More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0048 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0014  serine hydroxymethyltransferase  77.34 
 
 		 430 aa  680    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0045  serine hydroxymethyltransferase  81.86 
 
 		 430 aa  734    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0231458 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1090  serine hydroxymethyltransferase  80.47 
 
 		 430 aa  711    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0048  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 429 aa  869    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0346  serine hydroxymethyltransferase  60.49 
 
 		 431 aa  511  1e-144  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1611  Glycine hydroxymethyltransferase  51.52 
 
 		 433 aa  450  1e-125  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1650  serine hydroxymethyltransferase  51.21 
 
 		 431 aa  429  1e-119  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.278355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0061  Glycine hydroxymethyltransferase  46 
 
 		 433 aa  355  6.999999999999999e-97  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1046  serine hydroxymethyltransferase  43.47 
 
 		 429 aa  335  1e-90  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1793  serine hydroxymethyltransferase  41.99 
 
 		 440 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3351  Glycine hydroxymethyltransferase  40.98 
 
 		 445 aa  276  6e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0411175  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0929  Glycine hydroxymethyltransferase  35.82 
 
 		 440 aa  244  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.802509  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3925  Glycine hydroxymethyltransferase  37.56 
 
 		 417 aa  234  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.991608  decreased coverage  0.00651172 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0271  Glycine hydroxymethyltransferase  38.22 
 
 		 358 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2079  serine hydroxymethyltransferase  34.35 
 
 		 445 aa  229  8e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.172467  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  36.59 
 
 		 422 aa  224  3e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  35.44 
 
 		 411 aa  223  4e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1649  serine hydroxymethyltransferase  38.21 
 
 		 434 aa  223  6e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  36.99 
 
 		 413 aa  220  3e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  36.27 
 
 		 413 aa  219  5e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  34.2 
 
 		 417 aa  218  1e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  35.25 
 
 		 413 aa  218  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  36.71 
 
 		 422 aa  218  2e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  37 
 
 		 439 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  36.69 
 
 		 412 aa  217  4e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  35.39 
 
 		 413 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  35.39 
 
 		 414 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  35.39 
 
 		 413 aa  216  7e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1942  serine hydroxymethyltransferase  36.5 
 
 		 415 aa  216  8e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3196  serine hydroxymethyltransferase  36.5 
 
 		 415 aa  216  8e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2075  serine hydroxymethyltransferase  36.5 
 
 		 415 aa  216  8e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3250  serine hydroxymethyltransferase  36.5 
 
 		 415 aa  216  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2668  serine hydroxymethyltransferase  36.5 
 
 		 415 aa  216  8e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0834  serine hydroxymethyltransferase  36.5 
 
 		 415 aa  216  8e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  37.27 
 
 		 438 aa  216  8e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  35.12 
 
 		 414 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  35.39 
 
 		 413 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3234  serine hydroxymethyltransferase  36.5 
 
 		 415 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2581  serine hydroxymethyltransferase  37.16 
 
 		 415 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1379  serine hydroxymethyltransferase  36.25 
 
 		 415 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  35.12 
 
 		 413 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  35.39 
 
 		 413 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  37.43 
 
 		 437 aa  215  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  35.12 
 
 		 414 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  35.12 
 
 		 413 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  35.93 
 
 		 417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1917  serine hydroxymethyltransferase  38.27 
 
 		 430 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.584505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  38.12 
 
 		 417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3638  serine hydroxymethyltransferase  38.38 
 
 		 417 aa  214  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  36.73 
 
 		 438 aa  214  2.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2938  serine hydroxymethyltransferase  37.37 
 
 		 421 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0323  serine hydroxymethyltransferase  36.5 
 
 		 415 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  36.61 
 
 		 412 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0806  serine hydroxymethyltransferase  36.5 
 
 		 415 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0775  serine hydroxymethyltransferase  36.75 
 
 		 415 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0739852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1231  serine hydroxymethyltransferase  38.38 
 
 		 417 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  37.34 
 
 		 417 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  37.34 
 
 		 417 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  37.04 
 
 		 417 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1093  serine hydroxymethyltransferase  38.38 
 
 		 417 aa  212  9e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  37.6 
 
 		 417 aa  212  9e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  37.08 
 
 		 417 aa  212  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  37.6 
 
 		 417 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0692  serine hydroxymethyltransferase  35.16 
 
 		 421 aa  211  1e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.414357  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  37.6 
 
 		 417 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3914  serine hydroxymethyltransferase  35.89 
 
 		 415 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355744  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0700  serine hydroxymethyltransferase  36.91 
 
 		 431 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0504784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3044  serine hydroxymethyltransferase  38.12 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.196975  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2449  serine hydroxymethyltransferase  36.68 
 
 		 415 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0683  serine hydroxymethyltransferase  36.59 
 
 		 431 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3769  Glycine hydroxymethyltransferase  35.96 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.452166  normal  0.168004 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  36.55 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3717  serine hydroxymethyltransferase  35.7 
 
 		 418 aa  211  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.982412  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_002978  WD1035  serine hydroxymethyltransferase  35.83 
 
 		 425 aa  210  4e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0729  serine hydroxymethyltransferase  36.09 
 
 		 415 aa  210  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  36.75 
 
 		 417 aa  210  4e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  37.34 
 
 		 417 aa  210  5e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2096  glycine hydroxymethyltransferase  36.25 
 
 		 425 aa  209  5e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.835184  normal  0.0355089 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0765  serine hydroxymethyltransferase  36.63 
 
 		 415 aa  209  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186767  normal  0.156833 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3895  serine hydroxymethyltransferase  36.16 
 
 		 415 aa  209  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3363  serine hydroxymethyltransferase  37.47 
 
 		 415 aa  209  8e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2762  serine hydroxymethyltransferase  38.22 
 
 		 417 aa  209  8e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  38.17 
 
 		 417 aa  208  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5200  serine hydroxymethyltransferase  37.14 
 
 		 415 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1266  serine hydroxymethyltransferase  36.46 
 
 		 432 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0458809  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  35.56 
 
 		 413 aa  207  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1626  Glycine hydroxymethyltransferase  37.6 
 
 		 425 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.696145  normal  0.61537 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2671  serine hydroxymethyltransferase  37.37 
 
 		 433 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2680  serine hydroxymethyltransferase  36.27 
 
 		 508 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  35.58 
 
 		 412 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  34.86 
 
 		 415 aa  208  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2110  serine hydroxymethyltransferase  36.93 
 
 		 434 aa  207  2e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  35.66 
 
 		 427 aa  207  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0959  Glycine hydroxymethyltransferase  34.18 
 
 		 410 aa  207  3e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.587194  normal  0.162631 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2659  serine hydroxymethyltransferase  37.63 
 
 		 440 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.719136  normal  0.877467 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  32.53 
 
 		 423 aa  207  4e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6691  Glycine hydroxymethyltransferase  35.31 
 
 		 418 aa  206  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.476522  normal  0.212987 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2754  serine hydroxymethyltransferase  36.16 
 
 		 415 aa  206  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  36.41 
 
 		 417 aa  206  5e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1142  serine hydroxymethyltransferase  36.81 
 
 		 417 aa  206  6e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.510367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>