More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0021 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0021  GTP-binding protein, HSR1-related  100 
 
 		 261 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1049  small GTP-binding protein  80.08 
 
 		 256 aa  415  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0648076 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2161  GTP-binding protein, HSR1-related  74.71 
 
 		 268 aa  402  1e-111  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0017  GTP-binding protein HSR1-related  76.65 
 
 		 259 aa  402  1e-111  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.437741 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0824  GTP-binding protein, HSR1-related  49.2 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1931  GTP-binding protein YlqF  38.76 
 
 		 265 aa  162  5.0000000000000005e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1339  GTP-binding protein HSR1-related  38.91 
 
 		 374 aa  158  7e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1645  GTP-binding protein HSR1-related protein  39.69 
 
 		 267 aa  156  2e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0965414  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0259  GTP-binding protein YlqF  38.13 
 
 		 384 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0579  GTP-binding protein HSR1-related  37.35 
 
 		 388 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.133242 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0059  GTP-binding protein HSR1-related  36.92 
 
 		 260 aa  152  4e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.800533  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0645  GTP-binding protein HSR1-related  35 
 
 		 374 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.112449  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0396  GTP-binding protein YlqF  36.9 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.243282  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3055  GTP-binding protein  37.7 
 
 		 258 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.464248 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01666  nucleolar GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08930)  36.82 
 
 		 560 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1194  GTP-binding protein HSR1-related  31.78 
 
 		 379 aa  130  3e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1095  ribosomal biogenesis GTPase  34.6 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00065113  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42327  predicted protein  33.58 
 
 		 443 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.812568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30716  nuclear/nucleolar GTP-binding protein 2  34.07 
 
 		 534 aa  126  4.0000000000000003e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0409155  normal  0.593065 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34264  predicted protein  31.9 
 
 		 597 aa  124  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_2182  predicted protein  32.98 
 
 		 360 aa  123  4e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05640  conserved hypothetical protein  32.96 
 
 		 717 aa  122  7e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1988  ribosomal biogenesis GTPase  33.84 
 
 		 288 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06087  ribosomal biogenesis GTPase  32.96 
 
 		 314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2401  GTP-binding protein HSR1-related  30.86 
 
 		 292 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00457359  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01215  Myosin-related protein homolog MlpA Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVC7]  32.55 
 
 		 544 aa  116  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00107626  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28889  predicted protein  32.43 
 
 		 521 aa  116  3.9999999999999997e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.691875  normal  0.346364 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0663  ribosomal biogenesis GTPase  29.3 
 
 		 279 aa  115  5e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.5554  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01210  conserved hypothetical protein  32.36 
 
 		 669 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1367  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  33.58 
 
 		 292 aa  113  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0763  GTP-binding protein YlqF  30.62 
 
 		 291 aa  113  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000221052  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0811  ribosomal biogenesis GTPase  33.21 
 
 		 287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00749287  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000287  50S ribosomal subunit maturation GTPase RbgA  32.95 
 
 		 314 aa  112  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.146408  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0663  GTP-binding protein, HSR1-related  33.83 
 
 		 284 aa  112  6e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.011457  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3689  ribosomal biogenesis GTPase  31.06 
 
 		 296 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0162209  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3976  ribosomal biogenesis GTPase  31.06 
 
 		 296 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127206  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0669  ribosomal biogenesis GTPase  31.6 
 
 		 311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.378944  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3880  ribosomal biogenesis GTPase  30.68 
 
 		 296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000579568  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3579  ribosomal biogenesis GTPase  31.06 
 
 		 296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000271121  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3597  ribosomal biogenesis GTPase  31.06 
 
 		 296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124948  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3885  ribosomal biogenesis GTPase  31.06 
 
 		 296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000521697  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0973  GTP-binding protein YlqF  35.18 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000216329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1307  ribosomal biogenesis GTPase  31.06 
 
 		 296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615833  unclonable  1.55704e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3851  ribosomal biogenesis GTPase  31.06 
 
 		 296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3936  ribosomal biogenesis GTPase  31.06 
 
 		 296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000467955  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2490  ribosomal biogenesis GTPase  30.68 
 
 		 287 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000101626  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0461  ribosomal biogenesis GTPase  32.82 
 
 		 314 aa  109  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.178573  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1204  GTP-binding  33.33 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3661  ribosomal biogenesis GTPase  29.92 
 
 		 296 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000313796  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1707  GTP-binding protein, HSR1-related  32.68 
 
 		 277 aa  105  7e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.12169  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1054  ribosomal biogenesis GTPase  30.48 
 
 		 315 aa  105  9e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2048  GTP-binding protein, HSR1-related  32.36 
 
