More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_R0004 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_R0004  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0004  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000939428  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0052  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0029428  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0047  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.026073  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0009  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0767985  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0009  tRNA-Ile  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.425741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0004  tRNA-Ile  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.147077  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0002  tRNA-Ile  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000539151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0004  tRNA-Ile  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000076362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t03  tRNA-Ile  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0024  tRNA-Ile  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0009  tRNA-Ile  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00618734  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0004  tRNA-Ile  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301418 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0039  tRNA-Ile  94.67 
 
 		 77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000868167  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0019  tRNA-Ile  94.67 
 
 		 77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0033  tRNA-Ile  94.67 
 
 		 77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000392062  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0002  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 78 bp  111  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0015  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 78 bp  111  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.173828  normal  0.314939 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0001  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000567837 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00070  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000758823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28350  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.145936 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0008  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.135162  normal  0.696922 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0082  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0466145  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0018  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0042  tRNA-Ile  93.33 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3111t  tRNA-Ile  94.29 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.893532  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0009  tRNA-Ile  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11936  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3075t  tRNA-Ile  94.29 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000646764  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0002  tRNA-Ile  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0699442  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0042  tRNA-Ile  93.42 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0031  tRNA-Ile  93.42 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0830552 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0009  tRNA-Ile  95.31 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.389462  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0008  tRNA-Ile  92.96 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000696824  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  92 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428746  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  92 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0042  tRNA-Ile  92.96 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0171814  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0011  tRNA-Ile  92.96 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00277001  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0037  tRNA-Ile  92.96 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000489104  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0044  tRNA-Ile  92.96 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0477159  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0052  tRNA-Ile  92.96 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000626175  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0066  tRNA-Ile  92 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0066  tRNA-Ile  92 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0018  tRNA-Ile  92 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.891633  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0099  tRNA-Ile  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0002  tRNA-Ile  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0008  tRNA-Ile  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0007  tRNA-Ile  92.86 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00629205  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0089  tRNA-Ile  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0038  tRNA-Ile  92.11 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0013  tRNA-Ile  92.11 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0012  tRNA-Ile  92.11 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0037  tRNA-Ile  92.11 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0013  tRNA-Ile  92.11 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.420579  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0038  tRNA-Ile  92.11 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00061  tRNA-Ile  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0509967  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00071  tRNA-Ile  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0100739  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0077  tRNA-Ile  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000248576  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0102  tRNA-Ile  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00845186  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0006  tRNA-Ile  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0108839  normal  0.0634944 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4219  tRNA-Ile  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00450756  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4600  tRNA-Ile  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000666504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0046  tRNA-Ile  91.55 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000007266  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4458  tRNA-Ile  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000985365  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0196  tRNA-Ile  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000185404  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0104  tRNA-Ile  91.55 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000615074  normal  0.021037 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4123  tRNA-Ile  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000989752  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0289  tRNA-Ile  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0256101  normal  0.468385 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0273  tRNA-Ile  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0036281  normal  0.436112 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4462  tRNA-Ile  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0397855  hitchhiker  0.000732879 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4196  tRNA-Ile  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0226265  normal  0.767758 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4344  tRNA-Ile  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0232585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5092  tRNA-Ile  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866499  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4714  tRNA-Ile  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504108  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4704  tRNA-Ile  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000142472  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0103  tRNA-Ile  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00507683  decreased coverage  0.00339417 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0020  tRNA-Ile  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00394718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0119  tRNA-Ile  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000630461  hitchhiker  0.0000581532 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4293  tRNA-Ile  91.55 
 
 		 79 bp  93.7  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000401395  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4315  tRNA-Ile  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0699439  normal  0.201928 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4268  tRNA-Ile  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00604993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4539  tRNA-Ile  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00250858  hitchhiker  0.00000000000409662 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4375  tRNA-Ile  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.120949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0213  tRNA-Ile  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000151155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0278  tRNA-Ile  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00714159  normal  0.415657 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4641  tRNA-Ile  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000032657  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5291  tRNA-Ile  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000449228  normal  0.256663 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0214  tRNA-Ile  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00923178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tIle01  tRNA-Ile  91.55 
 
 		 80 bp  93.7  6e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tIle02  tRNA-Ile  91.55 
 
 		 80 bp  93.7  6e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5077  tRNA-Ile  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000584569  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0468  tRNA-Ile  91.55 
 
 		 79 bp  93.7  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000056688  normal  0.0165845 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0127  tRNA-Ile  91.55 
 
 		 79 bp  93.7  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000449492  normal  0.0406776 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0085  tRNA-Ile  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0425046  normal  0.137972 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0003  tRNA-Ile  91.55 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000253245  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0090  tRNA-Ile  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000296834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0059  tRNA-Ile  91.55 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000373197  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0626  tRNA-Ile  91.55 
 
 		 79 bp  93.7  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339545  normal  0.0175706 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0016  tRNA-Ile  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00171399  hitchhiker  0.0041284 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3573  tRNA-Ile  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000468269  normal  0.424687 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4375  tRNA-Ile  92.54 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000507491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>