More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2284 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_2284  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 444 aa  922    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00108467  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3221  radical SAM domain-containing protein  27.22 
 
 		 484 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.726288  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  27.23 
 
 		 459 aa  177  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2359  radical SAM domain-containing protein  30.38 
 
 		 450 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.288415  hitchhiker  0.00183234 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  24.1 
 
 		 455 aa  120  6e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1456  radical SAM domain-containing protein  24.71 
 
 		 454 aa  103  6e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1501  radical SAM domain-containing protein  24.71 
 
 		 454 aa  103  6e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.567857  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0668  radical SAM domain-containing protein  23.87 
 
 		 449 aa  99  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204384  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  25.84 
 
 		 400 aa  98.6  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  24.83 
 
 		 432 aa  94  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1480  radical SAM domain-containing protein  25.82 
 
 		 442 aa  93.2  8e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.227708  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  25.07 
 
 		 394 aa  92.8  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1624  Radical SAM domain protein  26.59 
 
 		 486 aa  92.8  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3232  radical SAM domain protein  27.57 
 
 		 246 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.907539  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6334  Radical SAM domain protein  30.17 
 
 		 419 aa  84.7  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0725918  hitchhiker  0.00194618 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  22 
 
 		 447 aa  80.9  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  25.34 
 
 		 429 aa  80.5  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1357  radical SAM domain-containing protein  29.68 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0897  Radical SAM domain protein  23.81 
 
 		 454 aa  79.7  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  24.94 
 
 		 436 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1369  radical SAM domain-containing protein  22.86 
 
 		 454 aa  79  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  25.29 
 
 		 434 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  23.56 
 
 		 510 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  24.04 
 
 		 434 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  27.86 
 
 		 442 aa  76.6  0.0000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  27.86 
 
 		 442 aa  76.6  0.0000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  24.31 
 
 		 440 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1445  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 468 aa  75.1  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1605  radical SAM domain-containing protein  24.34 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  23.48 
 
 		 461 aa  74.3  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  25.28 
 
 		 456 aa  73.9  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  27.6 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  26.46 
 
 		 399 aa  72.8  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0870  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  25.41 
 
 		 483 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  23.26 
 
 		 450 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1058  radical SAM domain-containing protein  24.32 
 
 		 455 aa  71.6  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0142  Radical SAM domain protein  25.07 
 
 		 477 aa  70.9  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  22.48 
 
 		 447 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  28.12 
 
 		 407 aa  68.9  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1520  radical SAM domain-containing protein  25.5 
 
 		 311 aa  68.9  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  25.14 
 
 		 346 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1580  Radical SAM domain protein  25.07 
 
 		 429 aa  68.2  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  26.84 
 
 		 358 aa  68.2  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  24.62 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  22.47 
 
 		 399 aa  67.8  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  23.61 
 
 		 473 aa  67.4  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2456  radical SAM domain-containing protein  24.75 
 
 		 470 aa  67.4  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  30.73 
 
 		 402 aa  67  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  24.19 
 
 		 399 aa  67  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.04 
 
 		 399 aa  65.9  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  27.14 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1970  Radical SAM domain protein  24.64 
 
 		 346 aa  65.5  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  24.91 
 
 		 446 aa  65.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  24.38 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  31.32 
 
 		 402 aa  65.9  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  26.29 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0685  radical SAM domain-containing protein  24.79 
 
 		 499 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  22.96 
 
 		 476 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  23.19 
 
 		 476 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1396  Radical SAM domain protein  24.4 
 
 		 447 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.581014  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  25.79 
 
 		 394 aa  64.3  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5654  Radical SAM domain-containing protein  24.62 
 
 		 449 aa  64.3  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150626  normal  0.213395 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  26.94 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.08 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0478  radical SAM family protein  20.89 
 
 		 448 aa  63.9  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  23.36 
 
 		 476 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  24.57 
 
 		 565 aa  63.5  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1828  Radical SAM domain protein  26.03 
 
 		 445 aa  63.5  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146977 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2981  Radical SAM domain protein  25.41 
 
 		 477 aa  63.5  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0847138  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  22.89 
 
 		 476 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  23.14 
 
 		 446 aa  63.2  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  23.75 
 
 		 450 aa  62.8  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  22.75 
 
 		 476 aa  63.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  22.89 
 
 		 399 aa  62  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  26.92 
 
 		 387 aa  62  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  21.61 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1900  radical SAM domain-containing protein  27.42 
 
 		 382 aa  62  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.816144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  24.47 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  24.38 
 
 		 476 aa  62  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  25.13 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  23.44 
 
 		 398 aa  61.6  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  27.47 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  25.7 
 
 		 452 aa  61.6  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3170  radical SAM family protein  28.34 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  20.18 
 
 		 460 aa  60.8  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3241  radical SAM family protein  24.76 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.036472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  24.7 
 
 		 405 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  23.24 
 
 		 443 aa  60.8  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  26.04 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  22.47 
 
 		 481 aa  60.1  0.00000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  22.6 
 
 		 501 aa  60.5  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  23.15 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  23.56 
 
 		 452 aa  60.1  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  24.19 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  25.26 
 
 		 380 aa  59.7  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  26.44 
 
 		 366 aa  59.7  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  20.41 
 
 		 385 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  20.89 
 
 		 489 aa  59.7  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  25.4 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1280  Radical SAM domain protein  24.14 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>