157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2187 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_2187  biotin biosynthesis protein BioC  100 
 
 		 268 aa  556  1e-157  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2836  biotin biosynthesis protein BioC  47.83 
 
 		 260 aa  249  4e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2455  biotin biosynthesis protein BioC  50.79 
 
 		 261 aa  248  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.46408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2427  biotin biosynthesis protein BioC  46.27 
 
 		 260 aa  246  3e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0115  biotin biosynthesis protein BioC  44.14 
 
 		 260 aa  236  3e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2067  biotin biosynthesis protein BioC  43.25 
 
 		 263 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0081  biotin biosynthesis protein BioC  46.59 
 
 		 261 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1619  biotin synthesis protein BioC, putative  30.71 
 
 		 255 aa  132  6e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2455  methyltransferase type 11  30.04 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.527849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2921  methyltransferase type 11  34.02 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0384761  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2814  biotin biosynthesis protein BioC  30.6 
 
 		 285 aa  103  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2131  biotin synthesis protein  29.08 
 
 		 274 aa  103  4e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.239088  normal  0.428631 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1385  biotin synthesis protein BioC  26.21 
 
 		 233 aa  99.4  6e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  29 
 
 		 269 aa  99  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  27.72 
 
 		 269 aa  99  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  29 
 
 		 269 aa  98.6  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  27.72 
 
 		 269 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  29.14 
 
 		 283 aa  95.5  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  27.34 
 
 		 269 aa  94.7  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  27.34 
 
 		 269 aa  94.7  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  27.34 
 
 		 269 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  27.34 
 
 		 269 aa  94.7  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1661  biotin biosynthesis protein BioC  26.72 
 
 		 228 aa  94.7  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  27.34 
 
 		 269 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0349  biotin biosynthesis protein BioC  26.05 
 
 		 228 aa  94.4  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0326  biotin biosynthesis protein BioC  26.05 
 
 		 228 aa  93.6  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  27.61 
 
 		 269 aa  93.2  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  27.97 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3137  methyltransferase type 11  31.69 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474938  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1663  biotin biosynthesis protein  27.5 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363598  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0084  putative biotin synthesis protein  22.46 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  25.44 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  24.82 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  26.54 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  26.54 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0033  biotin biosynthesis protein BioC  26.95 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  25.95 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  24.73 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  25.87 
 
 		 266 aa  67  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  26.32 
 
 		 291 aa  67  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  25.09 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  21.88 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  24.81 
 
 		 295 aa  65.5  0.0000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  26.91 
 
 		 558 aa  65.5  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  25.54 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2899  biotin biosynthesis protein BioC  28.3 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.785116  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  29.3 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  24.81 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  28.12 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  28.99 
 
 		 474 aa  61.6  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  25.84 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.42 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  22.58 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1268  biotin biosynthesis protein BioC  27.75 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00543221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1043  biotin synthesis protein  24.06 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0936  putative biotin biosynthesis protein BioC  23.83 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  26.48 
 
 		 274 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  22.26 
 
 		 279 aa  57  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  26.48 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  27.17 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  25 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  45.76 
 
 		 294 aa  55.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2627  biotin synthesis protein, putative  26.15 
 
 		 267 aa  53.9  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0615  biotin biosynthesis protein BioC  24.43 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.53038  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0891  biotin biosynthesis protein BioC  28.12 
 
 		 251 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  23.48 
 
 		 270 aa  52.4  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  21.97 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  25.58 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  43.1 
 
 		 294 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  26.28 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  27.04 
 
 		 253 aa  50.4  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0946  biotin biosynthesis protein BioC  29.81 
 
 		 251 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000915647  normal  0.885447 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  26.85 
 
 		 275 aa  49.7  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0312  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  27.53 
 
 		 333 aa  49.7  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0386  methyltransferase  42.86 
 
 		 289 aa  49.7  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.559124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0077  trans-aconitate methyltransferase  30.34 
 
 		 258 aa  49.7  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0923  biotin biosynthesis protein BioC  29.63 
 
 		 251 aa  49.7  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00600636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6020  Trans-aconitate 2-methyltransferase  28.36 
 
 		 252 aa  49.3  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0109  methyltransferase type 11  44.64 
 
 		 277 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2277  Methyltransferase type 12  21.96 
 
 		 230 aa  49.3  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0860  biotin biosynthesis protein BioC  27.34 
 
 		 251 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00894914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1868  methyltransferase type 11  24.24 
 
 		 263 aa  48.9  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00760268  decreased coverage  0.000000322294 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3817  biotin synthesis protein BioC  28.07 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0316  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.4 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.224637  normal  0.898974 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  22.18 
 
 		 268 aa  48.5  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  27.33 
 
 		 272 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0832  biotin biosynthesis protein BioC  29.19 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189171  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0274  methyltransferase type 11  26.55 
 
 		 319 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11990  predicted protein  23.81 
 
 		 330 aa  47.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2062  putative methyl transferase  22.77 
 
 		 230 aa  48.1  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00567331  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  28.08 
 
 		 251 aa  48.1  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  28.97 
 
 		 263 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  22.8 
 
 		 275 aa  47.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  28.08 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  25.82 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17170  trans-aconitate methyltransferase  23.08 
 
 		 255 aa  47.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00821566  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  27.81 
 
 		 276 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  22.51 
 
 		 281 aa  47  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  28.08 
 
 		 251 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  22.51 
 
 		 281 aa  47.4  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>