158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2117 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_2117  cytochrome c class I  100 
 
 
141 aa  285  1e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  1.39618e-11  normal  0.419433 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2352  cytochrome c class I  53.9 
 
 
128 aa  135  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2118  cytochrome c class I  60 
 
 
123 aa  121  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  3.43097e-09  normal  0.41454 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0213  cytochrome c class I  45.65 
 
 
111 aa  117  4e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2464  cytochrome c, class I  44.93 
 
 
112 aa  115  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.182087  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0214  cytochrome c class I  44.52 
 
 
144 aa  114  6e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2463  cytochrome c, class I  43.66 
 
 
140 aa  113  8e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.480155  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0917  cytochrome c-555  43.48 
 
 
111 aa  110  4e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.105307  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2304  cytochrome c class I  47.1 
 
 
107 aa  111  4e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  8.96467e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0103  cytochrome c-555, membrane-bound  44.93 
 
 
140 aa  105  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0151549  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2303  cytochrome c class I  42.86 
 
 
143 aa  102  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  1.65947e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0152  cytochrome c-555  57.5 
 
 
110 aa  102  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  1.10389e-09  normal  0.576701 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2353  cytochrome c class I  54.76 
 
 
101 aa  101  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1443  cytochrome c-555, membrane-bound  43.12 
 
 
116 aa  99.8  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  8.88982e-08  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0146  cytochrome c5  53.75 
 
 
266 aa  95.5  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0153  cytochrome c-555, membrane-bound  52.5 
 
 
131 aa  94.7  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  1.70393e-09  normal  0.590725 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1247  Caa(3)-type oxidase, subunit IV  47.62 
 
 
230 aa  88.2  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0050  cytochrome c class I  43.18 
 
 
232 aa  88.6  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1141  cytochrome c, class I  52.5 
 
 
159 aa  85.9  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.828692  normal  0.616371 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1398  putative cytochrome c-type protein  52.5 
 
 
161 aa  85.9  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0906233  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1062  cytochrome c class I  52.5 
 
 
159 aa  85.9  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0425  cytochrome C, class I  53.09 
 
 
223 aa  85.9  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.501458  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0459  cytochrome c, class I  51.85 
 
 
225 aa  84.7  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0133127  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0605  cytochrome c, class I  45.36 
 
 
216 aa  83.6  8e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00227735  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0183  cellulose binding, type IV  53.09 
 
 
134 aa  80.9  5e-15  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.314607  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0205  cytochrome c, class I  50.63 
 
 
185 aa  80.5  7e-15  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.641753  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0461  cytochrome c, class I  45.26 
 
 
137 aa  80.5  8e-15  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.943206  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4918  putative cytochrome c family protein  47.5 
 
 
137 aa  79  2e-14  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.840892  hitchhiker  0.00914524 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2318  cytochrome c family protein  45 
 
 
164 aa  78.2  4e-14  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0138  cytochrome c, class I  38.94 
 
 
302 aa  77.8  4e-14  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0150  cytochrome c class I  38.94 
 
 
302 aa  78.2  4e-14  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2262  cytochrome c family protein  45 
 
 
164 aa  77.8  5e-14  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2122  cytochrome c family protein  45 
 
 
164 aa  77.8  5e-14  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2067  cytochrome c family protein  45 
 
 
164 aa  77.8  5e-14  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.272994  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0033  cytochrome c, class I  38.41 
 
 
167 aa  77.4  6e-14  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.198707  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0988  cytochrome c family protein  43.75 
 
 
164 aa  77  7e-14  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.219411  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3876  cytochrome c class I  45.45 
 
 
300 aa  77  8e-14  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0164  cytochrome c class I  38.05 
 
 
295 aa  76.6  1e-13  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0151  cytochrome c, class I  38.05 
 
 
295 aa  76.6  1e-13  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0147  cytochrome c class I  38.05 
 
 
297 aa  76.3  1e-13  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.206313  normal  0.547254 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2904  cytochrome c, class I  38.05 
 
 
295 aa  76.6  1e-13  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3091  cytochrome c class I  41.56 
 
 
273 aa  75.5  2e-13  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.994793  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0061  cytochrome c family protein  44.32 
 
 
298 aa  75.9  2e-13  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2000  cytochrome c, class I  36.84 
 
 
192 aa  75.5  2e-13  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0804521  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3330  cytochrome c, class I  37.17 
 
 
296 aa  75.1  3e-13  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606623  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4834  cytochrome c class I  45.65 
 
 
202 aa  74.7  4e-13  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.62683  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3197  cytochrome c, class I  44.44 
 
 
128 aa  74.3  5e-13  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.657316  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0996  cytochrome c class I  45.45 
 
 
103 aa  74.3  5e-13  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2999  cytochrome c class I  41.84 
 
 
319 aa  73.9  6e-13  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0221845 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1307  cytochrome c class I  45.78 
 
 
174 aa  73.2  1e-12  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.466199 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0654  cytochrome c class I  43.04 
 
