More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2112 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 
117 aa  234  3e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  2.10725e-11  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  78.26 
 
 
118 aa  196  1e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2458  protein translocase subunit yajC  76.92 
 
 
117 aa  194  2e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107187  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2348  preprotein translocase, YajC subunit  77.12 
 
 
118 aa  188  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0108  hypothetical protein  74.58 
 
 
118 aa  186  8e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  75.86 
 
 
118 aa  186  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0219  preprotein translocase, YajC subunit  71.19 
 
 
118 aa  181  2e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.780199  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  53.06 
 
 
102 aa  110  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0682  preprotein translocase, YajC subunit  45.54 
 
 
137 aa  96.7  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  42.45 
 
 
106 aa  91.7  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  44.9 
 
 
106 aa  91.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  45.74 
 
 
103 aa  90.9  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2517  preprotein translocase subunit YajC  48.75 
 
 
91 aa  90.5  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0931  preprotein translocase subunit YajC  48.75 
 
 
90 aa  89.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  52.38 
 
 
106 aa  89.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1403  preprotein translocase, YajC subunit  53.25 
 
 
109 aa  87  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0149317 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  48.81 
 
 
106 aa  86.7  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  39.58 
 
 
143 aa  86.7  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  9.2041e-07  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_002950  PG0485  preprotein translocase, YajC subunit  41.23 
 
 
112 aa  85.9  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  47.62 
 
 
105 aa  85.1  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  41.18 
 
 
123 aa  84.7  4e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1008  preprotein translocase, YajC subunit  46.84 
 
 
125 aa  82.8  1e-15  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.868301  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2443  protein translocase subunit yajC  45.45 
 
 
101 aa  82  3e-15  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0348045  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  41.67 
 
 
112 aa  80.9  5e-15  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  2.20066e-05 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  41.18 
 
 
143 aa  80.9  5e-15  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0394  preprotein translocase, YajC subunit  37.17 
 
 
126 aa  80.5  7e-15  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.918235  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  43.9 
 
 
111 aa  79  2e-14  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0680  preprotein translocase, YajC subunit  42.42 
 
 
118 aa  79  2e-14  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0730138  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  44.71 
 
 
107 aa  78.2  3e-14  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3465  preprotein translocase, YajC subunit  39 
 
 
114 aa  78.2  3e-14  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113386  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1348  preprotein translocase, YajC subunit  35.11 
 
 
123 aa  78.2  4e-14  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4501  preprotein translocase subunit YajC  44.32 
 
 
86 aa  77.8  5e-14  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  9.06179e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4550  preprotein translocase subunit YajC  44.32 
 
 
86 aa  77.8  5e-14  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  4.37166e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3133  preprotein translocase subunit YajC  43.53 
 
 
86 aa  77.4  6e-14  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  42.86 
 
 
107 aa  77.4  6e-14  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0416  preprotein translocase subunit YajC  38.38 
 
 
150 aa  77.4  6e-14  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4311  preprotein translocase subunit YajC  43.53 
 
 
86 aa  77  8e-14  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  1.02118e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4149  preprotein translocase subunit YajC  43.53 
 
 
86 aa  77  8e-14  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.25836e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4646  preprotein translocase subunit YajC  43.53 
 
 
86 aa  77  8e-14  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00688005  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4496  preprotein translocase subunit YajC  43.53 
 
 
86 aa  77  8e-14  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.82906e-05 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  42.53 
 
 
113 aa  76.3  1e-13  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  42.86 
 
 
109 aa  76.6  1e-13  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  45.12 
 
 
93 aa  76.6  1e-13  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  36.27 
 
 
168 aa  76.3  1e-13  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2490  preprotein translocase, YajC subunit  38.82 
 
 
111 aa  76.3  1e-13  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  42.86 
 
 
110 aa  76.6  1e-13  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1817  protein translocase subunit yajC  48.44 
 
 
119 aa  75.9  2e-13  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0910437  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4160  preprotein translocase subunit YajC  43.18 
 
