15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2242 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_2242  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  296  5e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.85099  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2491  hypothetical protein  81.33 
 
 
150 aa  227  4e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.548043  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2487  hypothetical protein  65.38 
 
 
160 aa  172  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000274795  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1334  hypothetical protein  64.29 
 
 
160 aa  169  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.355353  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1002  hypothetical protein  62.5 
 
 
154 aa  166  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0683  hypothetical protein  58.33 
 
 
159 aa  150  5.9999999999999996e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00218027  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1149  hypothetical protein  56.56 
 
 
178 aa  140  7e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000392175  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00099  hypothetical protein  46.61 
 
 
148 aa  116  9e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2148  hypothetical protein  46.03 
 
 
144 aa  110  8.000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.511349  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1418  hypothetical protein  41.13 
 
 
145 aa  103  9e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.6107  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0375  hypothetical protein  41.88 
 
 
153 aa  97.4  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.578155  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1846  hypothetical protein  42.02 
 
 
147 aa  95.1  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.325818 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1462  hypothetical protein  36.8 
 
 
148 aa  83.6  9e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0573227 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1055  hypothetical protein  32.56 
 
 
145 aa  51.6  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.310869 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1186  hypothetical protein  23.2 
 
 
143 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000110214  decreased coverage  0.000713842 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>