 		 284 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000391161  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02636  ribosomal biogenesis GTPase  29.12 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1993  ribosomal biogenesis GTPase  34.9 
 
 		 314 aa  102  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0543739  normal  0.136959 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1490  GTP-binding protein  34.08 
 
 		 278 aa  102  9e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000659617  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2395  ribosomal biogenesis GTPase  32.2 
 
 		 313 aa  101  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.806942 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1752  ribosomal biogenesis GTPase  30.8 
 
 		 313 aa  101  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0169  ribosomal biogenesis GTPase  31.27 
 
 		 323 aa  100  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000316145  normal  0.720532 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0186  GTP-binding protein HSR1-related protein  29.57 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2029  ribosomal biogenesis GTPase  29.26 
 
 		 312 aa  100  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.831437  normal  0.492608 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2306  ribosomal biogenesis GTPase  31.44 
 
 		 313 aa  100  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.575224  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2508  ribosomal biogenesis GTPase  29.48 
 
 		 312 aa  100  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2590  ribosomal biogenesis GTPase  32.2 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1589  ribosomal biogenesis GTPase  29.48 
 
 		 313 aa  99.8  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0773  GTPases  33.07 
 
 		 280 aa  99.8  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.79834e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2186  ribosomal biogenesis GTPase  31.82 
 
 		 313 aa  99.8  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2263  ribosomal biogenesis GTPase  31.82 
 
 		 313 aa  99.8  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1682  GTP-binding protein HSR1-related  31.1 
 
 		 324 aa  99.8  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2638  ribosomal biogenesis GTPase  28.89 
 
 		 312 aa  99.4  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00454653  normal  0.052608 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2437  ribosomal biogenesis GTPase  30.42 
 
 		 313 aa  99.4  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.743849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1855  ribosomal biogenesis GTPase  30.42 
 
 		 313 aa  98.6  8e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2487  GTP-binding protein HSR1-related  34.15 
 
 		 328 aa  98.6  8e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000110563 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1889  ribosomal biogenesis GTPase  30.42 
 
 		 313 aa  98.6  8e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1882  ribosomal biogenesis GTPase  30.42 
 
 		 313 aa  98.6  8e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.140157  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1409  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  34.87 
 
 		 271 aa  98.6  8e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.421311  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1327  ribosomal biogenesis GTPase  29.17 
 
 		 294 aa  98.2  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.575844  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1302  ribosomal biogenesis GTPase  29.17 
 
 		 294 aa  98.2  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00764479  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3634  ribosomal biogenesis GTPase  28.14 
 
 		 334 aa  98.2  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.909228  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07360  GTP-binding protein HSR1-related  29.07 
 
 		 282 aa  96.3  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000017476  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0716  GTP1/OBG protein  27.65 
 
 		 292 aa  95.9  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00781144  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0913  GTPase  37.82 
 
 		 279 aa  96.3  5e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773459 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25133  predicted protein  30.11 
 
 		 562 aa  95.5  7e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1301  GTP-binding protein HSR1-related  31.5 
 
 		 299 aa  94.7  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000833299 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0843  GTP-binding protein HSR1-related  28.79 
 
 		 271 aa  94.7  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0827  GTP-binding protein HSR1-related  30.68 
 
 		 266 aa  95.1  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1554  GTP-binding protein  30.5 
 
 		 281 aa  94.7  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1982  ribosomal biogenesis GTPase  30.59 
 
 		 318 aa  94.4  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.360178 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1293  GTP-binding protein HSR1-related  28.29 
 
 		 280 aa  94.4  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000027879  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2283  ribosomal biogenesis GTPase  30.59 
 
 		 318 aa  94  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0251974 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2120  GTPase  30.04 
 
 		 304 aa  93.6  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2146  GTP-binding protein, HSR1-related  30.83 
 
 		 305 aa  94  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0483  GTP-binding protein, HSR1-related  29.57 
 
 		 258 aa  93.2  4e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1203  GTP-binding protein HSR1-related  31.68 
 
 		 283 aa  92.4  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000139155  normal  0.179888 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2758  GTP-binding protein, HSR1-related  32.03 
 
 		 329 aa  92.4  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0145905 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2924  HSR1-related GTP-binding protein  31.1 
 
 		 299 aa  92.4  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1416  ribosomal biogenesis GTPase  34.12 
 
 		 283 aa  92  8e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00443588  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0919  ribosomal biogenesis GTPase  30.26 
 
 		 284 aa  91.3  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.294572  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0158  GTP-binding protein HSR1-related  29.48 
 
 		 262 aa  90.9  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.844156  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1486  ribosomal biogenesis GTPase  30.3 
 
 		 313 aa  90.9  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0160  GTP-binding protein, HSR1-related  29.48 
 
 		 262 aa  90.9  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.210718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>