 
86 aa  75.9  2e-13  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.52675e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1274  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 
95 aa  75.9  2e-13  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  43.21 
 
 
91 aa  75.1  3e-13  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  40.24 
 
 
110 aa  75.1  3e-13  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  47.5 
 
 
111 aa  75.1  3e-13  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  40.24 
 
 
110 aa  75.1  3e-13  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0700  preprotein translocase subunit YajC  41.18 
 
 
86 aa  75.5  3e-13  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  3.10911e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0542  preprotein translocase, YajC subunit  44.05 
 
 
133 aa  74.7  3e-13  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0292946 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4535  preprotein translocase subunit YajC  42.35 
 
 
86 aa  75.1  3e-13  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  8.52882e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4263  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 
86 aa  74.7  4e-13  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  2.29584e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  34.41 
 
 
111 aa  74.7  4e-13  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  36.26 
 
 
108 aa  74.7  4e-13  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  45.12 
 
 
108 aa  73.6  8e-13  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  45.12 
 
 
108 aa  73.6  8e-13  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  43.75 
 
 
94 aa  73.6  9e-13  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  37.23 
 
 
107 aa  72.8  1e-12  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  37.23 
 
 
107 aa  72.8  1e-12  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12280  preprotein translocase, YajC subunit  40.7 
 
 
91 aa  73.2  1e-12  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.07658e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  37.23 
 
 
107 aa  72.8  1e-12  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  37.23 
 
 
107 aa  72.8  1e-12  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  37.23 
 
 
107 aa  72.8  1e-12  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4308  preprotein translocase, YajC subunit  42.53 
 
 
115 aa  73.6  1e-12  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0530  protein translocase subunit yajC  35.64 
 
 
154 aa  72.8  1e-12  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  37.23 
 
 
107 aa  72.8  1e-12  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  37.23 
 
 
107 aa  73.2  1e-12  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  42.39 
 
 
113 aa  72.8  1e-12  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  37.76 
 
 
121 aa  72.4  2e-12  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  39 
 
 
110 aa  72  2e-12  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  44.05 
 
 
105 aa  71.6  3e-12  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  40.45 
 
 
108 aa  71.6  3e-12  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2701  preprotein translocase subunit YajC  33.68 
 
 
110 aa  71.2  4e-12  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00115009  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  37.8 
 
 
109 aa  71.2  4e-12  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  35.56 
 
 
109 aa  70.9  5e-12  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  40.48 
 
 
91 aa  70.9  5e-12  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4748  preprotein translocase, YajC subunit  37.36 
 
 
110 aa  70.9  6e-12  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0608539 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  36.9 
 
 
108 aa  70.9  6e-12  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4599  preprotein translocase, YajC subunit  34 
 
 
110 aa  70.5  8e-12  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0858963  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  36.7 
 
 
144 aa  70.5  8e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6327  preprotein translocase, YajC subunit  43.88 
 
 
108 aa  70.5  8e-12  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4229  preprotein translocase, YajC subunit  34 
 
 
110 aa  70.5  8e-12  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0477  preprotein translocase subunit YajC  42.86 
 
 
90 aa  70.5  8e-12  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3621  preprotein translocase, YajC subunit  39.76 
 
 
118 aa  70.1  9e-12  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.52664e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2275  preprotein translocase, YajC subunit  39.51 
 
 
110 aa  70.1  9e-12  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300335  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1322  preprotein translocase, YajC subunit  37.86 
 
 
116 aa  70.1  9e-12  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  35.71 
 
 
108 aa  69.3  1e-11  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  43.59 
 
 
109 aa  69.7  1e-11  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  35.71 
 
 
108 aa  69.3  1e-11  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  35.71 
 
 
108 aa  69.3  1e-11  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  35.71 
 
 
108 aa  69.3  1e-11  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  35.71 
 
 
108 aa  69.3  1e-11  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0727  preprotein translocase subunit YajC  41.49 
 
 
93 aa  70.1  1e-11  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0798345  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12913  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 
97 aa  70.1  1e-11  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.168019  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  36.59 
 
 
108 aa  69.7  1e-11  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>