32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0006 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0006  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 98 aa  191  2e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0660  ArsR family transcriptional regulator  64.37 
 
 		 96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.410209  normal  0.0250069 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0002  regulatory protein ArsR  62.5 
 
 		 92 aa  89.4  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0003  regulatory protein, ArsR  51.65 
 
 		 95 aa  87.8  4e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1885  ArsR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 92 aa  68.2  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.528745 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0836  regulatory protein, ArsR  38.1 
 
 		 90 aa  67.4  0.00000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.237842 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0924  regulatory protein ArsR  39.24 
 
 		 93 aa  67  0.00000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1426  ArsR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.134473 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1557  transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 		 105 aa  50.4  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0128912  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14670  transcriptional regulator, ArsR family  34.83 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475992  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1439  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1338  putative transcriptional regulator  39.66 
 
 		 230 aa  45.4  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  36 
 
 		 349 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 354 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0808  transcriptional regulator, ArsR family  34.18 
 
 		 324 aa  44.7  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.203378 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18080  predicted transcriptional regulator  31.37 
 
 		 211 aa  44.7  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.493664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  34.21 
 
 		 342 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0567  transcriptional regulator, ArsR family  29.35 
 
 		 126 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.702064 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1844  putative transcriptional regulator  41.18 
 
 		 271 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000755788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8897  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1322  transcriptional regulator, ArsR family  40.98 
 
 		 210 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.0955096 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2529  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1813  ArsR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 198 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0789444  hitchhiker  0.0000651262 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1822  regulatory protein, ArsR  44.26 
 
 		 198 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00289732  normal  0.850355 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2257  transcriptional regulator, ArsR family  34.12 
 
 		 183 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1988  transcriptional regulator, ArsR family  31.33 
 
 		 235 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.433498  hitchhiker  0.000545084 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2402  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 323 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4321  ArsR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 200 aa  40.4  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120832  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8471  transcriptional regulator, ArsR family  42.37 
 
 		 130 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2358  transcriptional regulator, ArsR family  43.14 
 
 		 216 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.13645 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 		 222 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2681  transcriptional regulator, ArsR family  43.14 
 
 		 214 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>