151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2246 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_2246  ATP synthase F0, C subunit  100 
 
 
78 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.548731  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2501  ATP synthase F0, C subunit  87.18 
 
 
78 aa  126  9.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2490  ATP synthase F0, C subunit  94.44 
 
 
73 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000013986  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2884  ATP synthase F0, C subunit  91.67 
 
 
73 aa  124  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000318758  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0065  ATP synthase F0, C subunit  93.44 
 
 
75 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.475844  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2097  ATP synthase F0, C subunit  98.25 
 
 
75 aa  106  8.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.887502  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2708  ATP synthase F0, C subunit  82.05 
 
 
75 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00577662  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0312  ATP synthase F0, C subunit  71.83 
 
 
75 aa  97.4  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103627  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4486  ATP synthase F0, C subunit  64.1 
 
 
79 aa  96.7  9e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862141  normal  0.124516 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4494  ATP synthase F0, C subunit  70 
 
 
76 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4339  ATP synthase F0, C subunit  65.28 
 
 
76 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4475  ATP synthase F0, C subunit  65.28 
 
 
76 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0393  ATP synthase F0, C subunit  70.49 
 
 
70 aa  78.6  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0062  ATP synthase F0 subunit C  64.06 
 
 
81 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0171  H+transporting two-sector ATPase C subunit  64.41 
 
 
96 aa  72.4  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.251186  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1516  ATP synthase F0, C subunit  60.66 
 
 
75 aa  71.6  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000666006 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  47.89 
 
 
74 aa  68.2  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1974  ATP synthase F0, C subunit  67.35 
 
 
73 aa  64.3  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00289  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0180  ATP synthase, subunit C (H(+)-transporting two-sector ATPase)  65.31 
 
 
79 aa  62.8  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.51432  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1056  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  62.75 
 
 
65 aa  60.1  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1230  ATP synthase F0, C subunit  71.05 
 
 
93 aa  57.4  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  46.77 
 
 
81 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1717  ATP synthase F0, C subunit  67.5 
 
 
66 aa  56.2  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000377801  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  46.77 
 
 
81 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  46.77 
 
 
81 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  46.77 
 
 
81 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3215  ATP synthase F0, C subunit  63.04 
 
 
85 aa  55.1  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.112485 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4016  ATP synthase F0, C subunit  42.65 
 
 
91 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.64478e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3932  ATP synthase F0, C subunit  42.65 
 
 
91 aa  55.5  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000044416  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1501  ATP synthase F0, C subunit  42.65 
 
 
91 aa  54.3  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.766921  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5435  F0F1 ATP synthase subunit C  43.66 
 
 
72 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5160  F0F1 ATP synthase subunit C  43.66 
 
 
72 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.254588  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4993  F0F1 ATP synthase subunit C  43.66 
 
 
72 aa  53.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191297  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5010  F0F1 ATP synthase subunit C  43.66 
 
 
72 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.222646  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19180  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  54.39 
 
 
75 aa  53.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5552  F0F1 ATP synthase subunit C  43.66 
 
 
72 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0600  ATP synthase F0, C subunit  39.71 
 
 
91 aa  52.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4249  ATP synthase F0, C subunit  41.18 
 
 
91 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000950029  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5401  F0F1 ATP synthase subunit C  43.66 
 
 
72 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.20479e-54 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3830  F0F1 ATP synthase subunit C  44.12 
 
 
72 aa  53.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000199099  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5432  F0F1 ATP synthase subunit C  43.66 
 
 
72 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5519  F0F1 ATP synthase subunit C  43.66 
 
 
72 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000362288  hitchhiker  1.48616e-17 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  43.55 
 
 
111 aa  52.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5108  F0F1 ATP synthase subunit C  43.66 
 
 
72 aa  53.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242215  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5488  F0F1 ATP synthase subunit C  43.66 
 
 
72 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106382  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  43.55 
 
 
82 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  43.55 
 
 
82 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  40.62 
 
 
96 aa  52.8  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0068  ATP synthase F0, C subunit  45.31 
 
 
103 aa  52  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  43.55 
 
 
122 aa  51.2  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0601  ATP synthase F0, C subunit  46.27 
 
