90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2182 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_2182  hypothetical protein  100 
 
 
401 aa  811    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2452  hypothetical protein  56.61 
 
 
402 aa  449  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.280378  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2587  hypothetical protein  54.87 
 
 
444 aa  429  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2822  hypothetical protein  53.54 
 
 
420 aa  423  1e-117  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0021  hypothetical protein  52.38 
 
 
399 aa  412  1e-114  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0629415  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2423  hypothetical protein  50.63 
 
 
419 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2063  hypothetical protein  50.77 
 
 
417 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2926  hypothetical protein  32.8 
 
 
394 aa  204  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.812191  hitchhiker  0.000139992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4599  hypothetical protein  32.24 
 
 
393 aa  203  4e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107377  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3389  hypothetical protein  34.33 
 
 
399 aa  203  4e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.121637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2262  hypothetical protein  34.78 
 
 
396 aa  196  6e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.237582  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13168  hypothetical protein  29.11 
 
 
396 aa  176  6e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4993  hypothetical protein  32.56 
 
 
408 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.513988 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1929  hypothetical protein  31.36 
 
 
383 aa  163  5.0000000000000005e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0557173  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0324  SAM-dependent methyltransferase  29.98 
 
 
431 aa  156  7e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.71025  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0026  hypothetical protein  24.58 
 
 
433 aa  142  9.999999999999999e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1098  hypothetical protein  28.5 
 
 
407 aa  121  3e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.697484 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0077  hypothetical protein  26.82 
 
 
392 aa  101  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1152  hypothetical protein  27.48 
 
 
388 aa  99.4  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3060  hypothetical protein  31.14 
 
 
400 aa  98.6  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28440  hypothetical protein  29 
 
 
399 aa  95.9  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2351  hypothetical protein  27.88 
 
 
407 aa  94  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175675  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3648  hypothetical protein  26.95 
 
 
388 aa  92.4  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2598  hypothetical protein  28.61 
 
 
411 aa  92.4  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000882332 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1860  hypothetical protein  26.07 
 
 
412 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181101  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1841  hypothetical protein  26.07 
 
 
369 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1907  hypothetical protein  26.07 
 
 
412 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4027  hypothetical protein  25.13 
 
 
428 aa  89.7  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2600  hypothetical protein  27.22 
 
 
423 aa  87.8  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.590151  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2590  hypothetical protein  26.88 
 
 
400 aa  85.9  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.709956  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2934  hypothetical protein  28.08 
 
 
382 aa  85.1  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6063  hypothetical protein  27.43 
 
 
383 aa  83.6  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0971  hypothetical protein  25.07 
 
 
385 aa  82.8  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4268  hypothetical protein  26.72 
 
 
372 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13053  hypothetical protein  26.27 
 
 
358 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2888  hypothetical protein  27.67 
 
 
414 aa  80.5  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00389281  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0634  hypothetical protein  24.94 
 
 
412 aa  79.7  0.00000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1663  hypothetical protein  26.47 
 
 
396 aa  77  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29160  hypothetical protein  26.24 
 
 
438 aa  76.6  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3266  hypothetical protein  25.75 
 
 
399 aa  76.3  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0734  hypothetical protein  27.9 
 
 
396 aa  75.9  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.386022  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0682  hypothetical protein  25.96 
 
 
418 aa  73.6  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601703  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3087  hypothetical protein  25.86 
 
 
416 aa  72.4  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000449393  hitchhiker  0.0000364534 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4454  hypothetical protein  24.59 
 
 
407 aa  72  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08510  hypothetical protein  26.3 
 
 
422 aa  70.1  0.00000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4259  hypothetical protein  28.79 
 
 
415 aa  68.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2091  hypothetical protein  26.15 
 
 
381 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5789  hypothetical protein  26.85 
 
 
487 aa  63.5  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712723  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1085  hypothetical protein  25.83 
 
 
403 aa  60.1  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.643719  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1249  Methyltransferase type 11  29.25 
 
 
385 aa  59.7  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.419487  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0802  hypothetical protein  24.86 
 
 
477 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3843  hypothetical protein  26.91 
 
 
428 aa  53.9  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2446  methyltransferase  23.55 
 
 
357 aa  52  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.949706  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1360  hypothetical protein  23.28 
 
 
375 aa  50.1  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16610  hypothetical protein  26.34 
 
 
443 aa  47.4  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3184  methyltransferase small  34.15 
 
 
244 aa  47.4  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.241453  normal  0.13403 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1452  RNA methyltransferase  32.61 
 
 
495 aa  47.4  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1688  RNA methyltransferase, TrmA family  34.62 
 
 
476 aa  47.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.618499 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1069  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  36.23 
 
 
667 aa  47.4  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0535  RNA methyltransferase  33.6 
 
 
465 aa  47  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0173  methyltransferase  41.03 
 
 
203 aa  47  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.147272  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1687  protein-L-isoaspartate methyltransferase-like protein  35.56 
 
 
241 aa  47  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0381011  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0511  methyltransferase type 11  29.17 
 
 
297 aa  46.6  0.0009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  36.78 
 
 
471 aa  46.2  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3469  hypothetical protein  38.27 
 
 
209 aa  46.2  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0545703  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2801  RNA methyltransferase  34.41 
 
 
470 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0218  putative methyltransferase  35.87 
 
 
193 aa  46.2  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  29.86 
 
 
459 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0135  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  39.73 
 
 
206 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3506  hypothetical protein  31.58 
 
 
191 aa  45.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124416  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2273  protein-L-isoaspartate methyltransferase-like  34.57 
 
 
241 aa  45.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00159  hypothetical protein  32.35 
 
 
258 aa  45.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  32.26 
 
 
460 aa  45.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2473  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  39.24 
 
 
222 aa  44.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3981  putative methyltransferase  31.11 
 
 
209 aa  44.7  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0470106  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1332  RNA methyltransferase, TrmA family  26.51 
 
 
447 aa  44.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000710273 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1391  Methyltransferase type 12  32.26 
 
 
246 aa  44.7  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.974092  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6438  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  37.21 
 
 
394 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.204863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2893  RNA methyltransferase, TrmA family  29.82 
 
 
572 aa  44.3  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4233  hypothetical protein  26.72 
 
 
411 aa  43.9  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2309  RNA methyltransferase  34.41 
 
 
493 aa  43.9  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.12141  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  33.98 
 
 
457 aa  43.9  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2971  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  39.24 
 
 
444 aa  43.9  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.422086  hitchhiker  0.0000745246 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  33.72 
 
 
436 aa  43.9  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0451  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  29.91 
 
 
463 aa  43.5  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.450901  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0622  putative methyltransferase  32.86 
 
 
203 aa  43.5  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0800  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  28.57 
 
 
270 aa  43.5  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07540  hypothetical protein  27.36 
 
 
474 aa  43.5  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.559975 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3775  putative methyltransferase  34.57 
 
 
215 aa  43.1  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526648  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3848  putative methyltransferase  34.57 
 
 
215 aa  43.1  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.493738  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>