53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2324 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_2324  response regulator receiver protein  100 
 
 		 256 aa  528  1e-149  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.618998 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1547  response regulator receiver protein  96.09 
 
 		 256 aa  461  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00304895  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3128  response regulator receiver protein  77.38 
 
 		 270 aa  412  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2180  response regulator receiver protein  50 
 
 		 227 aa  146  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3795  transcriptional regulator, CadC  43.24 
 
 		 325 aa  97.1  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.264433  decreased coverage  0.000000426063 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2701  hypothetical protein  52.22 
 
 		 270 aa  96.7  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0468  putative transcriptional regulator, CadC  38.79 
 
 		 306 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0418  putative transcriptional regulator, CadC  43.88 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000126623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0701  transcriptional regulator, CadC  36.61 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3408  response regulator receiver protein  34.07 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000203949  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0092  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 383 aa  58.9  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170556  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0126  hypothetical protein  33.7 
 
 		 190 aa  53.1  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1709  putative PAS/PAC sensor protein  34.02 
 
 		 669 aa  51.6  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0628445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0053  two component transcriptional regulator  34.38 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000176822 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0059  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000152099 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0051  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0059  transcriptional regulatory protein KdpE  33.33 
 
 		 229 aa  51.2  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0051  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030378 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4228  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.42 
 
 		 1011 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1716  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 		 628 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5499  hypothetical protein  32 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2382  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32 
 
 		 454 aa  46.6  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.598165  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 		 789 aa  46.6  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3017  RcsC  29.41 
 
 		 1083 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 		 764 aa  46.2  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1875  histidine kinase  29.41 
 
 		 785 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0661847  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3840  histidine kinase  29.41 
 
 		 785 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0989388  normal  0.369399 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2174  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.08 
 
 		 633 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.634157  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4616  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.76 
 
 		 701 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1450  histidine kinase  29.41 
 
 		 785 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.106734  normal  0.251272 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 		 1478 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4171  CheA signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 686 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1034  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.11 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.171933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2671  response regulator receiver domain-containing protein  36.47 
 
 		 287 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3274  two component transcriptional regulator  29.41 
 
 		 230 aa  44.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.644217  normal  0.18395 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4303  two component transcriptional regulator  31.25 
 
 		 229 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.205089  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1564  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.71 
 
 		 223 aa  43.5  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194978  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59780  putative kinase sensor protein  29.79 
 
 		 1084 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000030188  hitchhiker  3.75506e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1708  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.61 
 
 		 869 aa  43.5  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0056  two component transcriptional regulator  31.25 
 
 		 229 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000725059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1566  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.25 
 
 		 228 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435599 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1749  two component heavy metal response transcriptional regulator  31.25 
 
 		 242 aa  43.1  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0055  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.25 
 
 		 229 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.95 
 
 		 955 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3990  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.86 
 
 		 666 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4377  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.86 
 
 		 666 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5978  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.86 
 
 		 656 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.410257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1943  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 		 596 aa  42.4  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.35 
 
 		 1331 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3752  two component transcriptional regulator  27.66 
 
 		 224 aa  42.4  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000783534  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3207  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.78 
 
 		 910 aa  42.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1294  DNA-binding response regulator  29.25 
 
 		 180 aa  42  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000125664  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4640  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.78 
 
 		 1194 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0814409  normal  0.0127622 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>