31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_R0011 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_R0011  tRNA-Tyr  100 
 
 		 83 bp  165  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000214053  hitchhiker  0.00323075 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0024  tRNA-Tyr  97.59 
 
 		 83 bp  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0016  tRNA-Tyr  95.18 
 
 		 83 bp  133  6.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000723443  decreased coverage  0.0000959662 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t09  tRNA-Tyr  95.18 
 
 		 85 bp  125  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000014277  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0004  tRNA-Tyr  98.51 
 
 		 83 bp  125  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216119  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0055  tRNA-Tyr  95.18 
 
 		 82 bp  125  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000670702  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0015  tRNA-Tyr  91.57 
 
 		 83 bp  109  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839238  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0005  tRNA-Tyr  89.58 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.309794  hitchhiker  0.000058152 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0048  tRNA-Tyr  96.55 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.116331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tTyr01  tRNA-Tyr  88.89 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.735952 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0067  tRNA-Tyr  89.58 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00323795 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0016  tRNA-Tyr  89.58 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000373252  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0024  tRNA-Tyr  89.58 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.074992  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0019  tRNA-Tyr  88.64 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00432304  decreased coverage  0.00738157 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0019  tRNA-Tyr  87.5 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172522  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0057  tRNA-Tyr  87.5 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.343924  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0011  tRNA-Tyr  89.58 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0587696  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0008  tRNA-Tyr  89.58 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0166209  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0023  tRNA-Tyr  88.64 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0238179  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  87.5 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1846  tRNA-Tyr  91.43 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0028  tRNA-Tyr  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000249872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0051  tRNA-Tyr  96.15 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0024  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.640159  normal  0.173611 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0037  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.499961 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0009  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.193083  normal  0.394655 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0014  tRNA-Tyr  96.15 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.673141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0009  tRNA-Met  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.426915 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0022  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.537051  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0013  tRNA-Tyr  96.15 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000444451  normal  0.406861 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>