More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2276 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  100 
 
 
397 aa  803    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2535  phosphoglycerate kinase  83.88 
 
 
397 aa  686    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316768  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0044  phosphoglycerate kinase  74.56 
 
 
397 aa  600  1e-170  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200914  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2734  phosphoglycerate kinase  72.54 
 
 
397 aa  592  1e-168  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2906  phosphoglycerate kinase  74.31 
 
 
397 aa  591  1e-168  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2123  phosphoglycerate kinase  75.25 
 
 
397 aa  574  1.0000000000000001e-163  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.357501  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2515  phosphoglycerate kinase  74.56 
 
 
397 aa  560  1e-158  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  61.21 
 
 
397 aa  491  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  59.7 
 
 
646 aa  488  1e-137  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  60.05 
 
 
650 aa  489  1e-137  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  60.76 
 
 
393 aa  485  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  57.75 
 
 
401 aa  482  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1332  phosphoglycerate kinase  58.73 
 
 
396 aa  481  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000015474  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  57.75 
 
 
402 aa  474  1e-133  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  57.75 
 
 
400 aa  471  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  58.79 
 
 
394 aa  474  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  58.19 
 
 
395 aa  472  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  57.75 
 
 
400 aa  471  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  57.25 
 
 
401 aa  471  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  58.19 
 
 
393 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  57.79 
 
 
399 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02131  phosphoglycerate kinase  55.75 
 
 
402 aa  464  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  57.93 
 
 
394 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0197  phosphoglycerate kinase  57.61 
 
 
402 aa  465  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.868475  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  57.54 
 
 
399 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  57.89 
 
 
400 aa  464  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  57.21 
 
 
402 aa  462  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  57.93 
 
 
393 aa  461  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  56.68 
 
 
393 aa  463  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2542  phosphoglycerate kinase  57.92 
 
 
403 aa  462  1e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0958  phosphoglycerate kinase  58.52 
 
 
406 aa  462  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0418807  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  56.75 
 
 
396 aa  459  9.999999999999999e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  57.18 
 
 
394 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02151  phosphoglycerate kinase  57.36 
 
 
402 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.772299  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  58.08 
 
 
394 aa  459  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02131  phosphoglycerate kinase  57.36 
 
 
402 aa  461  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0158378  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0772  phosphoglycerate kinase  57.25 
 
 
400 aa  455  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.608835  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  56.14 
 
 
401 aa  455  1e-127  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02241  phosphoglycerate kinase  55.11 
 
 
402 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2336  phosphoglycerate kinase  54.14 
 
 
396 aa  448  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1562  phosphoglycerate kinase  55 
 
 
401 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02711  phosphoglycerate kinase  55 
 
 
401 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.542851  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1510  phosphoglycerate kinase  55.14 
 
 
397 aa  448  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1300  phosphoglycerate kinase  55.14 
 
 
397 aa  448  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2424  phosphoglycerate kinase  54.61 
 
 
396 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069746  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4275  phosphoglycerate kinase  56.5 
 
 
400 aa  450  1e-125  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.487807  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2143  phosphoglycerate kinase  55 
 
 
401 aa  445  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1531  phosphoglycerate kinase  54.14 
 
 
396 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1265  phosphoglycerate kinase  56.06 
 
 
402 aa  444  1e-123  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.65973  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2281  phosphoglycerate kinase  54.52 
 
 
396 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306053  normal  0.408831 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0739  phosphoglycerate kinase  53.77 
 
 
400 aa  442  1e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000081291  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  55.53 
 
 
655 aa  444  1e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  54.66 
 
 
394 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  54.52 
 
 
395 aa  440  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3376  phosphoglycerate kinase  55.75 
 
 
398 aa  439  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  54.41 
 
 
394 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  54.91 
 
 
394 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  54.41 
 
 
394 aa  436  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  54.66 
 
 
394 aa  437  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  54.66 
 
 
394 aa  437  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  54.66 
 
 
394 aa  437  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  54.66 
 
 
394 aa  435  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  54.66 
 
 
394 aa  437  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  54.66 
 
 
394 aa  436  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  54.91 
 
 
394 aa  436  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  57.14 
 
 
395 aa  434  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  57.14 
 
 
395 aa  434  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_46028  predicted protein  52.38 
 
 
435 aa  434  1e-120  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0273  phosphoglycerate kinase  55.08 
 
 
443 aa  434  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.632578  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2875  phosphoglycerate kinase  53.38 
 
 
397 aa  431  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000618078  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1418  Phosphoglycerate kinase  55.11 
 
 
403 aa  429  1e-119  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.356013 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1556  Phosphoglycerate kinase  53.37 
 
 
399 aa  428  1e-119  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000537872  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4845  phosphoglycerate kinase  56.93 
 
 
394 aa  428  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1886  phosphoglycerate kinase  51.51 
 
 
396 aa  425  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0022646  normal  0.565163 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2004  phosphoglycerate kinase  54.16 
 
 
392 aa  422  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374925  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0766  Phosphoglycerate kinase  54.11 
 
 
398 aa  424  1e-117  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0161542  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1694  phosphoglycerate kinase  52.17 
 
 
399 aa  421  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0476729  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2018  phosphoglycerate kinase  52.53 
 
 
394 aa  421  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1883  phosphoglycerate kinase  53.25 
 
 
399 aa  418  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  52.9 
 
 
392 aa  419  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  52.43 
 
 
654 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03315  phosphoglycerate kinase  50.51 
 
 
420 aa  417  9.999999999999999e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1947  phosphoglycerate kinase  52.06 
 
 
398 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194449  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0229  Phosphoglycerate kinase  53.48 
 
 
399 aa  417  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0693093  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2337  phosphoglycerate kinase  52.99 
 
 
399 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00547596  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1921  phosphoglycerate kinase  53.19 
 
 
405 aa  413  1e-114  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0108168  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1540  phosphoglycerate kinase  52.64 
 
 
395 aa  412  1e-114  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0574001  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0432  phosphoglycerate kinase  51.99 
 
 
401 aa  414  1e-114  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0923  Phosphoglycerate kinase  54.29 
 
 
396 aa  411  1e-113  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.314525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0616  phosphoglycerate kinase  50.13 
 
 
399 aa  410  1e-113  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.160418 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2060  phosphoglycerate kinase  51.76 
 
 
399 aa  410  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00601858  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0977  phosphoglycerate kinase  51.9 
 
 
395 aa  407  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0290611  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0803  phosphoglycerate kinase  52.16 
 
 
398 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3269  Phosphoglycerate kinase  53.25 
 
 
397 aa  406  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.891729  decreased coverage  0.00998041 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0638  phosphoglycerate kinase  50.25 
 
 
404 aa  405  1.0000000000000001e-112  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0343575  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0422  Phosphoglycerate kinase  49.75 
 
 
399 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.052371  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1778  Phosphoglycerate kinase  52.79 
 
 
394 aa  404  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.991456  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10120  phosphoglycerate kinase  53.54 
 
 
394 aa  402  1e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000642987 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1257  Phosphoglycerate kinase  50.63 
 
 
399 aa  398  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0798  phosphoglycerate kinase  51.36 
 
 
396 aa  399  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.226782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>