 
100 aa  51.6  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1779  ATP synthase F0, C subunit  47.27 
 
 
77 aa  51.2  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09980  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  47.37 
 
 
78 aa  50.8  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697576  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  35.62 
 
 
77 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1213  ATP synthase F0, C subunit  46.67 
 
 
81 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2615  F0F1 ATP synthase subunit C  45.28 
 
 
81 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632926  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2203  F0F1 ATP synthase subunit C  45.28 
 
 
81 aa  50.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0392559  normal  0.227618 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1067  ATP synthase F0, C subunit  41.94 
 
 
81 aa  49.7  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6141  ATP synthase F0, C subunit  45.45 
 
 
73 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0800  ATP synthase F0, C subunit  38.81 
 
 
321 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2412  ATP synthase F0, C subunit  45 
 
 
68 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3360  ATP synthase F0, C subunit  38.24 
 
 
91 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000392065  hitchhiker  0.00459127 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  42.19 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2453  ATP synthase F0, C subunit  45.45 
 
 
76 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3143  ATP synthase F0, C subunit  38.24 
 
 
91 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00841289  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1128  F0F1-type ATP synthase subunit C  47.27 
 
 
75 aa  48.9  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0333  ATP synthase F0, C subunit  36.76 
 
 
91 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000631431  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0895  H+transporting two-sector ATPase C subunit  45.31 
 
 
74 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3635  ATP synthase F0, C subunit  40.35 
 
 
74 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.466022  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0332  F0F1 ATP synthase subunit C  43.4 
 
 
81 aa  47.4  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.708113  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2603  ATP synthase F0, C subunit  42.42 
 
 
73 aa  47.8  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239607  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3387  F0F1 ATP synthase subunit C  43.4 
 
 
81 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000140393  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2716  F0F1 ATP synthase subunit C  43.4 
 
 
81 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0517  ATP synthase F0, C subunit  42.86 
 
 
77 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.959097  normal  0.580721 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17860  ATP synthase F0, C subunit  48.44 
 
 
83 aa  47  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4141  ATP synthase F0, C subunit  41.67 
 
 
75 aa  47  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0559  ATP synthase F0, C subunit  37.68 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0247806  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3334  ATP synthase F0 subunit C  45.1 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2623  F0F1 ATP synthase subunit C  43.4 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.989267 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1302  ATP synthase F0, C subunit  45.45 
 
 
74 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.331137  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4300  F0F1 ATP synthase subunit C  37.33 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00293753  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0250  F0F1 ATP synthase subunit C  40.91 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.436131  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0533  ATP synthase F0, C subunit  37.68 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274514  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_498  ATP synthase F0, C subunit  37.68 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00034769  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1714  F0F1 ATP synthase subunit C  39.39 
 
 
70 aa  45.4  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2192  F0F1 ATP synthase subunit C  41.51 
 
 
82 aa  45.4  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0331  ATP synthase F0, C subunit  42.11 
 
 
76 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0475  F0F1 ATP synthase subunit C  39.44 
 
 
89 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0683379  normal  0.590226 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2144  F0F1 ATP synthase subunit C  39.39 
 
 
70 aa  45.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2182  F0F1 ATP synthase subunit C  39.39 
 
 
70 aa  45.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.383564  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2142  ATP synthase F0, C subunit  43.75 
 
 
76 aa  45.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1488  F0F1 ATP synthase subunit C  43.14 
 
 
82 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300994  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4623  ATP synthase F0, C subunit  37.29 
 
 
92 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0484  F0F1 ATP synthase subunit C  41.51 
 
 
81 aa  45.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0660  F0F1-type ATP synthase, subunit c  39.66 
 
 
70 aa  45.4  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.307082  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1758  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  45 
 
 
69 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19238  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0192  F0F1 ATP synthase subunit C  39.19 
 
 
82 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.869605 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4067  ATP synthase F0, C subunit  43.14 
 
 
77 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0293539  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf042  ATP synthase C chain  39.68 
 
 
90 aa  45.1  0.0003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0152  ATP synthase, C subunit  37.14 
 
 
109 aa  45.4  0.0003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>