More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2400 on replicon NC_011061
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
649 aa  1298    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1453  TPR repeat-containing protein  53.66 
 
 
639 aa  339  9.999999999999999e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.78 
 
 
1186 aa  224  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1130  TPR domain-containing protein  45.61 
 
 
665 aa  218  2e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  31.85 
 
 
2145 aa  212  1e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4523  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 
1119 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  42.55 
 
 
825 aa  190  8e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  41.12 
 
 
843 aa  185  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  28.7 
 
 
1550 aa  184  4.0000000000000006e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  31.34 
 
 
732 aa  178  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.33 
 
 
767 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  33.21 
 
 
1328 aa  174  3.9999999999999995e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  33.27 
 
 
1215 aa  169  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1912  TPR repeat-containing protein  35.14 
 
 
578 aa  169  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  36.73 
 
 
454 aa  167  5e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  28.29 
 
 
1238 aa  163  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  35.62 
 
 
1507 aa  156  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  28.61 
 
 
1404 aa  155  2.9999999999999998e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.75 
 
 
1424 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  38.44 
 
 
568 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.44 
 
 
568 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1249  TPR repeat-containing protein  39.56 
 
 
702 aa  154  5.9999999999999996e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0879927  normal  0.272595 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  29.63 
 
 
694 aa  152  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  35.34 
 
 
1044 aa  150  6e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2028  TPR repeat-containing protein  29.72 
 
 
1285 aa  147  6e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.628704  normal  0.0470638 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  34.63 
 
 
493 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.31 
 
 
787 aa  137  5e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.53 
 
 
885 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  33.33 
 
 
725 aa  137  6.0000000000000005e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.25 
 
 
991 aa  137  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  31.54 
 
 
799 aa  137  7.000000000000001e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  27.04 
 
 
782 aa  134  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  37.09 
 
 
911 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  28.54 
 
 
708 aa  132  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  32.7 
 
 
1228 aa  132  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  36.86 
 
 
919 aa  129  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 
1526 aa  126  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  40.42 
 
 
672 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  26.78 
 
 
1266 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 
1060 aa  125  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 
1313 aa  123  9e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  30.05 
 
 
740 aa  123  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  27.16 
 
 
1611 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  36.88 
 
 
977 aa  121  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  29.65 
 
 
1212 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  25.68 
 
 
1914 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  32 
 
 
828 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43422  predicted protein  27.03 
 
 
836 aa  112  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293567  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  36.14 
 
 
444 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  29.48 
 
 
919 aa  110  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  28.29 
 
 
1039 aa  108  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  35.36 
 
 
751 aa  107  7e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.64 
 
 
771 aa  106  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  38.29 
 
 
1581 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7217  Tetratricopeptide TPR_4  29.18 
 
 
994 aa  105  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43095  predicted protein  27.44 
 
 
2327 aa  104  4e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30291  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 
1025 aa  104  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  34.23 
 
 
680 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  22.79 
 
 
1714 aa  103  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3535  hypothetical protein  34.87 
 
 
1123 aa  101  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.878105 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  30.86 
 
 
412 aa  100  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 
1105 aa  100  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 
1088 aa  99  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  27.39 
 
 
1450 aa  98.6  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  28.41 
 
 
949 aa  98.6  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  28.62 
 
 
1054 aa  97.8  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  33.81 
 
 
362 aa  97.8  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  27.25 
 
 
1288 aa  97.4  8e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  27.94 
 
 
1694 aa  96.3  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  36.74 
 
 
481 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 
1101 aa  95.9  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  27.61 
 
 
1009 aa  95.5  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  26.97 
 
 
1040 aa  94.7  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  26.46 
 
 
857 aa  94.7  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  23.17 
 
 
706 aa  92.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  25.94 
 
 
924 aa  92.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07129  conserved hypothetical protein  28.02 
 
 
997 aa  91.3  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.242912  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  25.26 
 
 
985 aa  90.9  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00539  conserved hypothetical protein  26.22 
 
 
1363 aa  89.4  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.304551  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1936  TPR repeat-containing protein  23.23 
 
 
1911 aa  89.7  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.261102  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  31.98 
 
 
311 aa  89.7  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  22.36 
 
 
706 aa  89.7  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1114  TPR repeat-containing protein  23.37 
 
 
1147 aa  87.8  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0258591  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.86 
 
 
636 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38879  predicted protein  23.88 
 
 
807 aa  86.7  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.192146  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  29.58 
 
 
284 aa  85.1  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  28.49 
 
 
1290 aa  84.7  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  27.57 
 
 
957 aa  83.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.73 
 
 
1279 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3640  hypothetical protein  32.69 
 
 
310 aa  82  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.04717  decreased coverage  0.00729391 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  26 
 
 
582 aa  82  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3004  TPR repeat-containing protein  23.72 
 
 
1082 aa  81.6  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  32.34 
 
 
2413 aa  80.9  0.00000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  26.46 
 
 
822 aa  80.9  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  32 
 
 
1596 aa  80.1  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  35.69 
 
 
785 aa  79.3  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  22.14 
 
 
927 aa  78.2  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1127  hypothetical protein  35.9 
 
 
404 aa  77.8  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000689424  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  27 
 
 
1106 aa  77.8  0.0000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  23.54 
 
 
1261 aa  77.4  0.0000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>