  50S ribosomal protein L2  38.55 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.256739  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2399  50S ribosomal protein L2  37.99 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00287166  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0199  50S ribosomal protein L2  39.23 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0675116  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1571  ribosomal protein L2  37.27 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000641133  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1480  50S ribosomal protein L2  37.17 
 
 		 281 aa  98.6  8e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000349234  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0037  50S ribosomal protein L2  38.33 
 
 		 276 aa  98.6  8e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00257974  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3819  50S ribosomal protein L2  38.1 
 
 		 273 aa  97.8  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf440  50S ribosomal protein L2  36.36 
 
 		 281 aa  97.4  2e-19  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3633  50S ribosomal protein L2  38.69 
 
 		 273 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000993877  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3633  50S ribosomal protein L2  38.69 
 
 		 273 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0350833  normal  0.361481 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3804  50S ribosomal protein L2  38.69 
 
 		 273 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00899018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3741  50S ribosomal protein L2  38.69 
 
 		 273 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69026  normal  0.0152471 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3706  50S ribosomal protein L2  38.69 
 
 		 273 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00279259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3748  50S ribosomal protein L2  37.72 
 
 		 273 aa  97.4  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000108731  hitchhiker  0.00494792 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3912  50S ribosomal protein L2  38.1 
 
 		 274 aa  96.7  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.5044e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0587  50S ribosomal protein L2  38.1 
 
 		 274 aa  96.7  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  normal  0.227169 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2711  50S ribosomal protein L2  36.87 
 
 		 277 aa  96.7  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2396  50S ribosomal protein L2  36.87 
 
 		 277 aa  96.7  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.445207  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3998  50S ribosomal protein L2  38.1 
 
 		 273 aa  96.7  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000302361  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0286  50S ribosomal protein L2  38.1 
 
 		 274 aa  96.7  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000315964  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0761  50S ribosomal protein L2  34.55 
 
 		 277 aa  96.7  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000295488  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  36.82 
 
 		 276 aa  96.3  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0412  50S ribosomal protein L2  36.5 
 
 		 276 aa  96.3  4e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  35 
 
 		 275 aa  96.3  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5067  50S ribosomal protein L2  35.82 
 
 		 277 aa  96.3  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.828543  normal  0.381768 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03168  50S ribosomal protein L2  38.1 
 
 		 273 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0396  ribosomal protein L2  38.1 
 
 		 273 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000401214  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl126  50S ribosomal protein L2  36.61 
 
 		 281 aa  95.5  7e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0445797  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3800  50S ribosomal protein L2  38.1 
 
 		 273 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000757775  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0408  50S ribosomal protein L2  37.87 
 
 		 273 aa  95.5  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3612  50S ribosomal protein L2  38.1 
 
 		 273 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000120655  hitchhiker  0.00428222 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3511  50S ribosomal protein L2  38.1 
 
 		 273 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112597  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3702  50S ribosomal protein L2  38.1 
 
 		 273 aa  95.5  7e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237187  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0396  50S ribosomal protein L2  38.1 
 
 		 273 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000072222  hitchhiker  0.000353424 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4640  50S ribosomal protein L2  38.1 
 
 		 273 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0685659  normal  0.0584567 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03119  hypothetical protein  38.1 
 
 		 273 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00128631  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  35.91 
 
 		 275 aa  94.7  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0694  50S ribosomal protein L2  35.91 
 
 		 287 aa  94.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00211234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0326  50S ribosomal protein L2  37.28 
 
 		 273 aa  94.4  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000291678  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  36.23 
 
 		 276 aa  94.7  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000110614  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0294  50S ribosomal protein L2  34.7 
 
 		 278 aa  94.7  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  3.4720999999999997e-28 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5784  ribosomal protein L2  34.9 
 
 		 274 aa  94  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.091769 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0609  50S ribosomal protein L2  35.64 
 
 		 276 aa  94  2e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2298  50S ribosomal protein L2  38.27 
 
 		 278 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.749096  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3181  50S ribosomal protein L2  35.78 
 
 		 278 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1965  ribosomal protein L2  36.9 
 
 		 276 aa  94  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000977898  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2078  50S ribosomal protein L2  36.08 
 
 		 276 aa  94  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000477294  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  35.61 
 
 		 275 aa  93.2  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000015035  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  34.16 
 
 		 273 aa  93.2  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1904  50S ribosomal protein L2  37.57 
 
 		 277 aa  93.6  3e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001739  LSU ribosomal protein L2p (L8e)  37.04 
 
 		 274 aa  92.8  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000188228  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1872  50S ribosomal protein L2  36.67 
 
 		 276 aa  92.8  4e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.701919  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1701  50S ribosomal protein L2  36.67 
 
 		 276 aa  92.8  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000371548  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0113  50S ribosomal protein L2  38.25 
 
 		 276 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000200839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0113  50S ribosomal protein L2  38.25 
 
 		 276 aa  92.4  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000138046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0109  50S ribosomal protein L2  38.25 
 
 		 276 aa  92.4  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.27306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0107  50S ribosomal protein L2  38.25 
 
 		 276 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000901221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0113  50S ribosomal protein L2  38.25 
 
 		 276 aa  92.4  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0144  50S ribosomal protein L2  38.25 
 
 		 276 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0125  50S ribosomal protein L2  38.25 
 
 		 276 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>