More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2163 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_2163  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
193 aa  394  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.560543  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2806  orotate phosphoribosyltransferase  72.34 
 
 
188 aa  299  2e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2571  orotate phosphoribosyltransferase  71.35 
 
 
193 aa  298  2e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.13902  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2430  orotate phosphoribosyltransferase  71.43 
 
 
193 aa  293  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2407  orotate phosphoribosyltransferase  70.21 
 
 
188 aa  288  2e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.9504  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2048  orotate phosphoribosyltransferase  73.51 
 
 
191 aa  286  1e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0017  orotate phosphoribosyltransferase  72.25 
 
 
195 aa  277  8e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.722393  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2348  orotate phosphoribosyltransferase  55.79 
 
 
191 aa  233  9e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.841957 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1689  orotate phosphoribosyltransferase  58.51 
 
 
191 aa  227  7e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1382  orotate phosphoribosyltransferase  56.38 
 
 
190 aa  226  1e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4012  orotate phosphoribosyltransferase  55.56 
 
 
201 aa  224  6e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1277  hypothetical protein  52.75 
 
 
191 aa  223  1e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2126  orotate phosphoribosyltransferase  51.83 
 
 
193 aa  216  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1813  orotate phosphoribosyltransferase  52.66 
 
 
190 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000567028  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0923  orotate phosphoribosyltransferase  52.69 
 
 
189 aa  211  7e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09430  orotate phosphoribosyltransferase  50.53 
 
 
193 aa  207  7e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000503658  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0377  orotate phosphoribosyltransferase  50 
 
 
189 aa  199  3e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0588  orotate phosphoribosyltransferase  48.91 
 
 
187 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0256726  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0602  orotate phosphoribosyltransferase  48.91 
 
 
187 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1381  orotate phosphoribosyltransferase  46.77 
 
 
192 aa  189  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000390068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1196  orotate phosphoribosyltransferase  46.77 
 
 
192 aa  189  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100317  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0459  orotate phosphoribosyltransferase  45.83 
 
 
195 aa  184  9e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0417  orotate phosphoribosyltransferase  45.95 
 
 
196 aa  181  7e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1004  orotate phosphoribosyltransferase  44.81 
 
 
187 aa  178  4e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1193  orotate phosphoribosyltransferase  45 
 
 
187 aa  176  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_976  orotate phosphoribosyltransferase  45 
 
 
187 aa  175  3e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2760  orotate phosphoribosyltransferase  43.01 
 
 
195 aa  175  4e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1368  orotate phosphoribosyltransferase  42.47 
 
 
195 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0269  orotate phosphoribosyltransferase  43.85 
 
 
188 aa  168  6e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1029  orotate phosphoribosyltransferase  43.01 
 
 
195 aa  164  5.9999999999999996e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00928266  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0908  orotate phosphoribosyltransferase  43.85 
 
 
189 aa  163  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0228  orotate phosphoribosyltransferase  46.2 
 
 
200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0032  orotate phosphoribosyltransferase  47.03 
 
 
196 aa  163  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2339  orotate phosphoribosyltransferase  44.81 
 
 
189 aa  163  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375656  hitchhiker  0.00775418 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3874  orotate phosphoribosyltransferase  43.81 
 
 
196 aa  162  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.223977  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0886  orotate phosphoribosyltransferase  43.16 
 
 
198 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.917527  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1108  orotate phosphoribosyltransferase  42.05 
 
 
199 aa  160  1e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.899932  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2068  orotate phosphoribosyltransferase  43.59 
 
 
202 aa  155  3e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2281  orotate phosphoribosyltransferase  42.05 
 
 
202 aa  154  7e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1732  orotate phosphoribosyltransferase  42.41 
 
 
194 aa  154  7e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2572  orotate phosphoribosyltransferase  40.78 
 
 
183 aa  154  9e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0786  orotate phosphoribosyltransferase  39.57 
 
 
191 aa  153  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.65909  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2712  orotate phosphoribosyltransferase  43.02 
 
 
190 aa  154  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.766772 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0912  orotate phosphoribosyltransferase  41.71 
 
 
194 aa  154  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0443577  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3518  orotate phosphoribosyltransferase  41.67 
 
 
196 aa  150  8e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3194  orotate phosphoribosyltransferase  41.67 
 
 
196 aa  150  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20632  normal  0.456055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3390  orotate phosphoribosyltransferase  41.67 
 
 
196 aa  149  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1866  orotate phosphoribosyltransferase  40.5 
 
