27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0035 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0035  transcription factor TFIIE, alpha subunit  100 
 
 		 170 aa  342  1e-93  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1074  transcription factor TFIIE, alpha subunit  80 
 
 		 170 aa  299  1e-80  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0032  transcription factor TFIIE, alpha subunit  78.82 
 
 		 170 aa  295  2e-79  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00767088 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2147  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  74.71 
 
 		 170 aa  275  2e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1388  transcription factor TFIIE, alpha subunit  34.36 
 
 		 183 aa  96.7  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.299499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0710  transcription factor TFIIE, alpha subunit  31.29 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2279  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  29.69 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.933385 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1244  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  28.46 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1650  transcription factor TFIIE, alpha subunit  31.06 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0285  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  27.59 
 
 		 174 aa  53.1  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.137025  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2330  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  27.69 
 
 		 179 aa  52.4  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.373955 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0913  transcription initiation factor E subunit alpha  25.19 
 
 		 185 aa  52  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1524  transcription factor TFIIE, alpha subunit  24.56 
 
 		 173 aa  51.6  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1033  transcription initiation factor E subunit alpha  24.17 
 
 		 185 aa  51.2  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1644  transcription initiation factor E subunit alpha  25.19 
 
 		 185 aa  51.2  0.000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.275573  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1033  transcription initiation factor E subunit alpha  25.19 
 
 		 185 aa  50.8  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0325255 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1150  transcription initiation factor E subunit alpha  27.54 
 
 		 183 aa  49.7  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0965  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  26.96 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0372  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  25 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000142035  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1279  transcription factor TFIIE, alpha subunit  26.45 
 
 		 173 aa  47  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.11333 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3157  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  27 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.484396  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0458  hypothetical protein  25.58 
 
 		 211 aa  46.2  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0196  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  25.2 
 
 		 164 aa  45.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2797  transcription factor TFIIE, alpha subunit  23.08 
 
 		 173 aa  44.7  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0975699 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1607  transcription factor TFIIE subunit alpha  24.84 
 
 		 171 aa  42.4  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2009  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  24.56 
 
 		 173 aa  41.6  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.735877  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1708  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  40 
 
 		 174 aa  41.2  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>