113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2096 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0890  filamentation induced by cAMP protein Fic  75.69 
 
 		 555 aa  749    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0367824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2096  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 		 479 aa  979    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1039  filamentation induced by cAMP protein Fic  49.56 
 
 		 516 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1534  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.93 
 
 		 537 aa  368  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0431591 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6486  filamentation induced by cAMP protein Fic  46.6 
 
 		 514 aa  354  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.761112 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0908  hypothetical protein  38.57 
 
 		 503 aa  300  5e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.207571  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0597  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.71 
 
 		 512 aa  292  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1647  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.7 
 
 		 502 aa  292  1e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.887162  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1736  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.34 
 
 		 502 aa  281  3e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00739697  normal  0.272754 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0910  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.06 
 
 		 564 aa  257  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.555407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4531  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.04 
 
 		 514 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.139108 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49750  filamentation induced by cAMP protein  31.26 
 
 		 509 aa  193  7e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1561  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.49 
 
 		 536 aa  190  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7027  putative filamentation induced by cAMP protein Fic  29.23 
 
 		 537 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0276  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.12 
 
 		 498 aa  187  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0353  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.24 
 
 		 495 aa  186  8e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2191  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.74 
 
 		 508 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0424  hypothetical protein  31.8 
 
 		 512 aa  177  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00863334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2182  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.18 
 
 		 513 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108003  normal  0.0333314 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2025  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.35 
 
 		 507 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.509627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1899  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.32 
 
 		 511 aa  171  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.669104  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2478  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.36 
 
 		 526 aa  167  4e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.321663  normal  0.723541 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0051  hypothetical protein  28.85 
 
 		 519 aa  167  5e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2666  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.38 
 
 		 496 aa  164  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.939916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6074  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.94 
 
 		 544 aa  161  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2022  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.97 
 
 		 505 aa  146  9e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.486943 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22590  hypothetical protein  27.49 
 
 		 429 aa  64.7  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0601  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.72 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0593  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.72 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1798  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.2 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000000635308  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3761  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.19 
 
 		 430 aa  57  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.651271  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0607  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.87 
 
 		 412 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4488  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.25 
 
 		 380 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4188  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.14 
 
 		 381 aa  55.1  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.635354  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0044  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.56 
 
 		 419 aa  55.1  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.203132 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1635  filamentation induced by cAMP protein Fic  30 
 
 		 326 aa  53.9  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05510  hypothetical protein  32.71 
 
 		 394 aa  53.9  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2194  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.68 
 
 		 400 aa  53.9  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3490  Fic family protein  38.03 
 
 		 376 aa  52.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0823  Fic family protein  38.03 
 
 		 389 aa  52.8  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3619  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.03 
 
 		 376 aa  52.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0471  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 		 393 aa  52.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.586751  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2545  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.48 
 
 		 247 aa  51.6  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.992105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2494  hypothetical protein  30.15 
 
 		 342 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2529  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.94 
 
 		 402 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4817  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.85 
 
 		 379 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25050  hypothetical protein  32.39 
 
 		 397 aa  50.4  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3019  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.69 
 
 		 403 aa  50.8  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0523  Fic family protein  37.18 
 
 		 376 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5004  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.8 
 
 		 381 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1773  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.37 
 
 		 318 aa  49.3  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0104845 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3792  hypothetical protein  35 
 
 		 365 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3926  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.92 
 
 		 500 aa  50.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.118695  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3261  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.25 
 
 		 502 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.464971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0980  hypothetical protein  32.93 
 
 		 367 aa  48.9  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0812833  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1441  hypothetical protein  52.27 
 
 		 367 aa  48.9  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4178  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.2 
 
 		 368 aa  48.5  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.130851  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07450  hypothetical protein  34.15 
 
 		 373 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000039973  normal  0.18978 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3863  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.85 
 
 		 334 aa  48.9  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0343511 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4789  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.67 
 
 		 282 aa  49.3  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5504  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.79 
 
 		 394 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0732622  normal  0.099278 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4148  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.53 
 
 		 359 aa  48.5  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0154  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.17 
 
 		 393 aa  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0242065 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1095  filamentation induced by cAMP protein (Fic) family protein  30.34 
 
 		 374 aa  48.1  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.298399  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0010  hypothetical protein  31.25 
 
 		 383 aa  47.8  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0937  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.48 
 
 		 368 aa  48.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3251  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.14 
 
 		 393 aa  47.8  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0798212  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2152  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.37 
 
 		 374 aa  47.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164511  normal  0.297035 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0828  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.14 
 
 		 509 aa  47.8  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0673  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.46 
 
 		 398 aa  47.4  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.974543  normal  0.0892383 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1955  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.17 
 
 		 333 aa  47.4  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.484154  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3797  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.73 
 
 		 371 aa  47.4  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117208 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42040  hypothetical protein  30.87 
 
 		 386 aa  47.4  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3472  filamentation induced by cAMP protein Fic  25 
 
 		 333 aa  47  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0903  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.8 
 
 		 347 aa  47  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000226959 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3058  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.18 
 
 		 541 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3843  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.95 
 
 		 368 aa  46.2  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33230  hypothetical protein  38.81 
 
 		 408 aa  46.6  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1106  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.69 
 
 		 533 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1770  filamentation induced by cAMP protein Fic  57.89 
 
 		 370 aa  46.2  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.385293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1058  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.57 
 
 		 529 aa  46.2  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0168  Fic family protein  28.26 
 
 		 388 aa  45.8  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2288  hypothetical protein  42.86 
 
 		 502 aa  45.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1856  Fis family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 328 aa  45.8  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0723  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.85 
 
 		 373 aa  45.8  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.43274  hitchhiker  0.00000454462 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0677  hypothetical protein  46.34 
 
 		 373 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00227082  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5477  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.86 
 
 		 367 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0227  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.76 
 
 		 376 aa  44.7  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424748  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2962  filamentation induced by cAMP protein Fic  34 
 
 		 375 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0625  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.14 
 
 		 392 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.849792  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0037  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.14 
 
 		 392 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.450631  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22980  hypothetical protein  29.1 
 
 		 406 aa  45.1  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2641  Fic family protein  24.87 
 
 		 328 aa  44.3  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1350  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.36 
 
 		 443 aa  44.7  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.470357 
 
 
-
 
NC_002978  WD0346  Fic family protein  23.14 
 
 		 360 aa  44.3  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.361104  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3924  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.36 
 
 		 391 aa  44.3  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2357  filamentation induced by cAMP protein Fic  48.84 
 
 		 371 aa  44.3  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3069  filamentation induced by cAMP protein Fic  45.24 
 
 		 309 aa  43.9  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4190  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.48 
 
 		 367 aa  43.9  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4575  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.37 
 
 		 377 aa  43.9  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.76172  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>