 
148 aa  72.8  1e-12  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3859  cytochrome c5  44.44 
 
 
206 aa  73.2  1e-12  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  7.64521e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0208  cytochrome c, class I  43.02 
 
 
180 aa  72  2e-12  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3918  cytochrome c5  41.94 
 
 
299 aa  72  2e-12  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00486957  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0263  cytochrome c, class I  48.1 
 
 
293 aa  72.4  2e-12  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1534  cytochrome c family protein  41.94 
 
 
299 aa  72  3e-12  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3068  cytochrome c family protein  41.94 
 
 
275 aa  71.6  3e-12  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3990  cytochrome c family protein  41.94 
 
 
299 aa  72  3e-12  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4058  cytochrome c class I  44.44 
 
 
140 aa  71.6  3e-12  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.435905  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3302  cytochrome c family protein  41.94 
 
 
299 aa  72  3e-12  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.933009  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0250  cytochrome c class I  43.37 
 
 
148 aa  72  3e-12  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  2.96226e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4130  cytochrome c class I  38.71 
 
 
350 aa  72  3e-12  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4170  cytochrome c class I  44.44 
 
 
140 aa  71.6  3e-12  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3003  cytochrome c family protein  41.94 
 
 
299 aa  72  3e-12  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0120  cytochrome c family protein  41.94 
 
 
299 aa  72  3e-12  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.830572  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0170  cytochrome c, class I  39.24 
 
 
145 aa  71.2  4e-12  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4983  cytochrome c, class I  39.56 
 
 
183 aa  70.9  5e-12  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2963  hypothetical protein  39.47 
 
 
537 aa  70.9  5e-12  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2812  hypothetical protein  39.47 
 
 
537 aa  70.9  6e-12  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02091  lipoprotein  43.21 
 
 
135 aa  70.5  8e-12  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001977  cytochrome c5  44.16 
 
 
137 aa  69.7  1e-11  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  3.75428e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3261  cytochrome c family protein  40.86 
 
 
300 aa  69.3  1e-11  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3084  hypothetical protein  37.38 
 
 
294 aa  69.3  2e-11  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4658  cytochrome c, class I  46.05 
 
 
97 aa  68.9  2e-11  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000774786 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2059  diheme cytochrome c SoxD  39.56 
 
 
382 aa  68.9  2e-11  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  1.73988e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3650  cytochrome c class I  33.33 
 
 
112 aa  69.3  2e-11  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3542  putative cytochrome  43.02 
 
 
181 aa  68.6  3e-11  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.510228  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0029  cytochrome c class I  35.78 
 
 
163 aa  67.8  4e-11  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00298904  hitchhiker  7.95968e-06 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0315  cytochrome c class I  38.46 
 
 
179 aa  67.4  6e-11  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.326458  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0320  cytochrome c, class I  38.46 
 
 
180 aa  67.4  6e-11  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.388168 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0385  cytochrome c, class I  34.62 
 
 
299 aa  67  8e-11  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3020  cytochrome c class I  35.78 
 
 
298 aa  67  8e-11  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3367  cytochrome c class I  35.78 
 
 
297 aa  67  8e-11  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0200  cytochrome c class I  41.03 
 
 
172 aa  65.1  3e-10  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.657824  normal  0.710005 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00484  cb-type cytochrome oxidase subunit III  44.74 
 
 
131 aa  65.5  3e-10  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03815  cytochrome C5  42.31 
 
 
153 aa  64.7  5e-10  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4286  cytochrome c, class I  43.42 
 
 
97 aa  63.5  8e-10  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  4.19984e-05 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0216  cytochrome c class I  42.11 
 
 
97 aa  63.2  1e-09  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0309264  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0233  cytochrome c, class I  39.02 
 
 
171 aa  63.2  1e-09  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0215738  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0336  cytochrome c, class I  44 
 
 
288 aa  63.2  1e-09  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.358353 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2556  cytochrome c5  41.03 
 
 
135 aa  62.8  2e-09  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  7.40682e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0149  cytochrome c class I  40.45 
 
 
287 aa  62.4  2e-09  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481052  normal  0.118184 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0498  cytochrome c class I  37.21 
 
 
180 aa  62  3e-09  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3473  cytochrome c, class I  40.91 
 
 
294 aa  62  3e-09  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0840  putative cytochrome c5  36.05 
 
 
157 aa  61.2  5e-09  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.674138  normal  0.844917 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3568  cytochrome c, class I  36.17 
 
 
97 aa  61.2  5e-09  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.199847  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0213  hypothetical protein  37.8 
 
 
173 aa  60.8  6e-09  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  4.12444e-05  hitchhiker  0.00201322 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0184  cytochrome c, class I  37.5 
 
 
220 aa  60.5  8e-09  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69970  cytochrome c5  37.97 
 
 
136 aa  59.7  1e-08  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6074  cytochrome c5  37.97 
 
 
142 aa  59.7  1e-08  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>