More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2065 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_2065  30S ribosomal protein S10  100 
 
 
103 aa  208  2e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000262077  normal  0.381336 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1852  30S ribosomal protein S10  96.12 
 
 
103 aa  204  5e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00631354  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0288  30S ribosomal protein S10  95.15 
 
 
103 aa  201  2e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.42125  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0179  30S ribosomal protein S10  94.17 
 
 
103 aa  201  3e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000562136  normal  0.948551 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2230  30S ribosomal protein S10  93.2 
 
 
103 aa  200  7e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000010339  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2424  30S ribosomal protein S10  93.2 
 
 
103 aa  199  7e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0052526  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2297  30S ribosomal protein S10  96.12 
 
 
102 aa  197  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238807  hitchhiker  0.00325794 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1146  30S ribosomal protein S10  67.65 
 
 
103 aa  141  3e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00144145  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05710  30S ribosomal protein S10  68 
 
 
101 aa  139  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.751469  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0841  ribosomal protein S10  68.37 
 
 
102 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4342  30S ribosomal protein S10  65 
 
 
101 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0589307  normal  0.109776 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5570  ribosomal protein S10  66 
 
 
101 aa  138  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.966668  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1939  30S ribosomal protein S10  67 
 
 
101 aa  137  7e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0124  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 
101 aa  136  1e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0476  ribosomal protein S10  62 
 
 
108 aa  136  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3163  30S ribosomal protein S10  62 
 
 
101 aa  134  4e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.547346 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0398  30S ribosomal protein S10  67 
 
 
101 aa  134  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0598  ribosomal protein S10  62 
 
 
101 aa  132  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945265  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0214  ribosomal protein S10  59.18 
 
 
102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114911  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01160  ribosomal protein S10  59.8 
 
 
103 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000349687  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2461  30S ribosomal protein S10  56 
 
 
102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.043315 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0285  ribosomal protein S10  59.6 
 
 
102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0119984  hitchhiker  0.00531479 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1614  ribosomal protein S10  59.41 
 
 
101 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1554  30S ribosomal protein S10  61.76 
 
 
103 aa  131  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000633059  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0421  30S ribosomal protein S10  59.18 
 
 
102 aa  131  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238297  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0224  ribosomal protein S10  57.58 
 
 
102 aa  130  5e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0193  SSU ribosomal protein S10P  58.82 
 
 
103 aa  130  6e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000113928  normal  0.060255 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1525  ribosomal protein S10  59 
 
 
102 aa  130  6.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.651999  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0720  30S ribosomal protein S10  59 
 
 
105 aa  130  7.999999999999999e-30  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0939005  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3796  30S ribosomal protein S10  55.88 
 
 
104 aa  130  9e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000453996  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0290  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 
102 aa  129  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153979  unclonable  7.221610000000001e-29 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1484  30S ribosomal protein S10  62 
 
 
102 aa  129  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000272811  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0048  30S ribosomal protein S10  58.59 
 
 
105 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0255  30S ribosomal protein S10  54.9 
 
 
104 aa  127  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000004332  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4916  30S ribosomal protein S10  54.9 
 
 
104 aa  127  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175164  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0707  30S ribosomal protein S10  58.59 
 
 
105 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.282417  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0195  30S ribosomal protein S10  60 
 
 
102 aa  128  3e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00451174  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0202  30S ribosomal protein S10  54.9 
 
 
104 aa  127  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253656  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1933  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 
101 aa  127  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1911  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 
101 aa  127  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.253834 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1946  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 
101 aa  127  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2018  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 
101 aa  127  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3444  30S ribosomal protein S10  55.56 
 
 
103 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.000018475  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0305  30S ribosomal protein S10  58.16 
 
 
102 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170298 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2066  30S ribosomal protein S10  61.86 
 
 
105 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000145478  normal  0.204549 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0078  30S ribosomal protein S10  60.82 
 
 
105 aa  127  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0955651 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1419  ribosomal protein S10  58 
 
 
117 aa  126  9.000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3747  30S ribosomal protein S10  55.56 
 
 
103 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016598  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3805  30S ribosomal protein S10  55.56 
 
 
103 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00677019  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2633  30S ribosomal protein S10  55.56 
 
 
103 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000272648  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1286  30S ribosomal protein S10  57.58 
 