 
202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2869  orotate phosphoribosyltransferase  37.17 
 
 
194 aa  146  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.943845  normal  0.0213162 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1509  orotate phosphoribosyltransferase  39 
 
 
202 aa  145  4.0000000000000006e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2109  orotate phosphoribosyltransferase  41.71 
 
 
202 aa  145  5e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00335386  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0034  orotate phosphoribosyltransferase  40.31 
 
 
196 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0258  orotate phosphoribosyltransferase  39 
 
 
202 aa  143  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0538  orotate phosphoribosyltransferase  37.7 
 
 
206 aa  143  2e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0211  orotate phosphoribosyltransferase  39.59 
 
 
202 aa  142  2e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0704875  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1406  orotate phosphoribosyltransferase  41.54 
 
 
196 aa  142  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.544896  normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0032  orotate phosphoribosyltransferase  39.9 
 
 
196 aa  143  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0215436 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0469  orotate phosphoribosyltransferase  38.22 
 
 
192 aa  141  5e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0397818  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0284  orotate phosphoribosyltransferase  38.5 
 
 
202 aa  140  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0653  orotate phosphoribosyltransferase  38.22 
 
 
192 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364226  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0646  orotate phosphoribosyltransferase  38.22 
 
 
192 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.704446  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0231  orotate phosphoribosyltransferase  38 
 
 
202 aa  139  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1780  orotate phosphoribosyltransferase  38.5 
 
 
202 aa  139  3e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1087  orotate phosphoribosyltransferase  40.91 
 
 
196 aa  137  6e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1574  orotate phosphoribosyltransferase  37.17 
 
 
194 aa  136  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0783619  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2635  orotate phosphoribosyltransferase  37.17 
 
 
192 aa  136  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1343  phosphoribosyltransferase  34.81 
 
 
192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000345754 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0138  orotate phosphoribosyltransferase  35.71 
 
 
199 aa  120  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308683  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3840  phosphoribosyltransferase  31.61 
 
 
216 aa  96.3  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000401087 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0006  orotate phosphoribosyltransferase  34.46 
 
 
198 aa  78.6  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.292815  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4002  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
176 aa  73.9  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00738468  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  29.73 
 
 
187 aa  73.2  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1148  orotate phosphoribosyltransferase  33.1 
 
 
173 aa  72.8  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  33.53 
 
 
182 aa  72  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0425  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6071  orotate phosphoribosyltransferase  30.32 
 
 
175 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  29.61 
 
 
182 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  30.14 
 
 
193 aa  62.8  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.179703 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0532  orotate phosphoribosyltransferase  31.79 
 
 
188 aa  62.4  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0317  orotate phosphoribosyltransferase  32.19 
 
 
169 aa  61.2  0.000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2976  orotate phosphoribosyltransferase  27.89 
 
 
191 aa  60.1  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0690  orotate phosphoribosyltransferase  31.79 
 
 
180 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0841  orotate phosphoribosyltransferase  29.48 
 
 
167 aa  59.3  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.637586 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1469  orotate phosphoribosyltransferase  31.71 
 
 
186 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.980339 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5123  orotate phosphoribosyltransferase  31.69 
 
 
192 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5503  orotate phosphoribosyltransferase  31.69 
 
 
192 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5212  orotate phosphoribosyltransferase  31.69 
 
 
192 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.365992  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0451  orotate phosphoribosyltransferase  28.75 
 
 
213 aa  59.3  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0736  orotate phosphoribosyltransferase  25.33 
 
 
185 aa  58.9  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.555923 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1965  orotate phosphoribosyltransferase  29.33 
 
 
191 aa  58.2  0.00000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6227  orotate phosphoribosyltransferase  26.09 
 
 
215 aa  57.8  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6143  orotate phosphoribosyltransferase  29.71 
 
 
176 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.360288  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0532  orotate phosphoribosyltransferase  30.46 
 
 
180 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00117498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0750  orotate phosphoribosyltransferase  31.13 
 
 
180 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0231  orotate phosphoribosyltransferase  29.07 
 
 
190 aa  57.4  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6419  orotate phosphoribosyltransferase  26.58 
 
 
174 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2484  phosphoribosyltransferase  28.68 
 
 
189 aa  57  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0493331  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5205  orotate phosphoribosyltransferase  28.65 
 
 
187 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4858  orotate phosphoribosyltransferase  26.95 
 
 
187 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1001  orotate phosphoribosyltransferase  32.72 
 
 
170 aa  56.2  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.106165  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>