More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2063 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_2063  50S ribosomal protein L4  100 
 
 
208 aa  424  1e-118  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000340203  normal  0.385687 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2295  50S ribosomal protein L4  74.04 
 
 
208 aa  315  3e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0333756  hitchhiker  0.00351228 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0181  50S ribosomal protein L4  70.05 
 
 
208 aa  311  3.9999999999999997e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000196789  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2228  50S ribosomal protein L4  69.57 
 
 
208 aa  305  2.0000000000000002e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169782  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1850  50S ribosomal protein L4  69.08 
 
 
208 aa  302  2.0000000000000002e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264817  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2422  50S ribosomal protein L4  68.12 
 
 
208 aa  301  4.0000000000000003e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00578828  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0290  50S ribosomal protein L4  69.57 
 
 
212 aa  296  1e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0603  ribosomal protein L4/L1e  49.04 
 
 
209 aa  216  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0396  50S ribosomal protein L4  48.56 
 
 
209 aa  207  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0843  ribosomal protein L4/L1e  48.79 
 
 
214 aa  202  3e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1937  50S ribosomal protein L4  46.86 
 
 
209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1148  50S ribosomal protein L4  45.89 
 
 
209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000671055  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1616  ribosomal protein L4/L1e  45.89 
 
 
212 aa  195  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05720  50S ribosomal protein L4  45.19 
 
 
208 aa  195  4.0000000000000005e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.316206  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4344  50S ribosomal protein L4  45.41 
 
 
209 aa  191  9e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000409516  normal  0.126717 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3161  50S ribosomal protein L4  46.38 
 
 
208 aa  189  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  45.63 
 
 
206 aa  185  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0196  50S ribosomal protein L4  44.44 
 
 
210 aa  182  2.0000000000000003e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.371225 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  46.04 
 
 
207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  44.93 
 
 
207 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  44.93 
 
 
207 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  44.93 
 
 
207 aa  177  8e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  44.93 
 
 
207 aa  177  8e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  44.93 
 
 
207 aa  177  8e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  44.93 
 
 
207 aa  177  8e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  44.93 
 
 
207 aa  177  8e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  44.93 
 
 
207 aa  177  8e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  44.93 
 
 
207 aa  177  8e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  44.93 
 
 
207 aa  177  8e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  44.93 
 
 
207 aa  177  8e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  46.04 
 
 
207 aa  176  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  44.44 
 
 
207 aa  176  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  42.03 
 
 
208 aa  174  7e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  45.1 
 
 
206 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5786  ribosomal protein L4/L1e  41.18 
 
 
209 aa  171  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.116422 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  42.03 
 
 
208 aa  171  5.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000879055  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  43.07 
 
 
207 aa  171  5.999999999999999e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  0.0000000146284 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  44.12 
 
 
206 aa  169  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  43.96 
 
 
207 aa  168  5e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  45.1 
 
 
206 aa  168  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  42.16 
 
 
204 aa  168  6e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  42.72 
 
 
207 aa  167  1e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  43.63 
 
 
207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  46.04 
 
 
206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  41.67 
 
 
204 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2401  50S ribosomal protein L4  42.71 
 
 
208 aa  165  5e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  45.05 
 
 
209 aa  165  5.9999999999999996e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl124  50S ribosomal protein L4  42.58 
 
 
208 aa  164  5.9999999999999996e-40  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000604234  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1764  50S ribosomal protein L4  43.41 
 
 
206 aa  164  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00135584  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2064  50S ribosomal protein L4  41.46 
 
 
206 aa  164  6.9999999999999995e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000384651  normal  0.231159 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  42.86 
 
 
207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  41.46 
 
 
207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  41.06 
 
 
207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  41.75 
 
 
207 aa  162  3e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000335339  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1347  50S ribosomal protein L4  42.27 
 
 
206 aa  161  5.0000000000000005e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  42.23 
 
 
207 aa  161  8.000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0768  50S ribosomal protein L4  41.46 
 
 
211 aa  160  9e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000241518  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  41.75 
 
 
207 aa  159  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0695  50S ribosomal protein L4  40.19 
 
 
208 aa  159  4e-38  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  42.08 
 
 
207 aa  158  5e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000566858  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0702  50S ribosomal protein L4  42.86 
 
 
206 aa  158  7e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000569503  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3011  50S ribosomal protein L4  44.12 
 
 
212 aa  158  7e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00787083 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  41.18 
 
 
207 aa  157  8e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  41.18 
 
 
207 aa  157  8e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2256  50S ribosomal protein L4  40.49 
 
 
206 aa  157  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000129639  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  41.21 
 
 
207 aa  156  2e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000984788  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17391  50S ribosomal protein L4  44.02 
 
 
210 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2560  50S ribosomal protein L4/L1e  43.75 
 
 
210 aa  156  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0559575  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  43.94 
 
 
207 aa  156  3e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000475036  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  40.29 
 
 
205 aa  155  6e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000472593  unclonable  1.9716100000000001e-28 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17481  50S ribosomal protein L4  44.5 
 
 
210 aa  154  7e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.533381  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0963  ribosomal protein L4/L1e  44.27 
 
 
207 aa  154  8e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000403747  hitchhiker  0.0000000000267396 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17641  50S ribosomal protein L4  44.02 
 
 
210 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  44.17 
 
 
208 aa  153  1e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2856  50S ribosomal protein L4  42.19 
 
 
207 aa  153  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400345  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1649  50S ribosomal protein L4  45.05 
 
 
210 aa  153  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3704  50S ribosomal protein L4  46.08 
 
 
210 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4004  ribosomal protein L4/L1e  41.83 
 
 
215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.070535  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0290  ribosomal protein L4/L1e  37.98 
 
 
208 aa  152  4e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00437959  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3327  50S ribosomal protein L4  41.75 
 
 
207 aa  152  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.78315e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0934  50S ribosomal protein L4  41.75 
 
 
207 aa  152  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000521211  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0080  50S ribosomal protein L4  41.46 
 
 
206 aa  151  5e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.186923 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1137  50S ribosomal protein L4  38.01 
 
 
223 aa  150  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000824266  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0661  50S ribosomal protein L4  40.1 
 
 
210 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000586581  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  41.55 
 
 
209 aa  149  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0490  50S ribosomal protein L4  40.29 
 
 
209 aa  149  3e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.789827  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  38.71 
 
 
221 aa  149  4e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000111144  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  38.65 
 
 
207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10010  LSU ribosomal protein L4P  42.86 
 
 
207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000045126  hitchhiker  0.00000000148432 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5125  ribosomal protein L4/L1e  43.72 
 
 
223 aa  146  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0681  50S ribosomal protein L4  38.54 
 
 
207 aa  146  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.486374  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2773  50S ribosomal protein L4  41.18 
 
 
206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0187174  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2645  50S ribosomal protein L4  41.38 
 
 
222 aa  145  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264538  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23031  50S ribosomal protein L4  41.55 
 
 
211 aa  144  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1293  50S ribosomal protein L4  40.7 
 
 
210 aa  144  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000205733  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0692  50S ribosomal protein L4  40.87 
 
 
210 aa  144  9e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000477042  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0627  50S ribosomal protein L4  40.84 
 
 
220 aa  143  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000530014  hitchhiker  0.00000000000031805 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0563  50S ribosomal protein L4/L1e  40.59 
 
 
216 aa  144  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16771  50S ribosomal protein L4  40.69 
 
 
211 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20021  50S ribosomal protein L4  42.16 
 
 
212 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>