18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2395 on replicon NC_011061
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011061  Paes_2395    100 
 
 
1613 bp  3198  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  1.07521e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0439  Type I restriction-modification system M subunit  83.09 
 
 
1605 bp  349  2e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00153392  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0129  type I restriction-modification system, M subunit  77.62 
 
 
1614 bp  174  5e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3546  type I restriction-modification system, M subunit  86.26 
 
 
1608 bp  155  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.831972  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1220  type I restriction-modification system, M subunit  86.99 
 
 
1623 bp  139  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.107175  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0450  type I restriction-modification system, M subunit  84.32 
 
 
1614 bp  137  1e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  3.054e-05 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0750  type I restriction-modification system, M subunit  85 
 
 
1635 bp  135  4e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2003  type I restriction-modification system, M subunit  84.46 
 
 
1614 bp  111  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2372  type I restriction-modification system, M subunit  84.46 
 
 
1614 bp  111  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.728855  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1085  type I restriction-modification system, M subunit  88.04 
 
 
1644 bp  95.6  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.103049  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0925  type I restriction-modification system, M subunit  81.18 
 
 
1608 bp  83.8  1e-13  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000528021  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0753    87.64 
 
 
305 bp  81.8  6e-13  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0269  hypothetical protein  84.62 
 
 
450 bp  79.8  2e-12  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.322967  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2619  type I restriction-modification system, M subunit  83.33 
 
 
1755 bp  67.9  9e-09  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3715  type I restriction-modification system, M subunit  81.73 
 
 
1644 bp  56  3e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0443  hypothetical protein  84.21 
 
 
141 bp  56  3e-05  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  7.95345e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0753  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  92.11 
 
 
1605 bp  52  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1912    100 
 
 
438 bp  48.1  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>