 
105 aa  126  9.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00174582  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3777  30S ribosomal protein S10  55.56 
 
 
103 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000424797  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3446  30S ribosomal protein S10  55.56 
 
 
103 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122515  normal  0.0314834 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0663  30S ribosomal protein S10  57.58 
 
 
105 aa  126  9.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1923  30S ribosomal protein S10  55.56 
 
 
103 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000013045  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3069  30S ribosomal protein S10  55.56 
 
 
103 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000998747  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0275  30S ribosomal protein S10  55.56 
 
 
103 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000312385  normal  0.114579 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3477  30S ribosomal protein S10  55.56 
 
 
103 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000483294  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2760  30S ribosomal protein S10  55.56 
 
 
103 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000915461  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3170  30S ribosomal protein S10  55.56 
 
 
103 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000357931  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2334  ribosomal protein S10  54.9 
 
 
103 aa  126  9.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000521962  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0266  30S ribosomal protein S10  55.56 
 
 
103 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00303963  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0326  30S ribosomal protein S10  55.56 
 
 
103 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00113902  normal  0.0302801 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0248  30S ribosomal protein S10  55.56 
 
 
103 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127153  normal  0.202124 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0347  30S ribosomal protein S10  55.56 
 
 
103 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0012099  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0846  SSU ribosomal protein S10P  58.82 
 
 
103 aa  126  9.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000264723  decreased coverage  0.00000947215 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3020  30S ribosomal protein S10  54.9 
 
 
104 aa  125  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000044729  hitchhiker  0.00550197 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1163  ribosomal protein S10  57.14 
 
 
102 aa  126  1.0000000000000001e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000940072  hitchhiker  0.000000509949 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0390  30S ribosomal protein S10  55.56 
 
 
103 aa  126  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000705562  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0866  30S ribosomal protein S10  57.58 
 
 
102 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000610931  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1535  30S ribosomal protein S10  56 
 
 
104 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3181  30S ribosomal protein S10  56.12 
 
 
102 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000486821  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0404  30S ribosomal protein S10  55.56 
 
 
102 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000016581  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1363  30S ribosomal protein S10  58.16 
 
 
102 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.562313 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0932  30S ribosomal protein S10  61.22 
 
 
102 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0025936  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0766  30S ribosomal protein S10  57.14 
 
 
102 aa  125  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.300244  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2294  30S ribosomal protein S10  58.16 
 
 
102 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3449  30S ribosomal protein S10  58.16 
 
 
102 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.852431 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3329  30S ribosomal protein S10  61.22 
 
 
102 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000189761 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0337  30S ribosomal protein S10  55.56 
 
 
103 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012954  decreased coverage  0.000295628 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3185  30S ribosomal protein S10  58.16 
 
 
102 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.887844  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1544  30S ribosomal protein S10  58.16 
 
 
102 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3323  30S ribosomal protein S10  56.12 
 
 
102 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.434875  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0272  30S ribosomal protein S10  55.56 
 
 
103 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.0000000000156586  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5071  30S ribosomal protein S10  58.16 
 
 
102 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.755306 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0277  30S ribosomal protein S10  55.56 
 
 
103 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0000127009  decreased coverage  0.000000000926134 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3668  30S ribosomal protein S10  58.16 
 
 
102 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1560  30S ribosomal protein S10  56 
 
 
104 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0613138  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16250  SSU ribosomal protein S10P  57 
 
 
107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00216069  hitchhiker  0.00000702102 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2858  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 
102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800784  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4006  ribosomal protein S10  57.14 
 
 
102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0232097  normal  0.70609 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16301  30S ribosomal protein S10  58 
 
 
106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1766  30S ribosomal protein S10  59.79 
 
 
105 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00000557802  normal  0.938375 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2689  30S ribosomal protein S10  57.14 
 
 
102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.283235  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1947  30S ribosomal protein S10  58.16 
 
 
102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04522  30S ribosomal protein S10  53.92 
 
 
104 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000034971  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0985  30S ribosomal protein S10  57.14 
 
 
102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547253  normal  0.0405609 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0687  30S ribosomal protein S10  59.18 
 
 
102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1839  30S ribosomal protein S10  57.14 
 
 
102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.051766  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0679  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 
102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>